RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461219.5

SCAF8-204, Transcript of SR-related CTD associated factor 8, humanhuman

TSL 5

Gene SCAF8, Length 677 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8-204ENST00000461219 GTF2BQ00403 316 aa22.39■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 COL19A1Q14993 1142 aa22.39■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 KYAT1Q16773 422 aa22.39■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 CEP57L1Q8IYX8 460 aa22.39■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 HASPINQ8TF76 798 aa22.39■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 CASP10Q92851 521 aa22.39■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 HVCN1Q96D96 273 aa22.39■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 MSTO1Q9BUK6 570 aa22.39■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa22.39■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 MAGEF1Q9HAY2 307 aa22.39■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 MARCH5Q9NX47 278 aa22.39■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP22.38■■□□□ 1.171e-6■■■■■ 73.2
SCAF8-204ENST00000461219 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 KLRC2P26717 231 aa22.38■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 LTBRP36941 435 aa22.38■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 GLUD2P49448 558 aa22.38■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 MCL1Q07820 350 aa22.38■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 SEZ6Q53EL9 994 aa22.38■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 RESP18Q5W5W9 173 aa22.38■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 FUT10Q6P4F1 479 aa22.38■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa22.38■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 PPFIBP1Q86W92 1011 aa22.38■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 SYCP3Q8IZU3 236 aa22.38■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 CACNG4Q9UBN1 327 aa22.38■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 ZDHHC9Q9Y397 364 aa22.38■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa22.38■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 A0A0C4DFX4 3053 aa22.38■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa22.37■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 CLTAP09496 248 aa22.37■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 NUCB2P80303 420 aa22.37■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 PPP2R3AQ06190 1150 aa22.37■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 PTPN14Q15678 1187 aa22.37■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 USP41Q3LFD5 358 aa22.37■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 SLFN12LQ6IEE8 588 aa22.37■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 ZNF720Q7Z2F6 126 aa22.37■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 MAP4K3Q8IVH8 894 aa22.37■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 DNAJC19Q96DA6 116 aa22.37■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 SNX27Q96L92 541 aa22.37■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 UROC1Q96N76 676 aa22.37■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 ACCSQ96QU6 501 aa22.37■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 KCNH3Q9ULD8 1083 aa22.37■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 GRXCR2A6NFK2 248 aa22.36■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 F8W810 466 aa22.36■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 IL9P15248 144 aa22.36■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 ALCAMQ13740 583 aa22.36■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 CEP57Q86XR8 500 aa22.36■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 FAM212AQ96EL1 285 aa22.36■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 PAAF1Q9BRP4 392 aa22.36■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 VN1R3Q9BXE9 311 aa22.36■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 CXCL16Q9H2A7 254 aa22.36■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa22.36■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 IRAK3Q9Y616 596 aa22.36■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 XIRP2A4UGR9 3374 aa22.35■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 ABLIM1O14639 778 aa22.35■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 OGTO15294 1046 aa22.35■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 B3GAT3O94766 335 aa22.35■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 GLP2RO95838 553 aa22.35■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 PIGRP01833 764 aa22.35■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 ADH1AP07327 375 aa22.35■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 CXCL8P10145 99 aa22.35■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 RBM10P98175 930 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 E2F4Q16254 413 aa22.35■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 ADALQ6DHV7 355 aa22.35■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa22.35■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 POMGNT1Q8WZA1 660 aa22.35■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 KCNN1Q92952 543 aa22.35■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 OLFML3Q9NRN5 406 aa22.35■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 KBTBD4Q9NVX7 518 aa22.35■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 CLEC1BQ9P126 229 aa22.35■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa22.35■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 PLXNA3P51805 1871 aa22.34■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 MBTPS2O43462 519 aa22.34■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 XPOTO43592 962 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 TRAPPC3O43617 180 aa22.34■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 KIF4AO95239 1232 aa22.34■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 AFMP43652 599 aa22.34■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 CREMQ03060 361 aa22.34■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 COASYQ13057 564 aa22.34■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 POSTNQ15063 836 aa22.34■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 TAS1R1Q7RTX1 841 aa22.34■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 FIZ1Q96SL8 496 aa22.34■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 APOL5Q9BWW9 433 aa22.34■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36 ms