RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498517.5

ARHGEF3-215, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

TSL 5

Gene ARHGEF3, Length 787 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3-215ENST00000498517 TUBB2AQ13885 445 aa6.14□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 IKBKEQ14164 716 aa6.14□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 KCNJ12Q14500 433 aa6.14□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 KCNB1Q14721 858 aa6.14□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 KARSQ15046 597 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 KRT31Q15323 416 aa6.14□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 IL17AQ16552 155 aa6.14□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 LRCH2Q5VUJ6 765 aa6.14□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 KCNV1Q6PIU1 500 aa6.14□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 TMCO3Q6UWJ1 677 aa6.14□□□□□ -1.43
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ARHGEF3-215ENST00000498517 SLC30A10Q6XR72 485 aa6.14□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 CABP7Q86V35 215 aa6.14□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 CREBRFQ8IUR6 639 aa6.14□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 C4orf32Q8N8J7 132 aa6.14□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
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ARHGEF3-215ENST00000498517 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 PKNOX2Q96KN3 472 aa6.14□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 MTMR9Q96QG7 549 aa6.14□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 DESI2Q9BSY9 194 aa6.14□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 TUBB2BQ9BVA1 445 aa6.14□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 TEKT3Q9BXF9 490 aa6.14□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 WDR11Q9BZH6 1224 aa6.14□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 LRRC27Q9C0I9 530 aa6.14□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 BLZF1Q9H2G9 400 aa6.14□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 TMEM60Q9H2L4 133 aa6.14□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 MAGEF1Q9HAY2 307 aa6.14□□□□□ -1.43
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ARHGEF3-215ENST00000498517 TAB2Q9NYJ8 693 aa6.14□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 PRDM4Q9UKN5 801 aa6.14□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 MRFAP1Q9Y605 127 aa6.14□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 CUL9Q8IWT3 2517 aa6.14□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 LRRC10BA6NIK2 292 aa6.13□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 FAM86B1E9PN63 330 aa6.13□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
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ARHGEF3-215ENST00000498517 SLC37A4O43826 429 aa6.13□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP6.13□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 MYL1P05976 194 aa6.13□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 FAM86B2P0C5J1 330 aa6.13□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 ARP10275 920 aa6.13□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 TGFB3P10600 412 aa6.13□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 ADORA2AP29274 412 aa6.13□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 CASP14P31944 242 aa6.13□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
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ARHGEF3-215ENST00000498517 STIM1Q13586 685 aa6.13□□□□□ -1.43
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ARHGEF3-215ENST00000498517 NCAPH2Q6IBW4 605 aa6.13□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 C17orf99Q6UX52 265 aa6.13□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 SEPT14Q6ZU15 432 aa6.13□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 GPR142Q7Z601 462 aa6.13□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 TMTC1Q8IUR5 882 aa6.13□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 FAM133AQ8N9E0 248 aa6.13□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 CYP2W1Q8TAV3 490 aa6.13□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 FBLIM1Q8WUP2 373 aa6.13□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 CRYGNQ8WXF5 182 aa6.13□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 GPRASP2Q96D09 838 aa6.13□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 MBOAT7Q96N66 472 aa6.13□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 UIMC1Q96RL1 719 aa6.13□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 WDR24Q96S15 920 aa6.13□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 RIT2Q99578 217 aa6.13□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 CCSER1Q9C0I3 900 aa6.13□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 NT5C3AQ9H0P0 336 aa6.13□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 PORCNQ9H237 461 aa6.13□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 VPS16Q9H269 839 aa6.13□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 CUEDC2Q9H467 287 aa6.13□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 SUGCTQ9HAC7 445 aa6.13□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 DISC1Q9NRI5 854 aa6.13□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 KCNH7Q9NS40 1196 aa6.13□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZNF446Q9NWS9 450 aa6.13□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 COL20A1Q9P218 1284 aa6.13□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 SAMM50Q9Y512 469 aa6.13□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa6.13□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 RPTORQ8N122 1335 aa6.13□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa6.12□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 SLC26A4O43511 780 aa6.12□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 FZD6O60353 706 aa6.12□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP6.12□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 KIF20AO95235 890 aa6.12□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 TBC1D8O95759 1140 aa6.12□□□□□ -1.43
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