RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459627.1

SH3BP5-208, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP5, Length 473 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-208ENST00000459627 TADA2AO75478 443 aa26.18■■□□□ 1.78
SH3BP5-208ENST00000459627 KIF4AO95239 1232 aa26.18■■□□□ 1.78
SH3BP5-208ENST00000459627 URODP06132 367 aa26.18■■□□□ 1.78
SH3BP5-208ENST00000459627 MCF2P10911 925 aa26.18■■□□□ 1.78
SH3BP5-208ENST00000459627 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
SH3BP5-208ENST00000459627 SLC22A17Q8WUG5 538 aa26.18■■□□□ 1.78
SH3BP5-208ENST00000459627 CASP10Q92851 521 aa26.18■■□□□ 1.78
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SH3BP5-208ENST00000459627 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
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SH3BP5-208ENST00000459627 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
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SH3BP5-208ENST00000459627 ADHFE1Q8IWW8 467 aa26.17■■□□□ 1.78
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SH3BP5-208ENST00000459627 TBX20Q9UMR3 447 aa26.17■■□□□ 1.78
SH3BP5-208ENST00000459627 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
SH3BP5-208ENST00000459627 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa26.16■■□□□ 1.78
SH3BP5-208ENST00000459627 TOM1L1O75674 476 aa26.16■■□□□ 1.78
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SH3BP5-208ENST00000459627 FSD2A1L4K1 749 aa26.15■■□□□ 1.78
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SH3BP5-208ENST00000459627 KIAA1841Q6NSI8 718 aa26.15■■□□□ 1.78
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SH3BP5-208ENST00000459627 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa26.15■■□□□ 1.78
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SH3BP5-208ENST00000459627 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa26.14■■□□□ 1.78
SH3BP5-208ENST00000459627 CEP57Q86XR8 500 aa26.14■■□□□ 1.78
SH3BP5-208ENST00000459627 SUSD6Q92537 303 aa26.14■■□□□ 1.78
SH3BP5-208ENST00000459627 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
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SH3BP5-208ENST00000459627 PRKAG3Q9UGI9 489 aa26.14■■□□□ 1.78
SH3BP5-208ENST00000459627 PLXNA3P51805 1871 aa26.13■■□□□ 1.77
SH3BP5-208ENST00000459627 C19orf67A6NJJ6 358 aa26.13■■□□□ 1.77
SH3BP5-208ENST00000459627 I3L4J1 428 aa26.13■■□□□ 1.77
SH3BP5-208ENST00000459627 CLDN3O15551 220 aa26.13■■□□□ 1.77
SH3BP5-208ENST00000459627 SPATA31D3P0C874 917 aa26.13■■□□□ 1.77
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SH3BP5-208ENST00000459627 SLC10A6Q3KNW5 377 aa26.13■■□□□ 1.77
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SH3BP5-208ENST00000459627 SLC39A4Q6P5W5 647 aa26.13■■□□□ 1.77
SH3BP5-208ENST00000459627 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa26.13■■□□□ 1.77
SH3BP5-208ENST00000459627 C3orf58Q8NDZ4 430 aa26.13■■□□□ 1.77
SH3BP5-208ENST00000459627 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa26.13■■□□□ 1.77
SH3BP5-208ENST00000459627 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
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SH3BP5-208ENST00000459627 ANKRD63C9JTQ0 380 aa26.12■■□□□ 1.77
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SH3BP5-208ENST00000459627 CXCL8P10145 99 aa26.12■■□□□ 1.77
SH3BP5-208ENST00000459627 XKR4Q5GH76 650 aa26.12■■□□□ 1.77
SH3BP5-208ENST00000459627 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
SH3BP5-208ENST00000459627 FAM171A1Q5VUB5 890 aa26.12■■□□□ 1.77
SH3BP5-208ENST00000459627 CD300LGQ6UXG3 332 aa26.12■■□□□ 1.77
SH3BP5-208ENST00000459627 PALB2Q86YC2 1186 aa26.12■■□□□ 1.77
SH3BP5-208ENST00000459627 FBXL18Q96ME1 805 aa26.12■■□□□ 1.77
SH3BP5-208ENST00000459627 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa26.12■■□□□ 1.77
SH3BP5-208ENST00000459627 STK39Q9UEW8 545 aa26.12■■□□□ 1.77
SH3BP5-208ENST00000459627 CITO14578 2027 aa26.12■■□□□ 1.77
SH3BP5-208ENST00000459627 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP26.12■■□□□ 1.771e-6■■■■■ 66.8
SH3BP5-208ENST00000459627 IDEP14735 1019 aa26.11■■□□□ 1.77
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