RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508595.5

RPL9-208, Transcript of ribosomal protein L9, human

TSL 3

Gene RPL9, Length 667 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPL9-208	ENST00000508595	RRP12	Q5JTH9	1297 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RPL9-208	ENST00000508595	LY6G5C	Q5SRR4	150 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPL9-208	ENST00000508595	AFMID	Q63HM1	303 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPL9-208	ENST00000508595	LRRC55	Q6ZSA7	311 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPL9-208	ENST00000508595	SPATA31D4	Q6ZUB0	917 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPL9-208	ENST00000508595	MRGPRE	Q86SM8	312 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPL9-208	ENST00000508595	SYT12	Q8IV01	421 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPL9-208	ENST00000508595	AMER2	Q8N7J2	671 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPL9-208	ENST00000508595	PPM1N	Q8N819	430 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPL9-208	ENST00000508595	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	4.97	□□□□□ -1.61
RPL9-208	ENST00000508595	STON2	Q8WXE9	905 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPL9-208	ENST00000508595	LENG9	Q96B70	501 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPL9-208	ENST00000508595	MENT	Q9BUN1	341 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPL9-208	ENST00000508595	SLC46A2	Q9BY10	475 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPL9-208	ENST00000508595	TMEM140	Q9NV12	185 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPL9-208	ENST00000508595	MKS1	Q9NXB0	559 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPL9-208	ENST00000508595	MOCS1	Q9NZB8	636 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPL9-208	ENST00000508595	AJAP1	Q9UKB5	411 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RPL9-208	ENST00000508595	FZD1	Q9UP38	647 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPL9-208	ENST00000508595	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPL9-208	ENST00000508595	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RPL9-208	ENST00000508595	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL9-208	ENST00000508595	FAM171A2	A8MVW0	826 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL9-208	ENST00000508595	DIRC3	C9JPN6	131 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL9-208	ENST00000508595	RNASET2	O00584	256 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPL9-208	ENST00000508595	NCR1	O76036	304 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL9-208	ENST00000508595	ALOX15	P16050	662 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPL9-208	ENST00000508595	CDK11B	P21127	795 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPL9-208	ENST00000508595	CHN2	P52757	468 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL9-208	ENST00000508595	INHBC	P55103	352 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL9-208	ENST00000508595	FAM189B	P81408	668 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL9-208	ENST00000508595	DPT	Q07507	201 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL9-208	ENST00000508595	MGAT2	Q10469	447 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL9-208	ENST00000508595	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPL9-208	ENST00000508595	PTPA	Q15257	358 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL9-208	ENST00000508595	CSRP2	Q16527	193 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL9-208	ENST00000508595	ZNF627	Q7L945	461 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL9-208	ENST00000508595	PLXDC1	Q8IUK5	500 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL9-208	ENST00000508595	CCHCR1	Q8TD31	782 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL9-208	ENST00000508595	HOXB13	Q92826	284 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPL9-208	ENST00000508595	MTMR8	Q96EF0	704 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL9-208	ENST00000508595	MRI1	Q9BV20	369 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL9-208	ENST00000508595	AKIP1	Q9NQ31	210 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL9-208	ENST00000508595	USP15	Q9Y4E8	981 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPL9-208	ENST00000508595	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL9-208	ENST00000508595	HMGXB3	Q12766	1538 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL9-208	ENST00000508595	MAP3K1	Q13233	1512 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL9-208	ENST00000508595	TMEM191C	A6NGB0	347 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPL9-208	ENST00000508595	MYBL2	P10244	700 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPL9-208	ENST00000508595	ZSCAN20	P17040	1043 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RPL9-208	ENST00000508595	ATP5J	P18859	108 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPL9-208	ENST00000508595	ALDH1A3	P47895	512 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPL9-208	ENST00000508595	CDKN1C	P49918	316 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RPL9-208	ENST00000508595	FSTL1	Q12841	308 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPL9-208	ENST00000508595	SEPT2	Q15019	361 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPL9-208	ENST00000508595	ABCB5	Q2M3G0	1257 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPL9-208	ENST00000508595	SYDE2	Q5VT97	1194 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPL9-208	ENST00000508595	DRC7	Q8IY82	874 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPL9-208	ENST00000508595	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPL9-208	ENST00000508595	CHFR	Q96EP1	664 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPL9-208	ENST00000508595	PRRX2	Q99811	253 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPL9-208	ENST00000508595	C7orf25	Q9BPX7	421 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPL9-208	ENST00000508595	TTPAL	Q9BTX7	342 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPL9-208	ENST00000508595	MLST8	Q9BVC4	326 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPL9-208	ENST00000508595	MANSC1	Q9H8J5	431 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPL9-208	ENST00000508595	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RPL9-208	ENST00000508595	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RPL9-208	ENST00000508595	TRHDE	Q9UKU6	1024 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPL9-208	ENST00000508595	INTU	Q9ULD6	942 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPL9-208	ENST00000508595	CHST2	Q9Y4C5	530 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPL9-208	ENST00000508595	KIF27	Q86VH2	1401 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPL9-208	ENST00000508595	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RPL9-208	ENST00000508595		A0A087X1B8	175 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPL9-208	ENST00000508595	GAGE12B	A1L429	117 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPL9-208	ENST00000508595	GAGE12H	A6NDE8	117 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPL9-208	ENST00000508595	TRIM75P	A6NK02	468 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPL9-208	ENST00000508595	DRGX	A6NNA5	263 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPL9-208	ENST00000508595	WNT10B	O00744	389 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPL9-208	ENST00000508595	ZNF185	O15231	689 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPL9-208	ENST00000508595	TEX33	O43247	280 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPL9-208	ENST00000508595	XPOT	O43592	962 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RPL9-208	ENST00000508595	RAMP2	O60895	175 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPL9-208	ENST00000508595	GPR32	O75388	356 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPL9-208	ENST00000508595	NDUFA10	O95299	355 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPL9-208	ENST00000508595	HLA-DOA	P06340	250 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPL9-208	ENST00000508595	FPR1	P21462	350 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPL9-208	ENST00000508595	GUCY1A2	P33402	732 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPL9-208	ENST00000508595	MXRA7	P84157	204 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPL9-208	ENST00000508595	MTMR1	Q13613	665 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPL9-208	ENST00000508595	PDCD4	Q53EL6	469 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RPL9-208	ENST00000508595	ZNF529	Q6P280	563 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPL9-208	ENST00000508595	MED25	Q71SY5	747 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPL9-208	ENST00000508595	RHOU	Q7L0Q8	258 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPL9-208	ENST00000508595	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPL9-208	ENST00000508595	MRGPRG	Q86SM5	289 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPL9-208	ENST00000508595	LDLRAD3	Q86YD5	345 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPL9-208	ENST00000508595	RHOT1	Q8IXI2	618 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPL9-208	ENST00000508595	ULK2	Q8IYT8	1036 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPL9-208	ENST00000508595	C1orf162	Q8NEQ5	155 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RPL9-208	ENST00000508595	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	4.94	□□□□□ -1.62	1e-9	■■□□□ 13.7

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