RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C2orf40Q9H1Z8 148 aa14.56□□□□□ -0.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CDH7Q9ULB5 785 aa14.56□□□□□ -0.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TTLL13PA6NNM8 815 aa14.55□□□□□ -0.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CACNA1AO00555 2505 aa14.55□□□□□ -0.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LARGE1O95461 756 aa14.55□□□□□ -0.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 THP07101 528 aa14.55□□□□□ -0.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ATP2B1P20020 1258 aa14.55□□□□□ -0.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NTHL1P78549 312 aa14.55□□□□□ -0.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 COL4A3Q01955 1670 aa14.55□□□□□ -0.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NAB2Q15742 525 aa14.55□□□□□ -0.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM132AQ24JP5 1023 aa14.55□□□□□ -0.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PDXDC1Q6P996 788 aa14.55□□□□□ -0.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PARM1Q6UWI2 310 aa14.55□□□□□ -0.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa14.55□□□□□ -0.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C1orf210Q8IVY1 113 aa14.55□□□□□ -0.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FOXQ1Q9C009 403 aa14.55□□□□□ -0.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CXCL16Q9H2A7 254 aa14.55□□□□□ -0.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM60Q9H2L4 133 aa14.55□□□□□ -0.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TUFT1Q9NNX1 390 aa14.55□□□□□ -0.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DMXL1Q9Y485 3027 aa14.55□□□□□ -0.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PATJQ8NI35 1801 aa14.54□□□□□ -0.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCL16O15467 120 aa14.54□□□□□ -0.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 XYLBO75191 536 aa14.54□□□□□ -0.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MED24O75448 989 aa14.54□□□□□ -0.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRKCBP05771 671 aa14.54□□□□□ -0.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 POU2F2P09086 479 aa14.54□□□□□ -0.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SP9P0CG40 484 aa14.54□□□□□ -0.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GLULP15104 373 aa14.54□□□□□ -0.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FOSBP53539 338 aa14.54□□□□□ -0.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 STARD6P59095 220 aa14.54□□□□□ -0.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ANAPC15P60006 121 aa14.54□□□□□ -0.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MAPK6Q16659 721 aa14.54□□□□□ -0.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ME3Q16798 604 aa14.54□□□□□ -0.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MTSS1LQ765P7 747 aa14.54□□□□□ -0.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CATSPER3Q86XQ3 398 aa14.54□□□□□ -0.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BSNDQ8WZ55 320 aa14.54□□□□□ -0.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FGF13Q92913 245 aa14.54□□□□□ -0.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SHDQ96IW2 340 aa14.54□□□□□ -0.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ADPGKQ9BRR6 497 aa14.54□□□□□ -0.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 POLIQ9UNA4 740 aa14.54□□□□□ -0.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ADAM12O43184 909 aa14.53□□□□□ -0.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EDN1P05305 212 aa14.53□□□□□ -0.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GPC5P78333 572 aa14.53□□□□□ -0.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRIM29Q14134 588 aa14.53□□□□□ -0.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NOSTRINQ8IVI9 506 aa14.53□□□□□ -0.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC7A14Q8TBB6 771 aa14.53□□□□□ -0.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NACC1Q96RE7 527 aa14.53□□□□□ -0.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCDC113Q9H0I3 377 aa14.53□□□□□ -0.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NOTCH4Q99466 2003 aa14.53□□□□□ -0.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FRYLO94915 3013 aa14.52□□□□□ -0.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KANSL1LA0AUZ9 987 aa14.52□□□□□ -0.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa14.52□□□□□ -0.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ACKR2O00590 384 aa14.52□□□□□ -0.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 JAK2O60674 1132 aa14.52□□□□□ -0.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LRRN2O75325 713 aa14.52□□□□□ -0.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LIG1P18858 919 aa14.52□□□□□ -0.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MCM7P33993 719 aa14.52□□□□□ -0.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NAMPTP43490 491 aa14.52□□□□□ -0.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RAB33AQ14088 237 aa14.52□□□□□ -0.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa14.52□□□□□ -0.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DEPTORQ8TB45 409 aa14.52□□□□□ -0.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ITFG1Q8TB96 612 aa14.52□□□□□ -0.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MTRRQ9UBK8 725 aa14.52□□□□□ -0.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 USP20Q9Y2K6 914 aa14.52□□□□□ -0.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GDAQ9Y2T3 454 aa14.52□□□□□ -0.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FGFR3P22607 806 aa14.51□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR1D2P34982 312 aa14.51□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RBM25P49756 843 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRKCQQ04759 706 aa14.51□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PPP2R5AQ15172 486 aa14.51□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UVSSAQ2YD98 709 aa14.51□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EEF1DP3Q658K8 133 aa14.51□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PADI6Q6TGC4 694 aa14.51□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KIAA2013Q8IYS2 634 aa14.51□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ERMNQ8TAM6 284 aa14.51□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RMDN1Q96DB5 314 aa14.51□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HINFPQ9BQA5 517 aa14.51□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa14.51□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa14.51□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa14.51□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ARHGEF35A5YM69 484 aa14.5□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CYP11B2P19099 503 aa14.5□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RPA1P27694 616 aa14.5□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PFKPQ01813 784 aa14.5□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GLRA4Q5JXX5 417 aa14.5□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NPAS3Q8IXF0 933 aa14.5□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms