RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466579.1

SDCCAG3-208, Transcript of Serologically defined colon cancer antigen 3, human

TSL 1 (best)

Gene SDCCAG3, Length 496 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SDCCAG3-208	ENST00000466579	KCNA1	Q09470	495 aa		10.35	□□□□□ -0.75
SDCCAG3-208	ENST00000466579	SNW1	Q13573	536 aa	Known RBP	10.35	□□□□□ -0.75
SDCCAG3-208	ENST00000466579	BMT2	Q1RMZ1	405 aa		10.35	□□□□□ -0.75
SDCCAG3-208	ENST00000466579	CTC1	Q2NKJ3	1217 aa		10.35	□□□□□ -0.75
SDCCAG3-208	ENST00000466579	SLC10A6	Q3KNW5	377 aa		10.35	□□□□□ -0.75
SDCCAG3-208	ENST00000466579	TCEAL5	Q5H9L2	206 aa		10.35	□□□□□ -0.75
SDCCAG3-208	ENST00000466579	SLFN12L	Q6IEE8	588 aa		10.35	□□□□□ -0.75
SDCCAG3-208	ENST00000466579	ZBTB33	Q86T24	672 aa		10.35	□□□□□ -0.75
SDCCAG3-208	ENST00000466579	GPR65	Q8IYL9	337 aa		10.35	□□□□□ -0.75
SDCCAG3-208	ENST00000466579	FMR1NB	Q8N0W7	255 aa	Predicted RBP	10.35	□□□□□ -0.75
SDCCAG3-208	ENST00000466579	ENGASE	Q8NFI3	743 aa		10.35	□□□□□ -0.75
SDCCAG3-208	ENST00000466579	ZNF507	Q8TCN5	953 aa		10.35	□□□□□ -0.75
SDCCAG3-208	ENST00000466579	BICD1	Q96G01	975 aa		10.35	□□□□□ -0.75
SDCCAG3-208	ENST00000466579	TMEM169	Q96HH4	297 aa		10.35	□□□□□ -0.75
SDCCAG3-208	ENST00000466579	FAM193B	Q96PV7	902 aa	Predicted RBP	10.35	□□□□□ -0.75
SDCCAG3-208	ENST00000466579	ACCS	Q96QU6	501 aa		10.35	□□□□□ -0.75
SDCCAG3-208	ENST00000466579	RPS6KC1	Q96S38	1066 aa		10.35	□□□□□ -0.75
SDCCAG3-208	ENST00000466579	TSPAN18	Q96SJ8	248 aa		10.35	□□□□□ -0.75
SDCCAG3-208	ENST00000466579	TCHP	Q9BT92	498 aa		10.35	□□□□□ -0.75
SDCCAG3-208	ENST00000466579	ZBP1	Q9H171	429 aa		10.35	□□□□□ -0.75
SDCCAG3-208	ENST00000466579	TMEM206	Q9H813	350 aa		10.35	□□□□□ -0.75
SDCCAG3-208	ENST00000466579	NGRN	Q9NPE2	291 aa	Known RBP	10.35	□□□□□ -0.75
SDCCAG3-208	ENST00000466579	TBC1D7	Q9P0N9	293 aa		10.35	□□□□□ -0.75
SDCCAG3-208	ENST00000466579	ANKFY1	Q9P2R3	1169 aa		10.35	□□□□□ -0.75
SDCCAG3-208	ENST00000466579	COG5	Q9UP83	839 aa		10.35	□□□□□ -0.75
SDCCAG3-208	ENST00000466579	EXOC7	Q9UPT5	735 aa		10.35	□□□□□ -0.75
SDCCAG3-208	ENST00000466579	FAN1	Q9Y2M0	1017 aa		10.35	□□□□□ -0.75
SDCCAG3-208	ENST00000466579	GDA	Q9Y2T3	454 aa		10.35	□□□□□ -0.75
SDCCAG3-208	ENST00000466579	GTF3C5	Q9Y5Q8	519 aa	Predicted RBP	10.35	□□□□□ -0.75
SDCCAG3-208	ENST00000466579	TMEM189-UBE2V1	I3L0A0	370 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SDCCAG3-208	ENST00000466579	LILRB3	O75022	631 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SDCCAG3-208	ENST00000466579	ZNF202	O95125	648 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SDCCAG3-208	ENST00000466579	CTSA	P10619	480 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SDCCAG3-208	ENST00000466579	GART	P22102	1010 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SDCCAG3-208	ENST00000466579	CASP1	P29466	404 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SDCCAG3-208	ENST00000466579	AFM	P43652	599 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SDCCAG3-208	ENST00000466579	YARS	P54577	528 aa	Known RBP	10.34	□□□□□ -0.75
SDCCAG3-208	ENST00000466579	HYAL1	Q12794	435 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SDCCAG3-208	ENST00000466579	KCNC3	Q14003	757 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SDCCAG3-208	ENST00000466579	POSTN	Q15063	836 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SDCCAG3-208	ENST00000466579	CCDC85B	Q15834	202 aa	Predicted RBP	10.34	□□□□□ -0.75
SDCCAG3-208	ENST00000466579	ZBTB6	Q15916	424 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SDCCAG3-208	ENST00000466579	FAM26F	Q5R3K3	315 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SDCCAG3-208	ENST00000466579	KRBA2	Q6ZNG9	492 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SDCCAG3-208	ENST00000466579	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SDCCAG3-208	ENST00000466579	STXBP4	Q6ZWJ1	553 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SDCCAG3-208	ENST00000466579	GRAMD1C	Q8IYS0	662 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SDCCAG3-208	ENST00000466579	MRPL43	Q8N983	215 aa	Known RBP	10.34	□□□□□ -0.75
SDCCAG3-208	ENST00000466579	GLIS3	Q8NEA6	775 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SDCCAG3-208	ENST00000466579	TMEM174	Q8WUU8	243 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SDCCAG3-208	ENST00000466579	UROC1	Q96N76	676 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SDCCAG3-208	ENST00000466579	ZMAT2	Q96NC0	199 aa	Known RBP	10.34	□□□□□ -0.75
SDCCAG3-208	ENST00000466579	CDCA3	Q99618	268 aa	Predicted RBP	10.34	□□□□□ -0.75
SDCCAG3-208	ENST00000466579	MSTO1	Q9BUK6	570 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SDCCAG3-208	ENST00000466579	COLEC11	Q9BWP8	271 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SDCCAG3-208	ENST00000466579	GBP3	Q9H0R5	595 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SDCCAG3-208	ENST00000466579	BLZF1	Q9H2G9	400 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SDCCAG3-208	ENST00000466579	CPSF3	Q9UKF6	684 aa	Known RBP	10.34	□□□□□ -0.75
SDCCAG3-208	ENST00000466579	FSD2	A1L4K1	749 aa		10.33	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	C2orf71	A6NGG8	1288 aa		10.33	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	TISP43	B9A030	160 aa		10.33	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	NR1I2	O75469	434 aa		10.33	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	PRPF6	O94906	941 aa	Known RBP	10.33	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	SOD2	P04179	222 aa		10.33	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	TNFSF9	P41273	254 aa		10.33	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	OR1G1	P47890	313 aa		10.33	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	OSTN	P61366	133 aa		10.33	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	SNRPF	P62306	86 aa	Known RBP	10.33	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	FAM160A1	Q05DH4	1040 aa		10.33	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	SOX4	Q06945	474 aa	Predicted RBP	10.33	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	DPYD	Q12882	1025 aa		10.33	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	PSMD2	Q13200	908 aa		10.33	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	HSP90AA2P	Q14568	343 aa	Predicted RBP	10.33	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	SMC1A	Q14683	1233 aa	Known RBP	10.33	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	ENOX2	Q16206	610 aa	Known RBP	10.33	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	DUSP6	Q16828	381 aa		10.33	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	SEZ6	Q53EL9	994 aa		10.33	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	ZBTB41	Q5SVQ8	909 aa		10.33	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	KANK3	Q6NY19	840 aa		10.33	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	CD300LG	Q6UXG3	332 aa		10.33	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	10.33	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	TMEM184A	Q6ZMB5	413 aa		10.33	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	ADGRD2	Q7Z7M1	963 aa		10.33	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	CD302	Q8IX05	232 aa		10.33	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	ELOA2	Q8IYF1	753 aa	Predicted RBP	10.33	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	VPS52	Q8N1B4	723 aa		10.33	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	MICALL1	Q8N3F8	863 aa		10.33	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	EFHB	Q8N7U6	833 aa		10.33	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	SCFD1	Q8WVM8	642 aa		10.33	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	ATXN2L	Q8WWM7	1075 aa	Known RBP	10.33	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	HPS3	Q969F9	1004 aa		10.33	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	PPP2R3C	Q969Q6	453 aa		10.33	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	PABPC5	Q96DU9	382 aa	Known RBP	10.33	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	TIGD1	Q96MW7	591 aa		10.33	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	TCF25	Q9BQ70	676 aa		10.33	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	PAAF1	Q9BRP4	392 aa		10.33	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	HERC2P3	Q9BVR0	1158 aa		10.33	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	IKZF4	Q9H2S9	585 aa		10.33	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	PRDM6	Q9NQX0	595 aa		10.33	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	CHST7	Q9NS84	486 aa		10.33	□□□□□ -0.76

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