RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493560.5

SELENBP1-218, Transcript of selenium binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene SELENBP1, Length 1,963 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENBP1-218ENST00000493560 TAF3Q5VWG9 929 aa14.71□□□□□ -0.05
SELENBP1-218ENST00000493560 RASGEF1CQ8N431 466 aa14.71□□□□□ -0.05
SELENBP1-218ENST00000493560 LRRC71Q8N4P6 559 aa14.71□□□□□ -0.05
SELENBP1-218ENST00000493560 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
SELENBP1-218ENST00000493560 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
SELENBP1-218ENST00000493560 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
SELENBP1-218ENST00000493560 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa14.71□□□□□ -0.05
SELENBP1-218ENST00000493560 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa14.71□□□□□ -0.06
SELENBP1-218ENST00000493560 CEP104O60308 925 aa14.71□□□□□ -0.06
SELENBP1-218ENST00000493560 FAM189A1O60320 539 aa14.71□□□□□ -0.06
SELENBP1-218ENST00000493560 TOM1L1O75674 476 aa14.71□□□□□ -0.06
SELENBP1-218ENST00000493560 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa14.71□□□□□ -0.06
SELENBP1-218ENST00000493560 ADORA2AP29274 412 aa14.71□□□□□ -0.06
SELENBP1-218ENST00000493560 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
SELENBP1-218ENST00000493560 SLC7A5Q01650 507 aa14.71□□□□□ -0.06
SELENBP1-218ENST00000493560 CCL15Q16663 113 aa14.71□□□□□ -0.06
SELENBP1-218ENST00000493560 WDR44Q5JSH3 913 aa14.71□□□□□ -0.06
SELENBP1-218ENST00000493560 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa14.71□□□□□ -0.06
SELENBP1-218ENST00000493560 ANKRD23Q86SG2 305 aa14.71□□□□□ -0.06
SELENBP1-218ENST00000493560 ABRAQ8N0Z2 381 aa14.71□□□□□ -0.06
SELENBP1-218ENST00000493560 RNF149Q8NC42 400 aa14.71□□□□□ -0.06
SELENBP1-218ENST00000493560 BRI3BPQ8WY22 251 aa14.71□□□□□ -0.06
SELENBP1-218ENST00000493560 CGRRF1Q99675 332 aa14.71□□□□□ -0.06
SELENBP1-218ENST00000493560 ST7Q9NRC1 585 aa14.71□□□□□ -0.06
SELENBP1-218ENST00000493560 STIM2Q9P246 746 aa14.71□□□□□ -0.06
SELENBP1-218ENST00000493560 MORF4L1Q9UBU8 362 aa14.71□□□□□ -0.06
SELENBP1-218ENST00000493560 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SELENBP1-218ENST00000493560 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SELENBP1-218ENST00000493560 STRNO43815 780 aa14.7□□□□□ -0.06
SELENBP1-218ENST00000493560 PDE6CP51160 858 aa14.7□□□□□ -0.06
SELENBP1-218ENST00000493560 FKBP1BP68106 108 aa14.7□□□□□ -0.06
SELENBP1-218ENST00000493560 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SELENBP1-218ENST00000493560 ARHGAP1Q07960 439 aa14.7□□□□□ -0.06
SELENBP1-218ENST00000493560 LAMC2Q13753 1193 aa14.7□□□□□ -0.06
SELENBP1-218ENST00000493560 C8orf74Q6P047 294 aa14.7□□□□□ -0.06
SELENBP1-218ENST00000493560 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa14.7□□□□□ -0.06
SELENBP1-218ENST00000493560 C2orf40Q9H1Z8 148 aa14.7□□□□□ -0.06
SELENBP1-218ENST00000493560 C1orf112Q9NSG2 853 aa14.7□□□□□ -0.06
SELENBP1-218ENST00000493560 TRPC6Q9Y210 931 aa14.7□□□□□ -0.06
SELENBP1-218ENST00000493560 FAM170AA1A519 330 aa14.69□□□□□ -0.06
SELENBP1-218ENST00000493560 ABLIM1O14639 778 aa14.69□□□□□ -0.06
SELENBP1-218ENST00000493560 MTA2O94776 668 aa14.69□□□□□ -0.06
SELENBP1-218ENST00000493560 PRKCBP05771 671 aa14.69□□□□□ -0.06
SELENBP1-218ENST00000493560 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
SELENBP1-218ENST00000493560 BIRC3Q13489 604 aa14.69□□□□□ -0.06
SELENBP1-218ENST00000493560 MAPK6Q16659 721 aa14.69□□□□□ -0.06
SELENBP1-218ENST00000493560 SEZ6Q53EL9 994 aa14.69□□□□□ -0.06
SELENBP1-218ENST00000493560 BRSK2Q8IWQ3 736 aa14.69□□□□□ -0.06
SELENBP1-218ENST00000493560 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa14.69□□□□□ -0.06
SELENBP1-218ENST00000493560 HINFPQ9BQA5 517 aa14.69□□□□□ -0.06
SELENBP1-218ENST00000493560 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP14.69□□□□□ -0.063e-7■□□□□ 8
SELENBP1-218ENST00000493560 FZD8Q9H461 694 aa14.69□□□□□ -0.06
SELENBP1-218ENST00000493560 RNPEPQ9H4A4 650 aa14.69□□□□□ -0.06
SELENBP1-218ENST00000493560 VTA1Q9NP79 307 aa14.69□□□□□ -0.06
SELENBP1-218ENST00000493560 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa14.69□□□□□ -0.06
SELENBP1-218ENST00000493560 ALG6Q9Y672 507 aa14.69□□□□□ -0.06
SELENBP1-218ENST00000493560 MCM3APO60318 1980 aa14.69□□□□□ -0.06
SELENBP1-218ENST00000493560 KRT5P13647 590 aa14.69□□□□□ -0.06
SELENBP1-218ENST00000493560 TNFRSF8P28908 595 aa14.69□□□□□ -0.06
SELENBP1-218ENST00000493560 PIK3CAP42336 1068 aa14.69□□□□□ -0.06
SELENBP1-218ENST00000493560 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
SELENBP1-218ENST00000493560 MCL1Q07820 350 aa14.69□□□□□ -0.06
SELENBP1-218ENST00000493560 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SELENBP1-218ENST00000493560 GRM1Q13255 1194 aa14.69□□□□□ -0.06
SELENBP1-218ENST00000493560 ACAD10Q6JQN1 1059 aa14.69□□□□□ -0.06
SELENBP1-218ENST00000493560 EFCAB12Q6NXP0 572 aa14.69□□□□□ -0.06
SELENBP1-218ENST00000493560 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
SELENBP1-218ENST00000493560 RHPN2Q8IUC4 686 aa14.69□□□□□ -0.06
SELENBP1-218ENST00000493560 OR5B17Q8NGF7 314 aa14.69□□□□□ -0.06
SELENBP1-218ENST00000493560 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SELENBP1-218ENST00000493560 KRT12Q99456 494 aa14.69□□□□□ -0.06
SELENBP1-218ENST00000493560 KATNBL1Q9H079 304 aa14.69□□□□□ -0.06
SELENBP1-218ENST00000493560 VIPAS39Q9H9C1 493 aa14.69□□□□□ -0.06
SELENBP1-218ENST00000493560 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SELENBP1-218ENST00000493560 ERAP1Q9NZ08 941 aa14.69□□□□□ -0.06
SELENBP1-218ENST00000493560 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
SELENBP1-218ENST00000493560 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
SELENBP1-218ENST00000493560 ACKR2O00590 384 aa14.68□□□□□ -0.06
SELENBP1-218ENST00000493560 ASAP2O43150 1006 aa14.68□□□□□ -0.06
SELENBP1-218ENST00000493560 CYP1A2P05177 515 aa14.68□□□□□ -0.06
SELENBP1-218ENST00000493560 ACO1P21399 889 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
SELENBP1-218ENST00000493560 PROZP22891 400 aa14.68□□□□□ -0.06
SELENBP1-218ENST00000493560 TNFSF9P41273 254 aa14.68□□□□□ -0.06
SELENBP1-218ENST00000493560 AP3M2P53677 418 aa14.68□□□□□ -0.06
SELENBP1-218ENST00000493560 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
SELENBP1-218ENST00000493560 SPOPLQ6IQ16 392 aa14.68□□□□□ -0.06
SELENBP1-218ENST00000493560 C11orf63Q6NUN7 778 aa14.68□□□□□ -0.06
SELENBP1-218ENST00000493560 TCHPQ9BT92 498 aa14.68□□□□□ -0.06
SELENBP1-218ENST00000493560 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
SELENBP1-218ENST00000493560 PTPRHQ9HD43 1115 aa14.68□□□□□ -0.06
SELENBP1-218ENST00000493560 GDF3Q9NR23 364 aa14.68□□□□□ -0.06
SELENBP1-218ENST00000493560 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa14.68□□□□□ -0.06
SELENBP1-218ENST00000493560 OGTO15294 1046 aa14.67□□□□□ -0.06
SELENBP1-218ENST00000493560 GH1P01241 217 aa14.67□□□□□ -0.06
SELENBP1-218ENST00000493560 GLI1P08151 1106 aa14.67□□□□□ -0.06
SELENBP1-218ENST00000493560 HARSP12081 509 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
SELENBP1-218ENST00000493560 BPIFB4P59827 614 aa14.67□□□□□ -0.06
SELENBP1-218ENST00000493560 TNNC1P63316 161 aa14.67□□□□□ -0.06
SELENBP1-218ENST00000493560 CUL2Q13617 745 aa14.67□□□□□ -0.06
SELENBP1-218ENST00000493560 TFDP1Q14186 410 aa14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.4 ms