RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488277.1

EPB41-211, Transcript of erythrocyte membrane protein band 4.1, humanhuman

TSL 3

Gene EPB41, Length 262 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41-211ENST00000488277 CCDC154A6NI56 674 aa3.29□□□□□ -1.88
EPB41-211ENST00000488277 GRXCR1A8MXD5 290 aa3.29□□□□□ -1.88
EPB41-211ENST00000488277 NPIPB8E9PQR5 432 aa3.29□□□□□ -1.88
EPB41-211ENST00000488277 LEFTY2O00292 366 aa3.29□□□□□ -1.88
EPB41-211ENST00000488277 TRIM24O15164 1050 aa3.29□□□□□ -1.88
EPB41-211ENST00000488277 TEX33O43247 280 aa3.29□□□□□ -1.88
EPB41-211ENST00000488277 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
EPB41-211ENST00000488277 RPS6KA4O75676 772 aa3.29□□□□□ -1.88
EPB41-211ENST00000488277 AMY1AP04745 511 aa3.29□□□□□ -1.88
EPB41-211ENST00000488277 PDGFRBP09619 1106 aa3.29□□□□□ -1.88
EPB41-211ENST00000488277 DDCP20711 480 aa3.29□□□□□ -1.88
EPB41-211ENST00000488277 PCSK1P29120 753 aa3.29□□□□□ -1.88
EPB41-211ENST00000488277 WASP42768 502 aa3.29□□□□□ -1.88
EPB41-211ENST00000488277 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
EPB41-211ENST00000488277 NEK2P51955 445 aa3.29□□□□□ -1.88
EPB41-211ENST00000488277 PTTG1IPP53801 180 aa3.29□□□□□ -1.88
EPB41-211ENST00000488277 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
EPB41-211ENST00000488277 SLC25A3Q00325 362 aa3.29□□□□□ -1.88
EPB41-211ENST00000488277 NHLH2Q02577 135 aa3.29□□□□□ -1.88
EPB41-211ENST00000488277 MTM1Q13496 603 aa3.29□□□□□ -1.88
EPB41-211ENST00000488277 C3orf36Q3SXR2 165 aa3.29□□□□□ -1.88
EPB41-211ENST00000488277 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
EPB41-211ENST00000488277 RSPH3Q86UC2 560 aa3.29□□□□□ -1.88
EPB41-211ENST00000488277 SYT12Q8IV01 421 aa3.29□□□□□ -1.88
EPB41-211ENST00000488277 MIER2Q8N344 545 aa3.29□□□□□ -1.88
EPB41-211ENST00000488277 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
EPB41-211ENST00000488277 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa3.29□□□□□ -1.88
EPB41-211ENST00000488277 COA7Q96BR5 231 aa3.29□□□□□ -1.88
EPB41-211ENST00000488277 CHMP4CQ96CF2 233 aa3.29□□□□□ -1.88
EPB41-211ENST00000488277 TMX3Q96JJ7 454 aa3.29□□□□□ -1.88
EPB41-211ENST00000488277 PHACTR3Q96KR7 559 aa3.29□□□□□ -1.88
EPB41-211ENST00000488277 CEP89Q96ST8 783 aa3.29□□□□□ -1.88
EPB41-211ENST00000488277 TDP1Q9NUW8 608 aa3.29□□□□□ -1.88
EPB41-211ENST00000488277 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
EPB41-211ENST00000488277 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa3.29□□□□□ -1.88
EPB41-211ENST00000488277 SERPINB13Q9UIV8 391 aa3.29□□□□□ -1.88
EPB41-211ENST00000488277 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa3.29□□□□□ -1.88
EPB41-211ENST00000488277 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
EPB41-211ENST00000488277 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
EPB41-211ENST00000488277 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa3.29□□□□□ -1.88
EPB41-211ENST00000488277 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa3.28□□□□□ -1.88
EPB41-211ENST00000488277 DRGXA6NNA5 263 aa3.28□□□□□ -1.88
EPB41-211ENST00000488277 FZD7O75084 574 aa3.28□□□□□ -1.88
EPB41-211ENST00000488277 ZNF202O95125 648 aa3.28□□□□□ -1.88
EPB41-211ENST00000488277 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP3.28□□□□□ -1.885e-6■■■□□ 15.5
EPB41-211ENST00000488277 POMCP01189 267 aa3.28□□□□□ -1.88
EPB41-211ENST00000488277 FSHBP01225 129 aa3.28□□□□□ -1.88
EPB41-211ENST00000488277 EDNRBP24530 442 aa3.28□□□□□ -1.88
EPB41-211ENST00000488277 CHN2P52757 468 aa3.28□□□□□ -1.88
EPB41-211ENST00000488277 ADKP55263 362 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
EPB41-211ENST00000488277 IL10RAQ13651 578 aa3.28□□□□□ -1.88
EPB41-211ENST00000488277 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa3.28□□□□□ -1.88
EPB41-211ENST00000488277 PPP4R3AQ6IN85 833 aa3.28□□□□□ -1.88
EPB41-211ENST00000488277 ZNF529Q6P280 563 aa3.28□□□□□ -1.88
EPB41-211ENST00000488277 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa3.28□□□□□ -1.88
EPB41-211ENST00000488277 GDF7Q7Z4P5 450 aa3.28□□□□□ -1.88
EPB41-211ENST00000488277 DRC7Q8IY82 874 aa3.28□□□□□ -1.88
EPB41-211ENST00000488277 Q8N1X5 172 aa3.28□□□□□ -1.88
EPB41-211ENST00000488277 ZNF276Q8N554 614 aa3.28□□□□□ -1.88
EPB41-211ENST00000488277 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
EPB41-211ENST00000488277 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
EPB41-211ENST00000488277 STAG1Q8WVM7 1258 aa3.28□□□□□ -1.88
EPB41-211ENST00000488277 KAT5Q92993 513 aa3.28□□□□□ -1.88
EPB41-211ENST00000488277 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
EPB41-211ENST00000488277 MYOCQ99972 504 aa3.28□□□□□ -1.88
EPB41-211ENST00000488277 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
EPB41-211ENST00000488277 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa3.28□□□□□ -1.88
EPB41-211ENST00000488277 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa3.28□□□□□ -1.88
EPB41-211ENST00000488277 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa3.28□□□□□ -1.88
EPB41-211ENST00000488277 SLC23A1Q9UHI7 598 aa3.28□□□□□ -1.88
EPB41-211ENST00000488277 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
EPB41-211ENST00000488277 IPPQ9Y573 584 aa3.28□□□□□ -1.88
EPB41-211ENST00000488277 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa3.28□□□□□ -1.88
EPB41-211ENST00000488277 AHRRA9YTQ3 701 aa3.27□□□□□ -1.89
EPB41-211ENST00000488277 DIRC3C9JPN6 131 aa3.27□□□□□ -1.89
EPB41-211ENST00000488277 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
EPB41-211ENST00000488277 ZNF185O15231 689 aa3.27□□□□□ -1.89
EPB41-211ENST00000488277 ALDH1L1O75891 902 aa3.27□□□□□ -1.89
EPB41-211ENST00000488277 IL33O95760 270 aa3.27□□□□□ -1.89
EPB41-211ENST00000488277 PEX11BO96011 259 aa3.27□□□□□ -1.89
EPB41-211ENST00000488277 SPATA31D3P0C874 917 aa3.27□□□□□ -1.89
EPB41-211ENST00000488277 PTGS2P35354 604 aa3.27□□□□□ -1.89
EPB41-211ENST00000488277 GDF5P43026 501 aa3.27□□□□□ -1.89
EPB41-211ENST00000488277 ATP8B2P98198 1209 aa3.27□□□□□ -1.89
EPB41-211ENST00000488277 CDC42EP1Q00587 391 aa3.27□□□□□ -1.89
EPB41-211ENST00000488277 CREMQ03060 361 aa3.27□□□□□ -1.89
EPB41-211ENST00000488277 ABHD18Q0P651 414 aa3.27□□□□□ -1.89
EPB41-211ENST00000488277 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP3.27□□□□□ -1.89
EPB41-211ENST00000488277 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
EPB41-211ENST00000488277 ATP2B3Q16720 1220 aa3.27□□□□□ -1.89
EPB41-211ENST00000488277 TMEM240Q5SV17 173 aa3.27□□□□□ -1.89
EPB41-211ENST00000488277 FNDC7Q5VTL7 733 aa3.27□□□□□ -1.89
EPB41-211ENST00000488277 IGFL4Q6B9Z1 124 aa3.27□□□□□ -1.89
EPB41-211ENST00000488277 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa3.27□□□□□ -1.89
EPB41-211ENST00000488277 SEM1Q6ZVN7 128 aa3.27□□□□□ -1.89
EPB41-211ENST00000488277 USP51Q70EK9 711 aa3.27□□□□□ -1.89
EPB41-211ENST00000488277 MED25Q71SY5 747 aa3.27□□□□□ -1.89
EPB41-211ENST00000488277 PLXDC1Q8IUK5 500 aa3.27□□□□□ -1.89
EPB41-211ENST00000488277 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
EPB41-211ENST00000488277 SYNE4Q8N205 404 aa3.27□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.4 ms