RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429490.5

SGMS1-203, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SGMS1, Length 3,634 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-203ENST00000429490 TXNDC9O14530 226 aa14.62□□□□□ -0.07
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SGMS1-203ENST00000429490 NOP14P78316 857 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SGMS1-203ENST00000429490 ITIH4Q14624 930 aa14.62□□□□□ -0.07
SGMS1-203ENST00000429490 MDH1BQ5I0G3 518 aa14.62□□□□□ -0.07
SGMS1-203ENST00000429490 WDR78Q5VTH9 848 aa14.62□□□□□ -0.07
SGMS1-203ENST00000429490 DCAF12L1Q5VU92 463 aa14.62□□□□□ -0.07
SGMS1-203ENST00000429490 BSPRYQ5W0U4 402 aa14.62□□□□□ -0.07
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SGMS1-203ENST00000429490 ACOT2P49753 483 aa14.62□□□□□ -0.07
SGMS1-203ENST00000429490 KIF9Q9HAQ2 790 aa14.62□□□□□ -0.07
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SGMS1-203ENST00000429490 TMEM59LQ9UK28 342 aa14.62□□□□□ -0.07
SGMS1-203ENST00000429490 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
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SGMS1-203ENST00000429490 ARHGAP42A6NI28 874 aa14.61□□□□□ -0.07
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SGMS1-203ENST00000429490 ARHGEF16Q5VV41 709 aa14.61□□□□□ -0.07
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SGMS1-203ENST00000429490 C15orf41Q9Y2V0 281 aa14.61□□□□□ -0.07
SGMS1-203ENST00000429490 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP14.61□□□□□ -0.07
SGMS1-203ENST00000429490 PPIP5K2O43314 1243 aa14.61□□□□□ -0.07
SGMS1-203ENST00000429490 TTC4O95801 387 aa14.61□□□□□ -0.07
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SGMS1-203ENST00000429490 MCM8Q9UJA3 840 aa14.61□□□□□ -0.07
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SGMS1-203ENST00000429490 XRCC4Q13426 336 aa14.61□□□□□ -0.07
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SGMS1-203ENST00000429490 AGAP1Q9UPQ3 857 aa14.61□□□□□ -0.07
SGMS1-203ENST00000429490 NEU2Q9Y3R4 380 aa14.61□□□□□ -0.07
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SGMS1-203ENST00000429490 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
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SGMS1-203ENST00000429490 OTOP1Q7RTM1 612 aa14.6□□□□□ -0.07
SGMS1-203ENST00000429490 AMIGO3Q86WK7 504 aa14.6□□□□□ -0.07
SGMS1-203ENST00000429490 ARMC2Q8NEN0 867 aa14.6□□□□□ -0.07
SGMS1-203ENST00000429490 SPOCK2Q92563 424 aa14.6□□□□□ -0.07
SGMS1-203ENST00000429490 SERPINB12Q96P63 405 aa14.6□□□□□ -0.07
SGMS1-203ENST00000429490 VCXQ9H320 206 aa14.6□□□□□ -0.07
SGMS1-203ENST00000429490 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SGMS1-203ENST00000429490 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP14.6□□□□□ -0.071e-7■■■□□ 14.9
SGMS1-203ENST00000429490 NYAP2Q9P242 653 aa14.6□□□□□ -0.07
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