RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487558.1

CUL3-211, Transcript of cullin 3, humanhuman

TSL 2

Gene CUL3, Length 1,093 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3-211ENST00000487558 SREBF1P36956 1147 aa7.14□□□□□ -1.27
CUL3-211ENST00000487558 MRE11P49959 708 aa7.14□□□□□ -1.27
CUL3-211ENST00000487558 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
CUL3-211ENST00000487558 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
CUL3-211ENST00000487558 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa7.14□□□□□ -1.27
CUL3-211ENST00000487558 SLC35A4Q96G79 324 aa7.14□□□□□ -1.27
CUL3-211ENST00000487558 AJUBAQ96IF1 538 aa7.14□□□□□ -1.27
CUL3-211ENST00000487558 TMX3Q96JJ7 454 aa7.14□□□□□ -1.27
CUL3-211ENST00000487558 MRGPRX4Q96LA9 322 aa7.14□□□□□ -1.27
CUL3-211ENST00000487558 SAMD11Q96NU1 681 aa7.14□□□□□ -1.27
CUL3-211ENST00000487558 DMRTA2Q96SC8 542 aa7.14□□□□□ -1.27
CUL3-211ENST00000487558 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
CUL3-211ENST00000487558 LRRC27Q9C0I9 530 aa7.14□□□□□ -1.27
CUL3-211ENST00000487558 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
CUL3-211ENST00000487558 TMEM168Q9H0V1 697 aa7.14□□□□□ -1.27
CUL3-211ENST00000487558 ARMT1Q9H993 441 aa7.14□□□□□ -1.27
CUL3-211ENST00000487558 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
CUL3-211ENST00000487558 LANCL2Q9NS86 450 aa7.14□□□□□ -1.27
CUL3-211ENST00000487558 TMEM140Q9NV12 185 aa7.14□□□□□ -1.27
CUL3-211ENST00000487558 USP40Q9NVE5 1235 aa7.14□□□□□ -1.27
CUL3-211ENST00000487558 PNPOQ9NVS9 261 aa7.14□□□□□ -1.27
CUL3-211ENST00000487558 NTMQ9P121 344 aa7.14□□□□□ -1.27
CUL3-211ENST00000487558 TRPS1Q9UHF7 1281 aa7.14□□□□□ -1.27
CUL3-211ENST00000487558 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa7.14□□□□□ -1.27
CUL3-211ENST00000487558 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
CUL3-211ENST00000487558 C2orf78A6NCI8 922 aa7.13□□□□□ -1.27
CUL3-211ENST00000487558 LRRC14BA6NHZ5 514 aa7.13□□□□□ -1.27
CUL3-211ENST00000487558 K7ESM1 405 aa7.13□□□□□ -1.27
CUL3-211ENST00000487558 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
CUL3-211ENST00000487558 MYF5P13349 255 aa7.13□□□□□ -1.27
CUL3-211ENST00000487558 GYPEP15421 78 aa7.13□□□□□ -1.27
CUL3-211ENST00000487558 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
CUL3-211ENST00000487558 RPL17P18621 184 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
CUL3-211ENST00000487558 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP7.13□□□□□ -1.27
CUL3-211ENST00000487558 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
CUL3-211ENST00000487558 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP7.13□□□□□ -1.27
CUL3-211ENST00000487558 CARFQ8N187 725 aa7.13□□□□□ -1.27
CUL3-211ENST00000487558 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
CUL3-211ENST00000487558 PLBD2Q8NHP8 589 aa7.13□□□□□ -1.27
CUL3-211ENST00000487558 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
CUL3-211ENST00000487558 PGBD4Q96DM1 585 aa7.13□□□□□ -1.27
CUL3-211ENST00000487558 CCDC138Q96M89 665 aa7.13□□□□□ -1.27
CUL3-211ENST00000487558 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
CUL3-211ENST00000487558 TBCBQ99426 244 aa7.13□□□□□ -1.27
CUL3-211ENST00000487558 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
CUL3-211ENST00000487558 PDCD2LQ9BRP1 358 aa7.13□□□□□ -1.27
CUL3-211ENST00000487558 APOL5Q9BWW9 433 aa7.13□□□□□ -1.27
CUL3-211ENST00000487558 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa7.13□□□□□ -1.27
CUL3-211ENST00000487558 ING3Q9NXR8 418 aa7.13□□□□□ -1.27
CUL3-211ENST00000487558 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
CUL3-211ENST00000487558 DUSP10Q9Y6W6 482 aa7.13□□□□□ -1.27
CUL3-211ENST00000487558 A0A1W2PPL8 197 aa7.12□□□□□ -1.27
CUL3-211ENST00000487558 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CUL3-211ENST00000487558 MTSS1O43312 755 aa7.12□□□□□ -1.27
CUL3-211ENST00000487558 FRS3O43559 492 aa7.12□□□□□ -1.27
CUL3-211ENST00000487558 JUNP05412 331 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CUL3-211ENST00000487558 INSRRP14616 1297 aa7.12□□□□□ -1.27
CUL3-211ENST00000487558 TYRP14679 529 aa7.12□□□□□ -1.27
CUL3-211ENST00000487558 MALP21145 153 aa7.12□□□□□ -1.27
CUL3-211ENST00000487558 SERPINB3P29508 390 aa7.12□□□□□ -1.27
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CUL3-211ENST00000487558 PLS1Q14651 629 aa7.12□□□□□ -1.27
CUL3-211ENST00000487558 USP10Q14694 798 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CUL3-211ENST00000487558 ZNF827Q17R98 1081 aa7.12□□□□□ -1.27
CUL3-211ENST00000487558 ZMAT1Q5H9K5 638 aa7.12□□□□□ -1.27
CUL3-211ENST00000487558 SWSAP1Q6NVH7 229 aa7.12□□□□□ -1.27
CUL3-211ENST00000487558 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CUL3-211ENST00000487558 DPP9Q86TI2 863 aa7.12□□□□□ -1.27
CUL3-211ENST00000487558 IFI44Q8TCB0 444 aa7.12□□□□□ -1.27
CUL3-211ENST00000487558 RAB24Q969Q5 203 aa7.12□□□□□ -1.27
CUL3-211ENST00000487558 APIPQ96GX9 242 aa7.12□□□□□ -1.27
CUL3-211ENST00000487558 OR10A2Q9H208 303 aa7.12□□□□□ -1.27
CUL3-211ENST00000487558 WDCPQ9H6R7 721 aa7.12□□□□□ -1.27
CUL3-211ENST00000487558 PLCB1Q9NQ66 1216 aa7.12□□□□□ -1.27
CUL3-211ENST00000487558 CNNM1Q9NRU3 951 aa7.12□□□□□ -1.27
CUL3-211ENST00000487558 ABCF2Q9UG63 623 aa7.12□□□□□ -1.27
CUL3-211ENST00000487558 DMTF1Q9Y222 760 aa7.12□□□□□ -1.27
CUL3-211ENST00000487558 MYRFQ9Y2G1 1151 aa7.12□□□□□ -1.27
CUL3-211ENST00000487558 NRP1O14786 923 aa7.11□□□□□ -1.27
CUL3-211ENST00000487558 ITGA10O75578 1167 aa7.11□□□□□ -1.27
CUL3-211ENST00000487558 FTH1P19P0C7X4 201 aa7.11□□□□□ -1.27
CUL3-211ENST00000487558 SETSIPP0DME0 302 aa7.11□□□□□ -1.27
CUL3-211ENST00000487558 IL2RBP14784 551 aa7.11□□□□□ -1.27
CUL3-211ENST00000487558 DDCP20711 480 aa7.11□□□□□ -1.27
CUL3-211ENST00000487558 PTPN7P35236 360 aa7.11□□□□□ -1.27
CUL3-211ENST00000487558 TM4SF4P48230 202 aa7.11□□□□□ -1.27
CUL3-211ENST00000487558 SARSP49591 514 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
CUL3-211ENST00000487558 TLE1Q04724 770 aa7.11□□□□□ -1.27
CUL3-211ENST00000487558 BTKQ06187 659 aa7.11□□□□□ -1.27
CUL3-211ENST00000487558 SNAPC2Q13487 334 aa7.11□□□□□ -1.27
CUL3-211ENST00000487558 KRT40Q6A162 431 aa7.11□□□□□ -1.27
CUL3-211ENST00000487558 APOA5Q6Q788 366 aa7.11□□□□□ -1.27
CUL3-211ENST00000487558 USP30Q70CQ3 517 aa7.11□□□□□ -1.27
CUL3-211ENST00000487558 KLHL36Q8N4N3 616 aa7.11□□□□□ -1.27
CUL3-211ENST00000487558 SH2D3CQ8N5H7 860 aa7.11□□□□□ -1.27
CUL3-211ENST00000487558 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa7.11□□□□□ -1.27
CUL3-211ENST00000487558 PHKBQ93100 1093 aa7.11□□□□□ -1.27
CUL3-211ENST00000487558 C22orf23Q9BZE7 217 aa7.11□□□□□ -1.27
CUL3-211ENST00000487558 BTBD1Q9H0C5 482 aa7.11□□□□□ -1.27
CUL3-211ENST00000487558 SLC6A15Q9H2J7 730 aa7.11□□□□□ -1.27
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