RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481121.5

NELFE-208, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 2

Gene NELFE, Length 1,543 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-208ENST00000481121 F8W810 466 aa22.72■■□□□ 1.23
NELFE-208ENST00000481121 PPP1R37O75864 691 aa22.72■■□□□ 1.23
NELFE-208ENST00000481121 PFKFB1P16118 471 aa22.72■■□□□ 1.23
NELFE-208ENST00000481121 CMA1P23946 247 aa22.72■■□□□ 1.23
NELFE-208ENST00000481121 NDUFV1P49821 464 aa22.72■■□□□ 1.23
NELFE-208ENST00000481121 ASIC1P78348 528 aa22.72■■□□□ 1.23
NELFE-208ENST00000481121 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
NELFE-208ENST00000481121 NAB2Q15742 525 aa22.72■■□□□ 1.23
NELFE-208ENST00000481121 SEZ6Q53EL9 994 aa22.72■■□□□ 1.23
NELFE-208ENST00000481121 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
NELFE-208ENST00000481121 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
NELFE-208ENST00000481121 C5orf42Q9H799 3197 aa22.72■■□□□ 1.23
NELFE-208ENST00000481121 VWA8A3KMH1 1905 aa22.72■■□□□ 1.23
NELFE-208ENST00000481121 C2orf71A6NGG8 1288 aa22.72■■□□□ 1.23
NELFE-208ENST00000481121 H3BQ06 376 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
NELFE-208ENST00000481121 TBX10O75333 385 aa22.72■■□□□ 1.23
NELFE-208ENST00000481121 SOD2P04179 222 aa22.72■■□□□ 1.23
NELFE-208ENST00000481121 COASYQ13057 564 aa22.72■■□□□ 1.23
NELFE-208ENST00000481121 ALCAMQ13740 583 aa22.72■■□□□ 1.23
NELFE-208ENST00000481121 LEXMQ3ZCV2 418 aa22.72■■□□□ 1.23
NELFE-208ENST00000481121 SLC39A4Q6P5W5 647 aa22.72■■□□□ 1.23
NELFE-208ENST00000481121 CEP57L1Q8IYX8 460 aa22.72■■□□□ 1.23
NELFE-208ENST00000481121 AUTS2Q8WXX7 1259 aa22.72■■□□□ 1.23
NELFE-208ENST00000481121 RABGGTAQ92696 567 aa22.72■■□□□ 1.23
NELFE-208ENST00000481121 PAAF1Q9BRP4 392 aa22.72■■□□□ 1.23
NELFE-208ENST00000481121 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa22.72■■□□□ 1.23
NELFE-208ENST00000481121 ADAM28Q9UKQ2 775 aa22.72■■□□□ 1.23
NELFE-208ENST00000481121 PLXNA3P51805 1871 aa22.71■■□□□ 1.23
NELFE-208ENST00000481121 CUL9Q8IWT3 2517 aa22.71■■□□□ 1.23
NELFE-208ENST00000481121 A0A1B0GVL5 298 aa22.71■■□□□ 1.23
NELFE-208ENST00000481121 CXCL14O95715 111 aa22.71■■□□□ 1.23
NELFE-208ENST00000481121 LTBRP36941 435 aa22.71■■□□□ 1.23
NELFE-208ENST00000481121 ADAM15Q13444 863 aa22.71■■□□□ 1.23
NELFE-208ENST00000481121 KYAT1Q16773 422 aa22.71■■□□□ 1.23
NELFE-208ENST00000481121 XKR4Q5GH76 650 aa22.71■■□□□ 1.23
NELFE-208ENST00000481121 ALKAL1Q6UXT8 129 aa22.71■■□□□ 1.23
NELFE-208ENST00000481121 MSTO1Q9BUK6 570 aa22.71■■□□□ 1.23
NELFE-208ENST00000481121 STRA6Q9BX79 667 aa22.71■■□□□ 1.23
NELFE-208ENST00000481121 GDPD2Q9HCC8 539 aa22.71■■□□□ 1.23
NELFE-208ENST00000481121 CNTN3Q9P232 1028 aa22.71■■□□□ 1.23
NELFE-208ENST00000481121 EXOC7Q9UPT5 735 aa22.71■■□□□ 1.23
NELFE-208ENST00000481121 IRAK3Q9Y616 596 aa22.71■■□□□ 1.23
NELFE-208ENST00000481121 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa22.7■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 OGTO15294 1046 aa22.7■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 GLP2RO95838 553 aa22.7■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 URODP06132 367 aa22.7■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 CLTAP09496 248 aa22.7■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 CXCL8P10145 99 aa22.7■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 MYBP10242 640 aa22.7■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 CASP5P51878 434 aa22.7■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 PTPN14Q15678 1187 aa22.7■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 FUT10Q6P4F1 479 aa22.7■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 CNNM4Q6P4Q7 775 aa22.7■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 TMEM87AQ8NBN3 555 aa22.7■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 C7orf25Q9BPX7 421 aa22.7■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 SLC38A7Q9NVC3 462 aa22.7■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 SERTAD1Q9UHV2 236 aa22.7■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa22.7■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP22.7■■□□□ 1.221e-19■■■■■ 448
NELFE-208ENST00000481121 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 A0A0B4J269 797 aa22.69■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 TADA2AO75478 443 aa22.69■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 KIF4AO95239 1232 aa22.69■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 SRGAP2BP0DMP2 458 aa22.69■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 TNFSF9P41273 254 aa22.69■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 AFMP43652 599 aa22.69■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 TPRNQ4KMQ1 711 aa22.69■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa22.69■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 HASPINQ8TF76 798 aa22.69■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 UROC1Q96N76 676 aa22.69■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 ACCSQ96QU6 501 aa22.69■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa22.69■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 HPSEQ9Y251 543 aa22.69■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 TISP43B9A030 160 aa22.68■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 ANKRD63C9JTQ0 380 aa22.68■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 FAM189A1O60320 539 aa22.68■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 EFEMP2O95967 443 aa22.68■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 SLFN14P0C7P3 912 aa22.68■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 KCNE1P15382 129 aa22.68■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 GLUD2P49448 558 aa22.68■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 PPP2R3AQ06190 1150 aa22.68■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 KCNA1Q09470 495 aa22.68■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 SLC10A6Q3KNW5 377 aa22.68■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 SLFN12LQ6IEE8 588 aa22.68■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 BLZF1Q9H2G9 400 aa22.68■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa22.68■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 A0A1W2PQ27 194 aa22.67■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 A0A1W2PQ64 194 aa22.67■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 A0A1W2PQD8 194 aa22.67■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 C2CD2LO14523 706 aa22.67■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 BMP1P13497 986 aa22.67■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 CASP1P29466 404 aa22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.9 ms