RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478095.1

HDAC6-222, Transcript of histone deacetylase 6, human

TSL 4

Gene HDAC6, Length 620 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC6-222	ENST00000478095	SNW1	Q13573	536 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
HDAC6-222	ENST00000478095	KMT5B	Q4FZB7	885 aa		11.22	□□□□□ -0.61
HDAC6-222	ENST00000478095	NELFCD	Q8IXH7	590 aa		11.22	□□□□□ -0.61
HDAC6-222	ENST00000478095	SYCP3	Q8IZU3	236 aa		11.22	□□□□□ -0.61
HDAC6-222	ENST00000478095	SLC39A11	Q8N1S5	342 aa		11.22	□□□□□ -0.61
HDAC6-222	ENST00000478095	TMEM87A	Q8NBN3	555 aa		11.22	□□□□□ -0.61
HDAC6-222	ENST00000478095	ENGASE	Q8NFI3	743 aa		11.22	□□□□□ -0.61
HDAC6-222	ENST00000478095	MAFA	Q8NHW3	353 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
HDAC6-222	ENST00000478095	BCL7C	Q8WUZ0	217 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
HDAC6-222	ENST00000478095	POF1B	Q8WVV4	589 aa		11.22	□□□□□ -0.61
HDAC6-222	ENST00000478095	RSPH1	Q8WYR4	309 aa		11.22	□□□□□ -0.61
HDAC6-222	ENST00000478095	RABGGTA	Q92696	567 aa		11.22	□□□□□ -0.61
HDAC6-222	ENST00000478095	P2RX5	Q93086	422 aa		11.22	□□□□□ -0.61
HDAC6-222	ENST00000478095	SNX27	Q96L92	541 aa		11.22	□□□□□ -0.61
HDAC6-222	ENST00000478095	ACAP3	Q96P50	834 aa		11.22	□□□□□ -0.61
HDAC6-222	ENST00000478095	KANSL3	Q9P2N6	904 aa		11.22	□□□□□ -0.61
HDAC6-222	ENST00000478095	EXOC7	Q9UPT5	735 aa		11.22	□□□□□ -0.61
HDAC6-222	ENST00000478095	PRG3	Q9Y2Y8	225 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
HDAC6-222	ENST00000478095	PCDHGC5	Q9Y5F6	944 aa		11.22	□□□□□ -0.61
HDAC6-222	ENST00000478095		A0A0B4J269	797 aa		11.21	□□□□□ -0.61
HDAC6-222	ENST00000478095	CASTOR2	A6NHX0	329 aa		11.21	□□□□□ -0.61
HDAC6-222	ENST00000478095		F8W810	466 aa		11.21	□□□□□ -0.61
HDAC6-222	ENST00000478095	TULP1	O00294	542 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
HDAC6-222	ENST00000478095	FAM189A1	O60320	539 aa		11.21	□□□□□ -0.61
HDAC6-222	ENST00000478095	PRPF40A	O75400	957 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
HDAC6-222	ENST00000478095	RPN1	P04843	607 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
HDAC6-222	ENST00000478095	CXCL8	P10145	99 aa		11.21	□□□□□ -0.61
HDAC6-222	ENST00000478095	ADSS	P30520	456 aa		11.21	□□□□□ -0.61
HDAC6-222	ENST00000478095	IRS1	P35568	1242 aa		11.21	□□□□□ -0.61
HDAC6-222	ENST00000478095	DPYD	Q12882	1025 aa		11.21	□□□□□ -0.61
HDAC6-222	ENST00000478095	GRIK3	Q13003	919 aa		11.21	□□□□□ -0.61
HDAC6-222	ENST00000478095	STK4	Q13043	487 aa		11.21	□□□□□ -0.61
HDAC6-222	ENST00000478095	PNOC	Q13519	176 aa		11.21	□□□□□ -0.61
HDAC6-222	ENST00000478095	ALCAM	Q13740	583 aa		11.21	□□□□□ -0.61
HDAC6-222	ENST00000478095	POSTN	Q15063	836 aa		11.21	□□□□□ -0.61
HDAC6-222	ENST00000478095	PTPRO	Q16827	1216 aa		11.21	□□□□□ -0.61
HDAC6-222	ENST00000478095	STXBP4	Q6ZWJ1	553 aa		11.21	□□□□□ -0.61
HDAC6-222	ENST00000478095	COLGALT2	Q8IYK4	626 aa		11.21	□□□□□ -0.61
HDAC6-222	ENST00000478095	SPPL3	Q8TCT6	385 aa		11.21	□□□□□ -0.61
HDAC6-222	ENST00000478095	POMGNT1	Q8WZA1	660 aa		11.21	□□□□□ -0.61
HDAC6-222	ENST00000478095	ERCC4	Q92889	916 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
HDAC6-222	ENST00000478095	MARVELD3	Q96A59	401 aa		11.21	□□□□□ -0.61
HDAC6-222	ENST00000478095	MRPL38	Q96DV4	380 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
HDAC6-222	ENST00000478095	TOPORS	Q9NS56	1045 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
HDAC6-222	ENST00000478095	SPG21	Q9NZD8	308 aa		11.21	□□□□□ -0.61
HDAC6-222	ENST00000478095	ZMYM2	Q9UBW7	1377 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HDAC6-222	ENST00000478095	SMIM28	A0A1B0GU29	152 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HDAC6-222	ENST00000478095	NRP1	O14786	923 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HDAC6-222	ENST00000478095	OGT	O15294	1046 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HDAC6-222	ENST00000478095	MYL1	P05976	194 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HDAC6-222	ENST00000478095	TH	P07101	528 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HDAC6-222	ENST00000478095	CLTA	P09496	248 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HDAC6-222	ENST00000478095	HOXD13	P35453	343 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HDAC6-222	ENST00000478095	PPM1A	P35813	382 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HDAC6-222	ENST00000478095	ACOT2	P49753	483 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HDAC6-222	ENST00000478095	EMP3	P54852	163 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HDAC6-222	ENST00000478095	SPAG1	Q07617	926 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HDAC6-222	ENST00000478095	DSC1	Q08554	894 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HDAC6-222	ENST00000478095	CAMK1	Q14012	370 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HDAC6-222	ENST00000478095	SLC10A6	Q3KNW5	377 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HDAC6-222	ENST00000478095	EPM2AIP1	Q7L775	607 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
HDAC6-222	ENST00000478095	KIAA0895	Q8NCT3	520 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HDAC6-222	ENST00000478095	ZSWIM2	Q8NEG5	633 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HDAC6-222	ENST00000478095	NOC3L	Q8WTT2	800 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
HDAC6-222	ENST00000478095	SCFD1	Q8WVM8	642 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HDAC6-222	ENST00000478095	SAAL1	Q96ER3	474 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HDAC6-222	ENST00000478095	TMEM169	Q96HH4	297 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HDAC6-222	ENST00000478095	ZMAT2	Q96NC0	199 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
HDAC6-222	ENST00000478095	PAAF1	Q9BRP4	392 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HDAC6-222	ENST00000478095	CBWD1	Q9BRT8	395 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HDAC6-222	ENST00000478095	TMEM175	Q9BSA9	504 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HDAC6-222	ENST00000478095	PCIF1	Q9H4Z3	704 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HDAC6-222	ENST00000478095	TMEM206	Q9H813	350 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HDAC6-222	ENST00000478095	GOLGA2P5	Q9HBQ8	144 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HDAC6-222	ENST00000478095	AGO2	Q9UKV8	859 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
HDAC6-222	ENST00000478095	FAN1	Q9Y2M0	1017 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HDAC6-222	ENST00000478095	GOLGA8IP	A6NC78	632 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HDAC6-222	ENST00000478095	GOLGA8J	A6NMD2	632 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HDAC6-222	ENST00000478095	EIF3D	O15371	548 aa	Known RBP eCLIP	11.19	□□□□□ -0.62
HDAC6-222	ENST00000478095	KIN	O60870	393 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
HDAC6-222	ENST00000478095	SLC34A2	O95436	690 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HDAC6-222	ENST00000478095	ALDH2	P05091	517 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HDAC6-222	ENST00000478095	POU3F3	P20264	500 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
HDAC6-222	ENST00000478095	CA8	P35219	290 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HDAC6-222	ENST00000478095	ERVFC1	P60507	584 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HDAC6-222	ENST00000478095	UBE2H	P62256	183 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HDAC6-222	ENST00000478095	PLCB3	Q01970	1234 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HDAC6-222	ENST00000478095	KRT17	Q04695	432 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HDAC6-222	ENST00000478095	TUSC3	Q13454	348 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HDAC6-222	ENST00000478095	SKIV2L	Q15477	1246 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
HDAC6-222	ENST00000478095	NAB2	Q15742	525 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HDAC6-222	ENST00000478095	ENOX2	Q16206	610 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
HDAC6-222	ENST00000478095	SLFN12L	Q6IEE8	588 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HDAC6-222	ENST00000478095	KANK3	Q6NY19	840 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HDAC6-222	ENST00000478095	ARMCX5	Q6P1M9	558 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HDAC6-222	ENST00000478095	ALKAL1	Q6UXT8	129 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HDAC6-222	ENST00000478095	TMEM130	Q8N3G9	435 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HDAC6-222	ENST00000478095	ZNF507	Q8TCN5	953 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HDAC6-222	ENST00000478095	MICAL1	Q8TDZ2	1067 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HDAC6-222	ENST00000478095	HASPIN	Q8TF76	798 aa		11.19	□□□□□ -0.62

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