RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482015.5

UPP1-211, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene UPP1, Length 861 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-211ENST00000482015 HARSP12081 509 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
UPP1-211ENST00000482015 SYT1P21579 422 aa20.6■□□□□ 0.89
UPP1-211ENST00000482015 PROZP22891 400 aa20.6■□□□□ 0.89
UPP1-211ENST00000482015 LONP1P36776 959 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
UPP1-211ENST00000482015 SMTNP53814 917 aa20.6■□□□□ 0.89
UPP1-211ENST00000482015 YARSP54577 528 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
UPP1-211ENST00000482015 STRN3Q13033 797 aa20.6■□□□□ 0.89
UPP1-211ENST00000482015 KARSQ15046 597 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
UPP1-211ENST00000482015 FAM173BQ6P4H8 233 aa20.6■□□□□ 0.89
UPP1-211ENST00000482015 TTPALQ9BTX7 342 aa20.6■□□□□ 0.89
UPP1-211ENST00000482015 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
UPP1-211ENST00000482015 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa20.6■□□□□ 0.89
UPP1-211ENST00000482015 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa20.6■□□□□ 0.89
UPP1-211ENST00000482015 FNIP2Q9P278 1114 aa20.6■□□□□ 0.89
UPP1-211ENST00000482015 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa20.59■□□□□ 0.89
UPP1-211ENST00000482015 TMEM221A6NGB7 291 aa20.59■□□□□ 0.89
UPP1-211ENST00000482015 M0R296 226 aa20.59■□□□□ 0.89
UPP1-211ENST00000482015 SLC26A4O43511 780 aa20.59■□□□□ 0.89
UPP1-211ENST00000482015 TGM5O43548 720 aa20.59■□□□□ 0.89
UPP1-211ENST00000482015 RFPL2O75678 378 aa20.59■□□□□ 0.89
UPP1-211ENST00000482015 MAPTP10636 758 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
UPP1-211ENST00000482015 MCF2P10911 925 aa20.59■□□□□ 0.89
UPP1-211ENST00000482015 PLCG1P19174 1290 aa20.59■□□□□ 0.89
UPP1-211ENST00000482015 CLCNKBP51801 687 aa20.59■□□□□ 0.89
UPP1-211ENST00000482015 MPZL3Q6UWV2 235 aa20.59■□□□□ 0.89
UPP1-211ENST00000482015 ALKAL1Q6UXT8 129 aa20.59■□□□□ 0.89
UPP1-211ENST00000482015 GPBP1Q86WP2 473 aa20.59■□□□□ 0.89
UPP1-211ENST00000482015 GPR65Q8IYL9 337 aa20.59■□□□□ 0.89
UPP1-211ENST00000482015 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
UPP1-211ENST00000482015 RASSF8Q8NHQ8 419 aa20.59■□□□□ 0.89
UPP1-211ENST00000482015 REEP2Q9BRK0 252 aa20.59■□□□□ 0.89
UPP1-211ENST00000482015 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
UPP1-211ENST00000482015 LIMD1Q9UGP4 676 aa20.59■□□□□ 0.89
UPP1-211ENST00000482015 KCNG1Q9UIX4 513 aa20.59■□□□□ 0.89
UPP1-211ENST00000482015 B3GAT3O94766 335 aa20.58■□□□□ 0.89
UPP1-211ENST00000482015 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
UPP1-211ENST00000482015 RESTQ13127 1097 aa20.58■□□□□ 0.89
UPP1-211ENST00000482015 MCM6Q14566 821 aa20.58■□□□□ 0.89
UPP1-211ENST00000482015 SEZ6Q53EL9 994 aa20.58■□□□□ 0.89
UPP1-211ENST00000482015 XKR4Q5GH76 650 aa20.58■□□□□ 0.89
UPP1-211ENST00000482015 SPECC1Q5M775 1068 aa20.58■□□□□ 0.89
UPP1-211ENST00000482015 LILRA6Q6PI73 481 aa20.58■□□□□ 0.89
UPP1-211ENST00000482015 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa20.58■□□□□ 0.89
UPP1-211ENST00000482015 KREMEN2Q8NCW0 462 aa20.58■□□□□ 0.89
UPP1-211ENST00000482015 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
UPP1-211ENST00000482015 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
UPP1-211ENST00000482015 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
UPP1-211ENST00000482015 ACAP3Q96P50 834 aa20.58■□□□□ 0.89
UPP1-211ENST00000482015 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
UPP1-211ENST00000482015 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
UPP1-211ENST00000482015 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa20.58■□□□□ 0.89
UPP1-211ENST00000482015 DPP7Q9UHL4 492 aa20.58■□□□□ 0.89
UPP1-211ENST00000482015 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
UPP1-211ENST00000482015 TOM1L1O75674 476 aa20.57■□□□□ 0.88
UPP1-211ENST00000482015 BRD1O95696 1058 aa20.57■□□□□ 0.88
UPP1-211ENST00000482015 ASGR2P07307 311 aa20.57■□□□□ 0.88
UPP1-211ENST00000482015 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
UPP1-211ENST00000482015 CREMQ03060 361 aa20.57■□□□□ 0.88
UPP1-211ENST00000482015 SIGLEC14Q08ET2 396 aa20.57■□□□□ 0.88
UPP1-211ENST00000482015 PTPAQ15257 358 aa20.57■□□□□ 0.88
UPP1-211ENST00000482015 PSMD5Q16401 504 aa20.57■□□□□ 0.88
UPP1-211ENST00000482015 UPP1Q16831 310 aa20.57■□□□□ 0.88
UPP1-211ENST00000482015 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa20.57■□□□□ 0.88
UPP1-211ENST00000482015 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa20.57■□□□□ 0.88
UPP1-211ENST00000482015 CD300LGQ6UXG3 332 aa20.57■□□□□ 0.88
UPP1-211ENST00000482015 CCDC149Q6ZUS6 474 aa20.57■□□□□ 0.88
UPP1-211ENST00000482015 USP49Q70CQ1 688 aa20.57■□□□□ 0.88
UPP1-211ENST00000482015 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa20.57■□□□□ 0.88
UPP1-211ENST00000482015 C3orf58Q8NDZ4 430 aa20.57■□□□□ 0.88
UPP1-211ENST00000482015 PIK3R5Q8WYR1 880 aa20.57■□□□□ 0.88
UPP1-211ENST00000482015 RAD54LQ92698 747 aa20.57■□□□□ 0.88
UPP1-211ENST00000482015 PBXIP1Q96AQ6 731 aa20.57■□□□□ 0.88
UPP1-211ENST00000482015 FAM122AQ96E09 287 aa20.57■□□□□ 0.88
UPP1-211ENST00000482015 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
UPP1-211ENST00000482015 EPSTI1Q96J88 318 aa20.57■□□□□ 0.88
UPP1-211ENST00000482015 SNX27Q96L92 541 aa20.57■□□□□ 0.88
UPP1-211ENST00000482015 CLSTN3Q9BQT9 956 aa20.57■□□□□ 0.88
UPP1-211ENST00000482015 USTQ9Y2C2 406 aa20.57■□□□□ 0.88
UPP1-211ENST00000482015 PLA2G5P39877 138 aa20.56■□□□□ 0.88
UPP1-211ENST00000482015 NCKAP1LP55160 1127 aa20.56■□□□□ 0.88
UPP1-211ENST00000482015 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
UPP1-211ENST00000482015 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
UPP1-211ENST00000482015 HAUS6Q7Z4H7 955 aa20.56■□□□□ 0.88
UPP1-211ENST00000482015 MYCT1Q8N699 235 aa20.56■□□□□ 0.88
UPP1-211ENST00000482015 HDAC7Q8WUI4 952 aa20.56■□□□□ 0.88
UPP1-211ENST00000482015 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
UPP1-211ENST00000482015 MFSD14AQ96MC6 490 aa20.56■□□□□ 0.88
UPP1-211ENST00000482015 UROC1Q96N76 676 aa20.56■□□□□ 0.88
UPP1-211ENST00000482015 SMOC2Q9H3U7 446 aa20.56■□□□□ 0.88
UPP1-211ENST00000482015 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa20.56■□□□□ 0.88
UPP1-211ENST00000482015 ODF2LQ9ULJ1 636 aa20.56■□□□□ 0.88
UPP1-211ENST00000482015 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
UPP1-211ENST00000482015 TECTAO75443 2155 aa20.56■□□□□ 0.88
UPP1-211ENST00000482015 TRIOO75962 3097 aa20.56■□□□□ 0.88
UPP1-211ENST00000482015 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa20.55■□□□□ 0.88
UPP1-211ENST00000482015 I3L4J1 428 aa20.55■□□□□ 0.88
UPP1-211ENST00000482015 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
UPP1-211ENST00000482015 ADAM12O43184 909 aa20.55■□□□□ 0.88
UPP1-211ENST00000482015 C1RP00736 705 aa20.55■□□□□ 0.88
UPP1-211ENST00000482015 KRT18P05783 430 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.9 ms