RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492741.5

PSPC1-204, Transcript of paraspeckle component 1, humanhuman

TSL 2

Gene PSPC1, Length 1,709 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPC1-204ENST00000492741 SEPT8Q92599 483 aa23.88■■□□□ 1.41
PSPC1-204ENST00000492741 CGRRF1Q99675 332 aa23.88■■□□□ 1.41
PSPC1-204ENST00000492741 WNT8AQ9H1J5 351 aa23.88■■□□□ 1.41
PSPC1-204ENST00000492741 A0A1W2PQC6 194 aa23.87■■□□□ 1.41
PSPC1-204ENST00000492741 GTF2H1P32780 548 aa23.87■■□□□ 1.41
PSPC1-204ENST00000492741 MXI1P50539 228 aa23.87■■□□□ 1.41
PSPC1-204ENST00000492741 DSC3Q14574 896 aa23.87■■□□□ 1.41
PSPC1-204ENST00000492741 SLC10A6Q3KNW5 377 aa23.87■■□□□ 1.41
PSPC1-204ENST00000492741 GBP6Q6ZN66 633 aa23.87■■□□□ 1.41
PSPC1-204ENST00000492741 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
PSPC1-204ENST00000492741 DBF4BQ8NFT6 615 aa23.87■■□□□ 1.41
PSPC1-204ENST00000492741 ERGIC2Q96RQ1 377 aa23.87■■□□□ 1.41
PSPC1-204ENST00000492741 FTHL17Q9BXU8 183 aa23.87■■□□□ 1.41
PSPC1-204ENST00000492741 TMEM8AQ9HCN3 771 aa23.87■■□□□ 1.41
PSPC1-204ENST00000492741 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa23.87■■□□□ 1.41
PSPC1-204ENST00000492741 RECQL4O94761 1208 aa23.87■■□□□ 1.41
PSPC1-204ENST00000492741 RAB27AP51159 221 aa23.87■■□□□ 1.41
PSPC1-204ENST00000492741 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
PSPC1-204ENST00000492741 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
PSPC1-204ENST00000492741 EXOC3L4Q17RC7 722 aa23.87■■□□□ 1.41
PSPC1-204ENST00000492741 KRT39Q6A163 491 aa23.87■■□□□ 1.41
PSPC1-204ENST00000492741 DEFB128Q7Z7B8 93 aa23.87■■□□□ 1.41
PSPC1-204ENST00000492741 WDR49Q8IV35 697 aa23.87■■□□□ 1.41
PSPC1-204ENST00000492741 ASB7Q9H672 318 aa23.87■■□□□ 1.41
PSPC1-204ENST00000492741 SKIP12755 728 aa23.86■■□□□ 1.41
PSPC1-204ENST00000492741 ITGA4P13612 1032 aa23.86■■□□□ 1.41
PSPC1-204ENST00000492741 RAG1P15918 1043 aa23.86■■□□□ 1.41
PSPC1-204ENST00000492741 PBX1P40424 430 aa23.86■■□□□ 1.41
PSPC1-204ENST00000492741 CLDN10P78369 228 aa23.86■■□□□ 1.41
PSPC1-204ENST00000492741 BIRC3Q13489 604 aa23.86■■□□□ 1.41
PSPC1-204ENST00000492741 GPNMBQ14956 572 aa23.86■■□□□ 1.41
PSPC1-204ENST00000492741 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa23.86■■□□□ 1.41
PSPC1-204ENST00000492741 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
PSPC1-204ENST00000492741 CD302Q8IX05 232 aa23.86■■□□□ 1.41
PSPC1-204ENST00000492741 RNF169Q8NCN4 708 aa23.86■■□□□ 1.41
PSPC1-204ENST00000492741 APBB2Q92870 758 aa23.86■■□□□ 1.41
PSPC1-204ENST00000492741 TMEM117Q9H0C3 514 aa23.86■■□□□ 1.41
PSPC1-204ENST00000492741 RNF39Q9H2S5 420 aa23.86■■□□□ 1.41
PSPC1-204ENST00000492741 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa23.86■■□□□ 1.41
PSPC1-204ENST00000492741 GCNT4Q9P109 453 aa23.86■■□□□ 1.41
PSPC1-204ENST00000492741 TTC26A0AVF1 554 aa23.85■■□□□ 1.41
PSPC1-204ENST00000492741 PHACTR2O75167 634 aa23.85■■□□□ 1.41
PSPC1-204ENST00000492741 PTMAP06454 111 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
PSPC1-204ENST00000492741 TMEM191BP0C7N4 346 aa23.85■■□□□ 1.41
PSPC1-204ENST00000492741 AP3M2P53677 418 aa23.85■■□□□ 1.41
PSPC1-204ENST00000492741 DUOXA2Q1HG44 320 aa23.85■■□□□ 1.41
PSPC1-204ENST00000492741 SV2AQ7L0J3 742 aa23.85■■□□□ 1.41
PSPC1-204ENST00000492741 ZNF516Q92618 1163 aa23.85■■□□□ 1.41
PSPC1-204ENST00000492741 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa23.85■■□□□ 1.41
PSPC1-204ENST00000492741 PDLIM2Q96JY6 352 aa23.85■■□□□ 1.41
PSPC1-204ENST00000492741 KLK14Q9P0G3 267 aa23.85■■□□□ 1.41
PSPC1-204ENST00000492741 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa23.85■■□□□ 1.41
PSPC1-204ENST00000492741 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP23.85■■□□□ 1.414e-8■■■□□ 19.1
PSPC1-204ENST00000492741 A0A0U1RQF3 1178 aa23.84■■□□□ 1.41
PSPC1-204ENST00000492741 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
PSPC1-204ENST00000492741 TRIM43BA6NCK2 446 aa23.84■■□□□ 1.41
PSPC1-204ENST00000492741 P4HA2O15460 535 aa23.84■■□□□ 1.41
PSPC1-204ENST00000492741 TIMP1P01033 207 aa23.84■■□□□ 1.41
PSPC1-204ENST00000492741 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
PSPC1-204ENST00000492741 KLK7P49862 253 aa23.84■■□□□ 1.41
PSPC1-204ENST00000492741 JADE1Q6IE81 842 aa23.84■■□□□ 1.41
PSPC1-204ENST00000492741 PPFIBP1Q86W92 1011 aa23.84■■□□□ 1.41
PSPC1-204ENST00000492741 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
PSPC1-204ENST00000492741 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
PSPC1-204ENST00000492741 TRAIPQ9BWF2 469 aa23.84■■□□□ 1.41
PSPC1-204ENST00000492741 RGS18Q9NS28 235 aa23.84■■□□□ 1.41
PSPC1-204ENST00000492741 KIAA0355O15063 1070 aa23.84■■□□□ 1.41
PSPC1-204ENST00000492741 TNNC2P02585 160 aa23.84■■□□□ 1.41
PSPC1-204ENST00000492741 KCNMA1Q12791 1236 aa23.84■■□□□ 1.41
PSPC1-204ENST00000492741 NEK11Q8NG66 645 aa23.84■■□□□ 1.41
PSPC1-204ENST00000492741 OR5B17Q8NGF7 314 aa23.84■■□□□ 1.41
PSPC1-204ENST00000492741 KIF12Q96FN5 646 aa23.84■■□□□ 1.41
PSPC1-204ENST00000492741 FAM84AQ96KN4 292 aa23.84■■□□□ 1.41
PSPC1-204ENST00000492741 SNX27Q96L92 541 aa23.84■■□□□ 1.41
PSPC1-204ENST00000492741 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
PSPC1-204ENST00000492741 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
PSPC1-204ENST00000492741 PTPRJQ12913 1337 aa23.83■■□□□ 1.41
PSPC1-204ENST00000492741 ITIH6Q6UXX5 1313 aa23.83■■□□□ 1.41
PSPC1-204ENST00000492741 TPM1P09493 284 aa23.83■■□□□ 1.41
PSPC1-204ENST00000492741 DEKP35659 375 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.41
PSPC1-204ENST00000492741 TMEM132DQ14C87 1099 aa23.83■■□□□ 1.41
PSPC1-204ENST00000492741 SLC24A5Q71RS6 500 aa23.83■■□□□ 1.41
PSPC1-204ENST00000492741 CPLX3Q8WVH0 158 aa23.83■■□□□ 1.41
PSPC1-204ENST00000492741 PGBD4Q96DM1 585 aa23.83■■□□□ 1.41
PSPC1-204ENST00000492741 ABHD8Q96I13 439 aa23.83■■□□□ 1.41
PSPC1-204ENST00000492741 MTMR12Q9C0I1 747 aa23.83■■□□□ 1.41
PSPC1-204ENST00000492741 SIK3Q9Y2K2 1263 aa23.83■■□□□ 1.41
PSPC1-204ENST00000492741 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
PSPC1-204ENST00000492741 ZNF623O75123 536 aa23.82■■□□□ 1.4
PSPC1-204ENST00000492741 CXCL10P02778 98 aa23.82■■□□□ 1.4
PSPC1-204ENST00000492741 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP23.82■■□□□ 1.4
PSPC1-204ENST00000492741 NFICP08651 508 aa23.82■■□□□ 1.4
PSPC1-204ENST00000492741 SLC9A1P19634 815 aa23.82■■□□□ 1.4
PSPC1-204ENST00000492741 PON1P27169 355 aa23.82■■□□□ 1.4
PSPC1-204ENST00000492741 RFC2P35250 354 aa23.82■■□□□ 1.4
PSPC1-204ENST00000492741 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
PSPC1-204ENST00000492741 EFCAB13Q8IY85 973 aa23.82■■□□□ 1.4
PSPC1-204ENST00000492741 FBXL13Q8NEE6 735 aa23.82■■□□□ 1.4
PSPC1-204ENST00000492741 LPPQ93052 612 aa23.82■■□□□ 1.4
PSPC1-204ENST00000492741 PPP1R9BQ96SB3 815 aa23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms