RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487538.1

GTPBP1-211, Transcript of GTP binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene GTPBP1, Length 358 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP1-211ENST00000487538 CTIFO43310 598 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
GTPBP1-211ENST00000487538 ZEB2O60315 1214 aa11.21□□□□□ -0.61
GTPBP1-211ENST00000487538 F2P00734 622 aa11.21□□□□□ -0.61
GTPBP1-211ENST00000487538 FAM228BP0C875 321 aa11.21□□□□□ -0.61
GTPBP1-211ENST00000487538 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
GTPBP1-211ENST00000487538 CPT1AP50416 773 aa11.21□□□□□ -0.61
GTPBP1-211ENST00000487538 MFAP3P55082 362 aa11.21□□□□□ -0.61
GTPBP1-211ENST00000487538 TUBB2AQ13885 445 aa11.21□□□□□ -0.61
GTPBP1-211ENST00000487538 FAM187BQ17R55 369 aa11.21□□□□□ -0.61
GTPBP1-211ENST00000487538 ARHGAP44Q17R89 818 aa11.21□□□□□ -0.61
GTPBP1-211ENST00000487538 TMEM132AQ24JP5 1023 aa11.21□□□□□ -0.61
GTPBP1-211ENST00000487538 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa11.21□□□□□ -0.61
GTPBP1-211ENST00000487538 ATF7IP2Q5U623 682 aa11.21□□□□□ -0.61
GTPBP1-211ENST00000487538 MPZL3Q6UWV2 235 aa11.21□□□□□ -0.61
GTPBP1-211ENST00000487538 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa11.21□□□□□ -0.61
GTPBP1-211ENST00000487538 ZBTB33Q86T24 672 aa11.21□□□□□ -0.61
GTPBP1-211ENST00000487538 BRSK2Q8IWQ3 736 aa11.21□□□□□ -0.61
GTPBP1-211ENST00000487538 TAS1R2Q8TE23 839 aa11.21□□□□□ -0.61
GTPBP1-211ENST00000487538 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
GTPBP1-211ENST00000487538 FAM81BQ96LP2 452 aa11.21□□□□□ -0.61
GTPBP1-211ENST00000487538 TUBB2BQ9BVA1 445 aa11.21□□□□□ -0.61
GTPBP1-211ENST00000487538 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa11.21□□□□□ -0.61
GTPBP1-211ENST00000487538 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP11.21□□□□□ -0.61
GTPBP1-211ENST00000487538 AP5M1Q9H0R1 490 aa11.21□□□□□ -0.61
GTPBP1-211ENST00000487538 PDE11AQ9HCR9 933 aa11.21□□□□□ -0.61
GTPBP1-211ENST00000487538 RAB20Q9NX57 234 aa11.21□□□□□ -0.61
GTPBP1-211ENST00000487538 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa11.21□□□□□ -0.61
GTPBP1-211ENST00000487538 TNFSF13BQ9Y275 285 aa11.21□□□□□ -0.61
GTPBP1-211ENST00000487538 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa11.2□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 MACROD2A1Z1Q3 448 aa11.2□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 TTLL13PA6NNM8 815 aa11.2□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 ABLIM1O14639 778 aa11.2□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 FAM189A1O60320 539 aa11.2□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 LRRN2O75325 713 aa11.2□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 TACC1O75410 805 aa11.2□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 TNNI1P19237 187 aa11.2□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 PROZP22891 400 aa11.2□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 PIK3CAP42336 1068 aa11.2□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 AP3M2P53677 418 aa11.2□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 WNT7BP56706 349 aa11.2□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 SURF1Q15526 300 aa11.2□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 NAB2Q15742 525 aa11.2□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF568Q3ZCX4 644 aa11.2□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 ZACNQ401N2 412 aa11.2□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 MARCH8Q5T0T0 291 aa11.2□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa11.2□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF410Q86VK4 478 aa11.2□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 PPM1KQ8N3J5 372 aa11.2□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF516Q92618 1163 aa11.2□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 IFT122Q9HBG6 1241 aa11.2□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 C1orf112Q9NSG2 853 aa11.2□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 NAGPAQ9UK23 515 aa11.2□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 NENFQ9UMX5 172 aa11.2□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 MRFAP1Q9Y605 127 aa11.2□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 PTPRJQ12913 1337 aa11.19□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 NRCAMQ92823 1304 aa11.19□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 A0A087WZ62 844 aa11.19□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP11.19□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 B4GALT5O43286 388 aa11.19□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 SGPL1O95470 568 aa11.19□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 HLA-DRAP01903 254 aa11.19□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 VTNP04004 478 aa11.19□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa11.19□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa11.19□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 AKR1A1P14550 325 aa11.19□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 PSEN2P49810 448 aa11.19□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 BIRC3Q13489 604 aa11.19□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 MFSD10Q14728 455 aa11.19□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 KIAA0753Q2KHM9 967 aa11.19□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 WDR44Q5JSH3 913 aa11.19□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 MFSD14CQ5VZR4 134 aa11.19□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 EEF1DP3Q658K8 133 aa11.19□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 WDR49Q8IV35 697 aa11.19□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 FAM71AQ8IYT1 594 aa11.19□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 MNS1Q8NEH6 495 aa11.19□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 TRIM58Q8NG06 486 aa11.19□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 HELQQ8TDG4 1101 aa11.19□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 LMBR1Q8WVP7 490 aa11.19□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 NLRP7Q8WX94 980 aa11.19□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 SHC3Q92529 594 aa11.19□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 KAT2BQ92831 832 aa11.19□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 KREMEN1Q96MU8 473 aa11.19□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 SCLT1Q96NL6 688 aa11.19□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 NOX5Q96PH1 765 aa11.19□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 DEFB118Q96PH6 123 aa11.19□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 ALS2CR12Q96Q35 445 aa11.19□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 SYT11Q9BT88 431 aa11.19□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 KATNAL1Q9BW62 490 aa11.19□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 MINDY3Q9H8M7 445 aa11.19□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 PTPRHQ9HD43 1115 aa11.19□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 SETD4Q9NVD3 440 aa11.19□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
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