RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466222.6

CAPN3-209, Transcript of calpain 3, humanhuman

TSL 2

Gene CAPN3, Length 1,934 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3-209ENST00000466222 DARSP14868 501 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
CAPN3-209ENST00000466222 PROZP22891 400 aa20.16■□□□□ 0.82
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CAPN3-209ENST00000466222 VAMP7P51809 220 aa20.16■□□□□ 0.82
CAPN3-209ENST00000466222 SNX17Q15036 470 aa20.16■□□□□ 0.82
CAPN3-209ENST00000466222 TAF2Q6P1X5 1199 aa20.16■□□□□ 0.82
CAPN3-209ENST00000466222 TMEM192Q8IY95 271 aa20.16■□□□□ 0.82
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CAPN3-209ENST00000466222 EXTL3O43909 919 aa20.15■□□□□ 0.82
CAPN3-209ENST00000466222 CABYRO75952 493 aa20.15■□□□□ 0.82
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CAPN3-209ENST00000466222 PPP3CAQ08209 521 aa20.15■□□□□ 0.82
CAPN3-209ENST00000466222 FAM187BQ17R55 369 aa20.15■□□□□ 0.82
CAPN3-209ENST00000466222 FKBP15Q5T1M5 1219 aa20.15■□□□□ 0.82
CAPN3-209ENST00000466222 SLFN12LQ6IEE8 588 aa20.15■□□□□ 0.82
CAPN3-209ENST00000466222 EHBP1Q8NDI1 1231 aa20.15■□□□□ 0.82
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CAPN3-209ENST00000466222 CHRNA1P02708 482 aa20.15■□□□□ 0.82
CAPN3-209ENST00000466222 ZNF568Q3ZCX4 644 aa20.15■□□□□ 0.82
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CAPN3-209ENST00000466222 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
CAPN3-209ENST00000466222 CDT1Q9H211 546 aa20.15■□□□□ 0.82
CAPN3-209ENST00000466222 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
CAPN3-209ENST00000466222 OGDHLQ9ULD0 1010 aa20.15■□□□□ 0.82
CAPN3-209ENST00000466222 PHF24Q9UPV7 400 aa20.15■□□□□ 0.82
CAPN3-209ENST00000466222 TNFSF13BQ9Y275 285 aa20.15■□□□□ 0.82
CAPN3-209ENST00000466222 CDY2AQ9Y6F7 541 aa20.15■□□□□ 0.82
CAPN3-209ENST00000466222 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa20.15■□□□□ 0.82
CAPN3-209ENST00000466222 TTC26A0AVF1 554 aa20.14■□□□□ 0.81
CAPN3-209ENST00000466222 CTAGE15A4D2H0 777 aa20.14■□□□□ 0.81
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CAPN3-209ENST00000466222 KRT13P13646 458 aa20.14■□□□□ 0.81
CAPN3-209ENST00000466222 THPOP40225 353 aa20.14■□□□□ 0.81
CAPN3-209ENST00000466222 GCLMP48507 274 aa20.14■□□□□ 0.81
CAPN3-209ENST00000466222 CYP24A1Q07973 514 aa20.14■□□□□ 0.81
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CAPN3-209ENST00000466222 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
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CAPN3-209ENST00000466222 CTAGE4Q8IX94 777 aa20.14■□□□□ 0.81
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CAPN3-209ENST00000466222 MFSD14AQ96MC6 490 aa20.14■□□□□ 0.81
CAPN3-209ENST00000466222 ERGIC2Q96RQ1 377 aa20.14■□□□□ 0.81
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CAPN3-209ENST00000466222 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
CAPN3-209ENST00000466222 DNM1LO00429 736 aa20.14■□□□□ 0.81
CAPN3-209ENST00000466222 ACTN1P12814 892 aa20.14■□□□□ 0.81
CAPN3-209ENST00000466222 SLC9A1P19634 815 aa20.14■□□□□ 0.81
CAPN3-209ENST00000466222 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
CAPN3-209ENST00000466222 FIGNQ5HY92 759 aa20.14■□□□□ 0.81
CAPN3-209ENST00000466222 FUT8Q9BYC5 575 aa20.14■□□□□ 0.81
CAPN3-209ENST00000466222 PDE11AQ9HCR9 933 aa20.14■□□□□ 0.81
CAPN3-209ENST00000466222 NOD1Q9Y239 953 aa20.14■□□□□ 0.81
CAPN3-209ENST00000466222 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
CAPN3-209ENST00000466222 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
CAPN3-209ENST00000466222 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
CAPN3-209ENST00000466222 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
CAPN3-209ENST00000466222 LONRF2Q1L5Z9 754 aa20.13■□□□□ 0.81
CAPN3-209ENST00000466222 SLC43A3Q8NBI5 491 aa20.13■□□□□ 0.81
CAPN3-209ENST00000466222 ELMO3Q96BJ8 720 aa20.13■□□□□ 0.81
CAPN3-209ENST00000466222 EPC1Q9H2F5 836 aa20.13■□□□□ 0.81
CAPN3-209ENST00000466222 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
CAPN3-209ENST00000466222 PTPRJQ12913 1337 aa20.13■□□□□ 0.81
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CAPN3-209ENST00000466222 A0A1W2PQJ5 194 aa20.12■□□□□ 0.81
CAPN3-209ENST00000466222 FMO5P49326 533 aa20.12■□□□□ 0.81
CAPN3-209ENST00000466222 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
CAPN3-209ENST00000466222 CDC42EP1Q00587 391 aa20.12■□□□□ 0.81
CAPN3-209ENST00000466222 AMPD2Q01433 879 aa20.12■□□□□ 0.81
CAPN3-209ENST00000466222 SCARA3Q6AZY7 606 aa20.12■□□□□ 0.81
CAPN3-209ENST00000466222 GPIHBP1Q8IV16 184 aa20.12■□□□□ 0.81
CAPN3-209ENST00000466222 CCDC170Q8IYT3 715 aa20.12■□□□□ 0.81
CAPN3-209ENST00000466222 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
CAPN3-209ENST00000466222 ATRIPQ8WXE1 791 aa20.12■□□□□ 0.81
CAPN3-209ENST00000466222 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa20.12■□□□□ 0.81
CAPN3-209ENST00000466222 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP20.12■□□□□ 0.81
CAPN3-209ENST00000466222 ST7Q9NRC1 585 aa20.12■□□□□ 0.81
CAPN3-209ENST00000466222 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa20.12■□□□□ 0.81
CAPN3-209ENST00000466222 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
CAPN3-209ENST00000466222 MYO6Q9UM54 1294 aa20.12■□□□□ 0.81
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