RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487939.1

PTEN-204, Transcript of phosphatase and tensin homolog, humanhuman

TSL 3

Gene PTEN, Length 477 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTEN-204ENST00000487939 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
PTEN-204ENST00000487939 POGKQ9P215 609 aa5.83□□□□□ -1.48
PTEN-204ENST00000487939 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
PTEN-204ENST00000487939 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa5.83□□□□□ -1.48
PTEN-204ENST00000487939 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa5.83□□□□□ -1.48
PTEN-204ENST00000487939 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
PTEN-204ENST00000487939 TRIM24O15164 1050 aa5.82□□□□□ -1.48
PTEN-204ENST00000487939 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP5.82□□□□□ -1.48
PTEN-204ENST00000487939 DDCP20711 480 aa5.82□□□□□ -1.48
PTEN-204ENST00000487939 KRTAP10-2P60368 255 aa5.82□□□□□ -1.48
PTEN-204ENST00000487939 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
PTEN-204ENST00000487939 AFMIDQ63HM1 303 aa5.82□□□□□ -1.48
PTEN-204ENST00000487939 ANKS6Q68DC2 871 aa5.82□□□□□ -1.48
PTEN-204ENST00000487939 SPRED1Q7Z699 444 aa5.82□□□□□ -1.48
PTEN-204ENST00000487939 IL17DQ8TAD2 202 aa5.82□□□□□ -1.48
PTEN-204ENST00000487939 STON2Q8WXE9 905 aa5.82□□□□□ -1.48
PTEN-204ENST00000487939 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
PTEN-204ENST00000487939 NDC1Q9BTX1 674 aa5.82□□□□□ -1.48
PTEN-204ENST00000487939 MRI1Q9BV20 369 aa5.82□□□□□ -1.48
PTEN-204ENST00000487939 IP6K2Q9UHH9 426 aa5.82□□□□□ -1.48
PTEN-204ENST00000487939 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
PTEN-204ENST00000487939 AKAP5P24588 427 aa5.81□□□□□ -1.48
PTEN-204ENST00000487939 ALDH1A3P47895 512 aa5.81□□□□□ -1.48
PTEN-204ENST00000487939 RAP2BP61225 183 aa5.81□□□□□ -1.48
PTEN-204ENST00000487939 CREMQ03060 361 aa5.81□□□□□ -1.48
PTEN-204ENST00000487939 MTM1Q13496 603 aa5.81□□□□□ -1.48
PTEN-204ENST00000487939 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP5.81□□□□□ -1.48
PTEN-204ENST00000487939 RAB39AQ14964 217 aa5.81□□□□□ -1.48
PTEN-204ENST00000487939 C3orf36Q3SXR2 165 aa5.81□□□□□ -1.48
PTEN-204ENST00000487939 RABL3Q5HYI8 236 aa5.81□□□□□ -1.48
PTEN-204ENST00000487939 SEM1Q6ZVN7 128 aa5.81□□□□□ -1.48
PTEN-204ENST00000487939 TTC7BQ86TV6 843 aa5.81□□□□□ -1.48
PTEN-204ENST00000487939 SLC35B2Q8TB61 432 aa5.81□□□□□ -1.48
PTEN-204ENST00000487939 TMX3Q96JJ7 454 aa5.81□□□□□ -1.48
PTEN-204ENST00000487939 CAMKK2Q96RR4 588 aa5.81□□□□□ -1.48
PTEN-204ENST00000487939 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
PTEN-204ENST00000487939 SERPINB13Q9UIV8 391 aa5.81□□□□□ -1.48
PTEN-204ENST00000487939 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa5.81□□□□□ -1.48
PTEN-204ENST00000487939 ACTL7AQ9Y615 435 aa5.81□□□□□ -1.48
PTEN-204ENST00000487939 DIRC3C9JPN6 131 aa5.8□□□□□ -1.48
PTEN-204ENST00000487939 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
PTEN-204ENST00000487939 ABLIM3O94929 683 aa5.8□□□□□ -1.48
PTEN-204ENST00000487939 PEX11BO96011 259 aa5.8□□□□□ -1.48
PTEN-204ENST00000487939 POMCP01189 267 aa5.8□□□□□ -1.48
PTEN-204ENST00000487939 AMY1AP04745 511 aa5.8□□□□□ -1.48
PTEN-204ENST00000487939 ALAS1P13196 640 aa5.8□□□□□ -1.48
PTEN-204ENST00000487939 FPR1P21462 350 aa5.8□□□□□ -1.48
PTEN-204ENST00000487939 EDNRBP24530 442 aa5.8□□□□□ -1.48
PTEN-204ENST00000487939 PCSK1P29120 753 aa5.8□□□□□ -1.48
PTEN-204ENST00000487939 CTXN1P60606 82 aa5.8□□□□□ -1.48
PTEN-204ENST00000487939 ATP8B2P98198 1209 aa5.8□□□□□ -1.48
PTEN-204ENST00000487939 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP5.8□□□□□ -1.48
PTEN-204ENST00000487939 FOXE3Q13461 319 aa5.8□□□□□ -1.48
PTEN-204ENST00000487939 IL10RAQ13651 578 aa5.8□□□□□ -1.48
PTEN-204ENST00000487939 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
PTEN-204ENST00000487939 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa5.8□□□□□ -1.48
PTEN-204ENST00000487939 GADL1Q6ZQY3 521 aa5.8□□□□□ -1.48
PTEN-204ENST00000487939 RNF169Q8NCN4 708 aa5.8□□□□□ -1.48
PTEN-204ENST00000487939 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa5.8□□□□□ -1.48
PTEN-204ENST00000487939 MAN1C1Q9NR34 630 aa5.8□□□□□ -1.48
PTEN-204ENST00000487939 FAM30AQ9NZY2 134 aa5.8□□□□□ -1.48
PTEN-204ENST00000487939 ZNF180Q9UJW8 692 aa5.8□□□□□ -1.48
PTEN-204ENST00000487939 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
PTEN-204ENST00000487939 SORCS3Q9UPU3 1222 aa5.8□□□□□ -1.48
PTEN-204ENST00000487939 PLSCR1O15162 318 aa5.79□□□□□ -1.48
PTEN-204ENST00000487939 AKAP10O43572 662 aa5.79□□□□□ -1.48
PTEN-204ENST00000487939 AMHP03971 560 aa5.79□□□□□ -1.48
PTEN-204ENST00000487939 SPATA31D3P0C874 917 aa5.79□□□□□ -1.48
PTEN-204ENST00000487939 PF4V1P10720 104 aa5.79□□□□□ -1.48
PTEN-204ENST00000487939 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
PTEN-204ENST00000487939 RAB27AP51159 221 aa5.79□□□□□ -1.48
PTEN-204ENST00000487939 MIIPQ5JXC2 388 aa5.79□□□□□ -1.48
PTEN-204ENST00000487939 ZNF529Q6P280 563 aa5.79□□□□□ -1.48
PTEN-204ENST00000487939 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa5.79□□□□□ -1.48
PTEN-204ENST00000487939 PLXDC1Q8IUK5 500 aa5.79□□□□□ -1.48
PTEN-204ENST00000487939 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
PTEN-204ENST00000487939 CPT1CQ8TCG5 803 aa5.79□□□□□ -1.48
PTEN-204ENST00000487939 CLPTM1LQ96KA5 538 aa5.79□□□□□ -1.48
PTEN-204ENST00000487939 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
PTEN-204ENST00000487939 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
PTEN-204ENST00000487939 VPS11Q9H270 941 aa5.79□□□□□ -1.48
PTEN-204ENST00000487939 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa5.79□□□□□ -1.48
PTEN-204ENST00000487939 CEP72Q9P209 647 aa5.79□□□□□ -1.48
PTEN-204ENST00000487939 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
PTEN-204ENST00000487939 MATN3O15232 486 aa5.78□□□□□ -1.48
PTEN-204ENST00000487939 PPFIA4O75335 1185 aa5.78□□□□□ -1.48
PTEN-204ENST00000487939 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
PTEN-204ENST00000487939 ARIH2O95376 493 aa5.78□□□□□ -1.48
PTEN-204ENST00000487939 POU2F2P09086 479 aa5.78□□□□□ -1.48
PTEN-204ENST00000487939 PDCP20941 246 aa5.78□□□□□ -1.48
PTEN-204ENST00000487939 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
PTEN-204ENST00000487939 NHLH2Q02577 135 aa5.78□□□□□ -1.48
PTEN-204ENST00000487939 CSRP2Q16527 193 aa5.78□□□□□ -1.48
PTEN-204ENST00000487939 USP45Q70EL2 814 aa5.78□□□□□ -1.48
PTEN-204ENST00000487939 GGNQ86UU5 652 aa5.78□□□□□ -1.48
PTEN-204ENST00000487939 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
PTEN-204ENST00000487939 IFI44Q8TCB0 444 aa5.78□□□□□ -1.48
PTEN-204ENST00000487939 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
PTEN-204ENST00000487939 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
PTEN-204ENST00000487939 KAT5Q92993 513 aa5.78□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms