RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474188.1

NISCH-206, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 564 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-206ENST00000474188 FAM187BQ17R55 369 aa12.01□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 GLRA4Q5JXX5 417 aa12.01□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa12.01□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 CEP120Q8N960 986 aa12.01□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 FGF13Q92913 245 aa12.01□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa12.01□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP12.01□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 MARCH6O60337 910 aa12□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 CDKL5O76039 1030 aa12□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 BAG4O95429 457 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 SEC24BO95487 1268 aa12□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 C8AP07357 584 aa12□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 ATP2B1P20020 1258 aa12□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 CD72P21854 359 aa12□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 FSHRP23945 695 aa12□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 BRCC3P46736 316 aa12□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 ID4P47928 161 aa12□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 STARD6P59095 220 aa12□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 FZD5Q13467 585 aa12□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 NBR1Q14596 966 aa12□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 PSMD5Q16401 504 aa12□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 SLC5A9Q2M3M2 681 aa12□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa12□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 TAS1R3Q7RTX0 852 aa12□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 CEP57Q86XR8 500 aa12□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 C4orf32Q8N8J7 132 aa12□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 SUMF1Q8NBK3 374 aa12□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 STAMQ92783 540 aa12□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 TTPALQ9BTX7 342 aa12□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 PIDD1Q9HB75 910 aa12□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 PPP4R2Q9NY27 417 aa12□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 FANCMQ8IYD8 2048 aa11.99□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 F5P12259 2224 aa11.99□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 STK25O00506 426 aa11.99□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 NEMFO60524 1076 aa11.99□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP11.99□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 CYP11B2P19099 503 aa11.99□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 FGFR3P22607 806 aa11.99□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 MCM7P33993 719 aa11.99□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 RAB33AQ14088 237 aa11.99□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 ZNF174Q15697 407 aa11.99□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 PADI6Q6TGC4 694 aa11.99□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 NPAS3Q8IXF0 933 aa11.99□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 DAW1Q8N136 415 aa11.99□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 ZNF687Q8N1G0 1237 aa11.99□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 PJA1Q8NG27 643 aa11.99□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 NXPE3Q969Y0 559 aa11.99□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 KXD1Q9BQD3 176 aa11.99□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP11.99□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 CDH7Q9ULB5 785 aa11.99□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 GDAQ9Y2T3 454 aa11.99□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 SIT1Q9Y3P8 196 aa11.99□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 NCANO14594 1321 aa11.99□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa11.99□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 MYH15Q9Y2K3 1946 aa11.98□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP11.98□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 ACKR2O00590 384 aa11.98□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 ABLIM1O14639 778 aa11.98□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 TBC1D4O60343 1298 aa11.98□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 LMNAP02545 664 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 PRKCBP05771 671 aa11.98□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 LIG1P18858 919 aa11.98□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 TKTP29401 623 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 OR1D2P34982 312 aa11.98□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 CCR2P41597 374 aa11.98□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 CLCNKBP51801 687 aa11.98□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 IL17AQ16552 155 aa11.98□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 C1orf210Q8IVY1 113 aa11.98□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 KIAA2013Q8IYS2 634 aa11.98□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 SLC7A14Q8TBB6 771 aa11.98□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 ING5Q8WYH8 240 aa11.98□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 PRIMPOLQ96LW4 560 aa11.98□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 PTPRHQ9HD43 1115 aa11.98□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 TUFT1Q9NNX1 390 aa11.98□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 MTRRQ9UBK8 725 aa11.98□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 EPG5Q9HCE0 2579 aa11.98□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 TPRP12270 2363 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 MOSPD3O75425 235 aa11.97□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 SEC24AO95486 1093 aa11.97□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 THP07101 528 aa11.97□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP11.97□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 XBP1P17861 261 aa11.97□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 FCARP24071 287 aa11.97□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 TARSP26639 723 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 HOXC13P31276 330 aa11.97□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 UPP1Q16831 310 aa11.97□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 SLC44A4Q53GD3 710 aa11.97□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 XKR4Q5GH76 650 aa11.97□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 PRSS36Q5K4E3 855 aa11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.3 ms