RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000458677.1

ABCA9-AS1-201, ABCA9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ABCA9-AS1, Length 523 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 RPAINQ86UA6 219 aa9.36□□□□□ -0.91
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 BRSK2Q8IWQ3 736 aa9.36□□□□□ -0.91
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 HACE1Q8IYU2 909 aa9.36□□□□□ -0.91
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 PARD3BQ8TEW8 1205 aa9.36□□□□□ -0.91
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 KCNN1Q92952 543 aa9.36□□□□□ -0.91
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 SLC35C1Q96A29 364 aa9.36□□□□□ -0.91
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 MFSD14AQ96MC6 490 aa9.36□□□□□ -0.91
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 CGRRF1Q99675 332 aa9.36□□□□□ -0.91
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 ADAM2Q99965 735 aa9.36□□□□□ -0.91
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 PTPRHQ9HD43 1115 aa9.36□□□□□ -0.91
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 ERVK-5Q9HDB9 667 aa9.36□□□□□ -0.91
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 GCNT4Q9P109 453 aa9.36□□□□□ -0.91
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 LRRC10BA6NIK2 292 aa9.35□□□□□ -0.91
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 RECQL4O94761 1208 aa9.35□□□□□ -0.91
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 IL18RAPO95256 599 aa9.35□□□□□ -0.91
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 TNNC2P02585 160 aa9.35□□□□□ -0.91
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 KRT19P08727 400 aa9.35□□□□□ -0.91
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 ACTN1P12814 892 aa9.35□□□□□ -0.91
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 ITGA4P13612 1032 aa9.35□□□□□ -0.91
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 SLC9A1P19634 815 aa9.35□□□□□ -0.91
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 GRM5P41594 1212 aa9.35□□□□□ -0.91
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 PIK3CAP42336 1068 aa9.35□□□□□ -0.91
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 APBA1Q02410 837 aa9.35□□□□□ -0.91
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 TRPC3Q13507 836 aa9.35□□□□□ -0.91
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 KYAT1Q16773 422 aa9.35□□□□□ -0.91
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 EXOC3L4Q17RC7 722 aa9.35□□□□□ -0.91
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 CBWD6Q4V339 395 aa9.35□□□□□ -0.91
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 CBWD3Q5JTY5 395 aa9.35□□□□□ -0.91
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 GLRA4Q5JXX5 417 aa9.35□□□□□ -0.91
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 CBWD5Q5RIA9 395 aa9.35□□□□□ -0.91
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 UBXN11Q5T124 520 aa9.35□□□□□ -0.91
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 JADE1Q6IE81 842 aa9.35□□□□□ -0.91
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa9.35□□□□□ -0.91
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 TMC2Q8TDI7 906 aa9.35□□□□□ -0.91
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 LPPQ93052 612 aa9.35□□□□□ -0.91
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 ELMO3Q96BJ8 720 aa9.35□□□□□ -0.91
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 CCDC51Q96ER9 411 aa9.35□□□□□ -0.91
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 KIF12Q96FN5 646 aa9.35□□□□□ -0.91
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 BORCS6Q96GS4 357 aa9.35□□□□□ -0.91
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa9.35□□□□□ -0.91
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 FBXL18Q96ME1 805 aa9.35□□□□□ -0.91
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 TMEM117Q9H0C3 514 aa9.35□□□□□ -0.91
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 FAM105AQ9NUU6 356 aa9.35□□□□□ -0.91
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 PCDH10Q9P2E7 1040 aa9.35□□□□□ -0.91
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 IPPQ9Y573 584 aa9.35□□□□□ -0.91
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa9.35□□□□□ -0.91
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP9.35□□□□□ -0.91
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 MGEA5O60502 916 aa9.34□□□□□ -0.91
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 NFICP08651 508 aa9.34□□□□□ -0.91
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 PYGBP11216 843 aa9.34□□□□□ -0.91
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 RAG1P15918 1043 aa9.34□□□□□ -0.91
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 CASP14P31944 242 aa9.34□□□□□ -0.91
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 GUCY2FP51841 1108 aa9.34□□□□□ -0.91
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 ADKP55263 362 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 RBL2Q08999 1139 aa9.34□□□□□ -0.91
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 KCNMA1Q12791 1236 aa9.34□□□□□ -0.91
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 MBTPS1Q14703 1052 aa9.34□□□□□ -0.91
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 ARID5BQ14865 1188 aa9.34□□□□□ -0.91
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 TMEM132DQ14C87 1099 aa9.34□□□□□ -0.91
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 C1orf220Q5T0J3 134 aa9.34□□□□□ -0.91
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 KRT39Q6A163 491 aa9.34□□□□□ -0.91
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 TRAF7Q6Q0C0 670 aa9.34□□□□□ -0.91
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa9.34□□□□□ -0.91
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 TMEM130Q8N3G9 435 aa9.34□□□□□ -0.91
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 USP38Q8NB14 1042 aa9.34□□□□□ -0.91
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 CCDC150Q8NCX0 1101 aa9.34□□□□□ -0.91
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 DBF4BQ8NFT6 615 aa9.34□□□□□ -0.91
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 OR5B17Q8NGF7 314 aa9.34□□□□□ -0.91
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 SEPT8Q92599 483 aa9.34□□□□□ -0.91
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 TOX2Q96NM4 488 aa9.34□□□□□ -0.91
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 RPS6KC1Q96S38 1066 aa9.34□□□□□ -0.91
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 PPP1R9BQ96SB3 815 aa9.34□□□□□ -0.91
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 MTMR12Q9C0I1 747 aa9.34□□□□□ -0.91
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 TMX1Q9H3N1 280 aa9.34□□□□□ -0.91
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 TMEM8AQ9HCN3 771 aa9.34□□□□□ -0.91
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 NLRC4Q9NPP4 1024 aa9.34□□□□□ -0.91
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 CHST12Q9NRB3 414 aa9.34□□□□□ -0.91
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa9.34□□□□□ -0.91
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa9.34□□□□□ -0.91
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 PTPRJQ12913 1337 aa9.33□□□□□ -0.92
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 HTTP42858 3142 aa9.33□□□□□ -0.92
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 A0A1W2PQC6 194 aa9.33□□□□□ -0.92
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 CCDC85CA6NKD9 419 aa9.33□□□□□ -0.92
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 FAM189A1O60320 539 aa9.33□□□□□ -0.92
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 NBNO60934 754 aa9.33□□□□□ -0.92
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 HLA-DRAP01903 254 aa9.33□□□□□ -0.92
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 RAB27AP51159 221 aa9.33□□□□□ -0.92
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 RAPGEF1Q13905 1077 aa9.33□□□□□ -0.92
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 ARHGAP44Q17R89 818 aa9.33□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.3 ms