RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484135.1

PTPRC-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-211ENST00000484135 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 TESMINQ9Y4I5 508 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 TJP1Q07157 1748 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 SDSP20132 328 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 ACO1P21399 889 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 CRKLP46109 303 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 RGS3P49796 1198 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 ADAM15Q13444 863 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 SLFN12LQ6IEE8 588 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 COPS6Q7L5N1 327 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 OR5AN1Q8NGI8 311 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 CFHR4Q92496 578 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 FAM89AQ96GI7 184 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 MSL2Q9HCI7 577 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 TRAF5O00463 557 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 DVL2O14641 736 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 PLSCR1O15162 318 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 MAFO75444 373 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 AMHP03971 560 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 HOXB7P09629 217 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 TRIM27P14373 513 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 DUSP8Q13202 625 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 CFAP100Q494V2 611 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 TTC38Q5R3I4 469 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 GIMAP6Q6P9H5 292 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 KLHDC10Q6PID8 442 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 CRIP3Q6Q6R5 217 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 SLC4A10Q6U841 1118 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 EDAQ92838 391 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 MAML3Q96JK9 1138 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 CAMKK2Q96RR4 588 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF747Q9BV97 191 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 PIF1Q9H611 641 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 B4GALT6Q9UBX8 382 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 LY75O60449 1722 aa5.9□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 LAMB4A4D0S4 1761 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 PI4KAP2A4QPH2 592 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 CBX4O00257 560 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 SLC26A4O43511 780 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 CYP17A1P05093 508 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 TCEA2Q15560 299 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 HLFQ16534 295 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 NRN1LQ496H8 165 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 USP51Q70EK9 711 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM57Q8N5G2 664 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 SHCBP1Q8NEM2 672 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM176AQ96HP8 235 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF341Q9BYN7 854 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 HYPKQ9NX55 129 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 DENND2AQ9ULE3 1009 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 VWA7Q9Y334 891 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 TAF1LQ8IZX4 1826 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 CYR61O00622 381 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 RFPL3O75679 317 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 SLC9A1P19634 815 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 GPTP24298 496 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 EIF5P55010 431 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 HHEXQ03014 270 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 FOXL1Q12952 345 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 DGKDQ16760 1214 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 KSR2Q6VAB6 950 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 RNF207Q6ZRF8 634 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 HOMER1Q86YM7 354 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 SYNPOQ8N3V7 929 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 C7orf31Q8N865 590 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 EXOC6Q8TAG9 804 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 LPPQ93052 612 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 MYD88Q99836 296 aa5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms