RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507116.5

PDE4D-216, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 3,350 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-216ENST00000507116 RHOBTB3O94955 611 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 TSPY3P0CV98 308 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 TSPY8P0CW00 308 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 ADAM17P78536 824 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 TSPY1Q01534 308 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 PTK2BQ14289 1009 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 PLS1Q14651 629 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 NPTX1Q15818 432 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 SLC10A5Q5PT55 438 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 TTC22Q5TAA0 569 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 RESP18Q5W5W9 173 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 CCDC28AQ8IWP9 274 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 C10orf88Q9H8K7 445 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 THEGQ9P2T0 379 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 DACH1Q9UI36 760 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 TSKSQ9UJT2 592 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 PCDHA12Q9UN75 941 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 MTMR6Q9Y217 621 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 SOBPA7XYQ1 873 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 PI4K2BG5E9Z4 385 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 COBLO75128 1261 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 POP4O95707 220 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 GUCY1A2P33402 732 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 ENPEPQ07075 957 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 CCDC6Q16204 474 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 PARP6Q2NL67 630 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 ALFQ53S48 1182 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 KCNT1Q5JUK3 1230 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 CEP85Q6P2H3 762 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 FAM171BQ6P995 826 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 FAM124AQ86V42 546 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 CCDC25Q86WR0 208 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 ZNF677Q86XU0 584 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 VSTM4Q8IW00 320 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 FBXL16Q8N461 479 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 KCNH5Q8NCM2 988 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 PI4K2BQ8TCG2 481 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 MGARPQ8TDB4 240 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 LRRC8CQ8TDW0 803 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 RAPGEF5Q92565 580 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 DYDC2Q96IM9 177 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 TM9SF2Q99805 663 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 TRIM15Q9C019 465 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 DBNDD1Q9H9R9 158 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 PCDH12Q9NPG4 1184 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 LZTFL1Q9NQ48 299 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 UCKL1Q9NWZ5 548 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 RABGEF1Q9UJ41 708 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 POLHQ9Y253 713 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 TBX22Q9Y458 520 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 GPSM3Q9Y4H4 160 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 STON1Q9Y6Q2 735 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 MAGEB16A2A368 324 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 H3BQV1 296 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 AQP9O43315 295 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 ALX3O95076 343 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 ZCCHC18P0CG32 403 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 P4HA1P13674 534 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 ITGAXP20702 1163 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 SOX5P35711 763 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 ASMTP46597 345 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 HSPA13P48723 471 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 ETV1P50549 477 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 FANCCQ00597 558 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 AMPD2Q01433 879 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 ZNF792Q3KQV3 632 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 VWA3BQ502W6 1294 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 ASRGL1Q7L266 308 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 SLC35F6Q8N357 371 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 ENKURQ8TC29 256 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 SELENOSQ9BQE4 189 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 IL37Q9NZH6 218 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 STK17AQ9UEE5 414 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 RNF112Q9ULX5 631 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 ABCC12Q96J65 1359 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 F8W031 263 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 UBOX5O94941 541 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 HMGN1P05114 100 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 C21orf58P58505 322 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 CTDSPL2Q05D32 466 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 ZNF33BQ06732 778 aa6.54□□□□□ -1.36
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