RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
ACTB-211ENST00000480301 DUSP6Q16828 381 aa22.9■■□□□ 1.26
ACTB-211ENST00000480301 GLRA4Q5JXX5 417 aa22.9■■□□□ 1.26
ACTB-211ENST00000480301 CCDC65Q8IXS2 484 aa22.9■■□□□ 1.26
ACTB-211ENST00000480301 AUTS2Q8WXX7 1259 aa22.9■■□□□ 1.26
ACTB-211ENST00000480301 HVCN1Q96D96 273 aa22.9■■□□□ 1.26
ACTB-211ENST00000480301 SNX27Q96L92 541 aa22.9■■□□□ 1.26
ACTB-211ENST00000480301 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
ACTB-211ENST00000480301 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa22.9■■□□□ 1.26
ACTB-211ENST00000480301 GDPD2Q9HCC8 539 aa22.9■■□□□ 1.26
ACTB-211ENST00000480301 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
ACTB-211ENST00000480301 STK39Q9UEW8 545 aa22.9■■□□□ 1.26
ACTB-211ENST00000480301 SERTAD1Q9UHV2 236 aa22.9■■□□□ 1.26
ACTB-211ENST00000480301 IRAK3Q9Y616 596 aa22.9■■□□□ 1.26
ACTB-211ENST00000480301 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa22.89■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 CASTOR2A6NHX0 329 aa22.89■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 H3BQ06 376 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 FAM189A1O60320 539 aa22.89■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 MYBP10242 640 aa22.89■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 BMP1P13497 986 aa22.89■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP22.89■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 CASP5P51878 434 aa22.89■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 KCNA1Q09470 495 aa22.89■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 COASYQ13057 564 aa22.89■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 SLC10A6Q3KNW5 377 aa22.89■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 LEXMQ3ZCV2 418 aa22.89■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 EP400NLQ6ZTU2 488 aa22.89■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 TAS1R1Q7RTX1 841 aa22.89■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 VN1R2Q8NFZ6 395 aa22.89■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 IKZF4Q9H2S9 585 aa22.89■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 CNTN3Q9P232 1028 aa22.89■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 STYXL1Q9Y6J8 313 aa22.89■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 A0A0B4J269 797 aa22.88■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 TISP43B9A030 160 aa22.88■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 GLP2RO95838 553 aa22.88■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 SOD2P04179 222 aa22.88■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 KCNC3Q14003 757 aa22.88■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa22.88■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa22.88■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 TCHHQ07283 1943 aa22.87■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 LILRB3O75022 631 aa22.87■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 TBX10O75333 385 aa22.87■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 GCNT3O95395 438 aa22.87■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 CLTAP09496 248 aa22.87■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 SLFN14P0C7P3 912 aa22.87■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 KCNE1P15382 129 aa22.87■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 CASP1P29466 404 aa22.87■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 TNFSF9P41273 254 aa22.87■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 ASIC1P78348 528 aa22.87■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 RBM10P98175 930 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 PTPN14Q15678 1187 aa22.87■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa22.87■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 HPS3Q969F9 1004 aa22.87■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 ACCSQ96QU6 501 aa22.87■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 GPR62Q9BZJ7 368 aa22.87■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 BLZF1Q9H2G9 400 aa22.87■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 CLEC1BQ9P126 229 aa22.87■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 ADAM28Q9UKQ2 775 aa22.87■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 A0A1W2PQ27 194 aa22.86■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 A0A1W2PQ64 194 aa22.86■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 A0A1W2PQD8 194 aa22.86■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 OGTO15294 1046 aa22.86■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 TADA2AO75478 443 aa22.86■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 CXCL8P10145 99 aa22.86■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 CA8P35219 290 aa22.86■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 AFMP43652 599 aa22.86■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 ALCAMQ13740 583 aa22.86■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 FUT10Q6P4F1 479 aa22.86■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa22.86■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 CEP57L1Q8IYX8 460 aa22.86■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 MSTO1Q9BUK6 570 aa22.86■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa22.86■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 KIF4AO95239 1232 aa22.85■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 ADSSP30520 456 aa22.85■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 NDUFV1P49821 464 aa22.85■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 NDUFA8P51970 172 aa22.85■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 EHHADHQ08426 723 aa22.85■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 CUL4BQ13620 913 aa22.85■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 KYAT1Q16773 422 aa22.85■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 KIAA0319Q5VV43 1072 aa22.85■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 SLFN12LQ6IEE8 588 aa22.85■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 CD300LGQ6UXG3 332 aa22.85■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa22.85■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 UNC13DQ70J99 1090 aa22.85■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 GLIS3Q8NEA6 775 aa22.85■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 PAGE5Q96GU1 130 aa22.85■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 MSLNLQ96KJ4 702 aa22.85■■□□□ 1.25
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