RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 MCL1Q07820 350 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 IRF5Q13568 498 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 GRB14Q14449 540 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 KCTD2Q14681 263 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 AMHR2Q16671 573 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 LONRF2Q1L5Z9 754 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 DCAF12L1Q5VU92 463 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 IER5Q5VY09 327 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 FAM160B1Q5W0V3 765 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 SPRYD7Q5W111 196 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 SCARA3Q6AZY7 606 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 ARMCX2Q7L311 632 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 BRSK2Q8IWQ3 736 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 SPATA4Q8NEY3 305 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 CXorf38Q8TB03 319 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 SCFD2Q8WU76 684 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 POMGNT1Q8WZA1 660 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 COPS5Q92905 334 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 CD101Q93033 1021 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 FAM84AQ96KN4 292 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 IFT74Q96LB3 600 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 ALS2CR12Q96Q35 445 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 CGRRF1Q99675 332 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 PTPN18Q99952 460 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 NFKBIZQ9BYH8 718 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 FZD8Q9H461 694 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 EFCC1Q9HA90 598 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 VTA1Q9NP79 307 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 PDGFCQ9NRA1 345 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 NRBP2Q9NSY0 501 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 RAB20Q9NX57 234 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 EHD2Q9NZN4 543 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 PNMA3Q9UL41 463 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 CITO14578 2027 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 TRIP11Q15643 1979 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 COL1A2P08123 1366 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 ANKRD62A6NC57 917 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF233A6NK53 670 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 K7ERI5 159 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 PDHXO00330 501 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 ADCY6O43306 1168 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 STRNO43815 780 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 SGPL1O95470 568 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 FTCDO95954 541 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 HLA-DRAP01903 254 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 CYP1A2P05177 515 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 CCDC172P0C7W6 258 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 MYBL2P10244 700 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 ADORA2AP29274 412 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 GTF2A2P52657 109 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 EFNA5P52803 228 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 PTENP60484 403 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 CDR2Q01850 454 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 MBTD1Q05BQ5 628 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 FAM187BQ17R55 369 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 PROX2Q3B8N5 592 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 SLFN12LQ6IEE8 588 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 C11orf63Q6NUN7 778 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 TMCO3Q6UWJ1 677 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 VPS36Q86VN1 386 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 USP38Q8NB14 1042 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 OR5B17Q8NGF7 314 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 PPTC7Q8NI37 304 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 ACTRT1Q8TDG2 376 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 HDAC7Q8WUI4 952 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 SLC7A3Q8WY07 619 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 USP6NLQ92738 828 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 TATDN2Q93075 761 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 CCDC127Q96BQ5 260 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 SLC10A4Q96EP9 437 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.1 ms