RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 TIPINQ9BVW5 301 aa23.08■■□□□ 1.29
LIMS1-208ENST00000428064 CXCL16Q9H2A7 254 aa23.08■■□□□ 1.29
LIMS1-208ENST00000428064 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa23.08■■□□□ 1.29
LIMS1-208ENST00000428064 FBXW11Q9UKB1 542 aa23.08■■□□□ 1.29
LIMS1-208ENST00000428064 VWA8A3KMH1 1905 aa23.08■■□□□ 1.28
LIMS1-208ENST00000428064 E9PMD0 336 aa23.07■■□□□ 1.28
LIMS1-208ENST00000428064 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
LIMS1-208ENST00000428064 ZMYND10O75800 440 aa23.07■■□□□ 1.28
LIMS1-208ENST00000428064 SPATA31D3P0C874 917 aa23.07■■□□□ 1.28
LIMS1-208ENST00000428064 RPL17P18621 184 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
LIMS1-208ENST00000428064 CLCN5P51795 746 aa23.07■■□□□ 1.28
LIMS1-208ENST00000428064 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
LIMS1-208ENST00000428064 IL17AQ16552 155 aa23.07■■□□□ 1.28
LIMS1-208ENST00000428064 HYIQ5T013 277 aa23.07■■□□□ 1.28
LIMS1-208ENST00000428064 FAM171A1Q5VUB5 890 aa23.07■■□□□ 1.28
LIMS1-208ENST00000428064 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
LIMS1-208ENST00000428064 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
LIMS1-208ENST00000428064 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
LIMS1-208ENST00000428064 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa23.07■■□□□ 1.28
LIMS1-208ENST00000428064 HASPINQ8TF76 798 aa23.07■■□□□ 1.28
LIMS1-208ENST00000428064 CLSTN3Q9BQT9 956 aa23.07■■□□□ 1.28
LIMS1-208ENST00000428064 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
LIMS1-208ENST00000428064 PTPRHQ9HD43 1115 aa23.07■■□□□ 1.28
LIMS1-208ENST00000428064 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP23.07■■□□□ 1.28
LIMS1-208ENST00000428064 GDAQ9Y2T3 454 aa23.07■■□□□ 1.28
LIMS1-208ENST00000428064 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
LIMS1-208ENST00000428064 PP2D1A8MPX8 630 aa23.06■■□□□ 1.28
LIMS1-208ENST00000428064 HOXA9P31269 272 aa23.06■■□□□ 1.28
LIMS1-208ENST00000428064 GRM5P41594 1212 aa23.06■■□□□ 1.28
LIMS1-208ENST00000428064 PEX3P56589 373 aa23.06■■□□□ 1.28
LIMS1-208ENST00000428064 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
LIMS1-208ENST00000428064 MAPK7Q13164 816 aa23.06■■□□□ 1.28
LIMS1-208ENST00000428064 PSMD5Q16401 504 aa23.06■■□□□ 1.28
LIMS1-208ENST00000428064 XKR4Q5GH76 650 aa23.06■■□□□ 1.28
LIMS1-208ENST00000428064 C1orf186Q6ZWK4 172 aa23.06■■□□□ 1.28
LIMS1-208ENST00000428064 GLYCTKQ8IVS8 523 aa23.06■■□□□ 1.28
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM105Q8N8V8 129 aa23.06■■□□□ 1.28
LIMS1-208ENST00000428064 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
LIMS1-208ENST00000428064 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
LIMS1-208ENST00000428064 PIDD1Q9HB75 910 aa23.06■■□□□ 1.28
LIMS1-208ENST00000428064 POLD4Q9HCU8 107 aa23.06■■□□□ 1.28
LIMS1-208ENST00000428064 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
LIMS1-208ENST00000428064 HIP1RO75146 1068 aa23.05■■□□□ 1.28
LIMS1-208ENST00000428064 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP23.05■■□□□ 1.28
LIMS1-208ENST00000428064 FGFR3P22607 806 aa23.05■■□□□ 1.28
LIMS1-208ENST00000428064 GUCY2CP25092 1073 aa23.05■■□□□ 1.28
LIMS1-208ENST00000428064 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
LIMS1-208ENST00000428064 RINT1Q6NUQ1 792 aa23.05■■□□□ 1.28
LIMS1-208ENST00000428064 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa23.05■■□□□ 1.28
LIMS1-208ENST00000428064 MYADMQ96S97 322 aa23.05■■□□□ 1.28
LIMS1-208ENST00000428064 PHOX2BQ99453 314 aa23.05■■□□□ 1.28
LIMS1-208ENST00000428064 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
LIMS1-208ENST00000428064 RUSC1Q9BVN2 902 aa23.05■■□□□ 1.28
LIMS1-208ENST00000428064 CDT1Q9H211 546 aa23.05■■□□□ 1.28
LIMS1-208ENST00000428064 MFSD1Q9H3U5 465 aa23.05■■□□□ 1.28
LIMS1-208ENST00000428064 KMT5AQ9NQR1 393 aa23.05■■□□□ 1.28
LIMS1-208ENST00000428064 KCNG1Q9UIX4 513 aa23.05■■□□□ 1.28
LIMS1-208ENST00000428064 DOCK8Q8NF50 2099 aa23.05■■□□□ 1.28
LIMS1-208ENST00000428064 CCDC169A6NNP5 214 aa23.04■■□□□ 1.28
LIMS1-208ENST00000428064 POU2F2P09086 479 aa23.04■■□□□ 1.28
LIMS1-208ENST00000428064 PROZP22891 400 aa23.04■■□□□ 1.28
LIMS1-208ENST00000428064 UPP1Q16831 310 aa23.04■■□□□ 1.28
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF568Q3ZCX4 644 aa23.04■■□□□ 1.28
LIMS1-208ENST00000428064 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
LIMS1-208ENST00000428064 ALKAL1Q6UXT8 129 aa23.04■■□□□ 1.28
LIMS1-208ENST00000428064 TAS1R3Q7RTX0 852 aa23.04■■□□□ 1.28
LIMS1-208ENST00000428064 CEP57Q86XR8 500 aa23.04■■□□□ 1.28
LIMS1-208ENST00000428064 TMX3Q96JJ7 454 aa23.04■■□□□ 1.28
LIMS1-208ENST00000428064 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
LIMS1-208ENST00000428064 KCND2Q9NZV8 630 aa23.04■■□□□ 1.28
LIMS1-208ENST00000428064 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
LIMS1-208ENST00000428064 B3GAT3O94766 335 aa23.03■■□□□ 1.28
LIMS1-208ENST00000428064 MYBP10242 640 aa23.03■■□□□ 1.28
LIMS1-208ENST00000428064 CDC25AP30304 524 aa23.03■■□□□ 1.28
LIMS1-208ENST00000428064 CLCNKBP51801 687 aa23.03■■□□□ 1.28
LIMS1-208ENST00000428064 YARSP54577 528 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
LIMS1-208ENST00000428064 GLRA4Q5JXX5 417 aa23.03■■□□□ 1.28
LIMS1-208ENST00000428064 LIN9Q5TKA1 542 aa23.03■■□□□ 1.28
LIMS1-208ENST00000428064 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
LIMS1-208ENST00000428064 RTL10Q7L3V2 364 aa23.03■■□□□ 1.28
LIMS1-208ENST00000428064 KCNK18Q7Z418 384 aa23.03■■□□□ 1.28
LIMS1-208ENST00000428064 SPIRE2Q8WWL2 714 aa23.03■■□□□ 1.28
LIMS1-208ENST00000428064 MTRRQ9UBK8 725 aa23.03■■□□□ 1.28
LIMS1-208ENST00000428064 WNT16Q9UBV4 365 aa23.03■■□□□ 1.28
LIMS1-208ENST00000428064 DMDP11532 3685 aa23.03■■□□□ 1.28
LIMS1-208ENST00000428064 TRIP11Q15643 1979 aa23.03■■□□□ 1.28
LIMS1-208ENST00000428064 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa23.02■■□□□ 1.28
LIMS1-208ENST00000428064 ABLIM1O14639 778 aa23.02■■□□□ 1.28
LIMS1-208ENST00000428064 TRAPPC3O43617 180 aa23.02■■□□□ 1.28
LIMS1-208ENST00000428064 MCF2P10911 925 aa23.02■■□□□ 1.28
LIMS1-208ENST00000428064 MCM2P49736 904 aa23.02■■□□□ 1.28
LIMS1-208ENST00000428064 RAB33AQ14088 237 aa23.02■■□□□ 1.28
LIMS1-208ENST00000428064 MCTP1Q6DN14 999 aa23.02■■□□□ 1.28
LIMS1-208ENST00000428064 CD300LGQ6UXG3 332 aa23.02■■□□□ 1.28
LIMS1-208ENST00000428064 CEP120Q8N960 986 aa23.02■■□□□ 1.28
LIMS1-208ENST00000428064 SLC38A7Q9NVC3 462 aa23.02■■□□□ 1.28
LIMS1-208ENST00000428064 BACE2Q9Y5Z0 518 aa23.02■■□□□ 1.28
LIMS1-208ENST00000428064 ANHXE9PGG2 379 aa23.01■■□□□ 1.27
LIMS1-208ENST00000428064 C8AP07357 584 aa23.01■■□□□ 1.27
LIMS1-208ENST00000428064 LAMP2P13473 410 aa23.01■■□□□ 1.27
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