RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409958.6

VSX1-204, Transcript of visual system homeobox 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene VSX1, Length 1,305 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSX1-204ENST00000409958 USP25Q9UHP3 1055 aa22.68■■□□□ 1.22
VSX1-204ENST00000409958 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa22.68■■□□□ 1.22
VSX1-204ENST00000409958 A0A0B4J269 797 aa22.67■■□□□ 1.22
VSX1-204ENST00000409958 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa22.67■■□□□ 1.22
VSX1-204ENST00000409958 A0A1W2PQ27 194 aa22.67■■□□□ 1.22
VSX1-204ENST00000409958 A0A1W2PQ64 194 aa22.67■■□□□ 1.22
VSX1-204ENST00000409958 A0A1W2PQD8 194 aa22.67■■□□□ 1.22
VSX1-204ENST00000409958 C2orf71A6NGG8 1288 aa22.67■■□□□ 1.22
VSX1-204ENST00000409958 HIDE1A8MVS5 230 aa22.67■■□□□ 1.22
VSX1-204ENST00000409958 EFEMP2O95967 443 aa22.67■■□□□ 1.22
VSX1-204ENST00000409958 ASIC1P78348 528 aa22.67■■□□□ 1.22
VSX1-204ENST00000409958 ADAM15Q13444 863 aa22.67■■□□□ 1.22
VSX1-204ENST00000409958 DUSP6Q16828 381 aa22.67■■□□□ 1.22
VSX1-204ENST00000409958 TJAP1Q5JTD0 557 aa22.67■■□□□ 1.22
VSX1-204ENST00000409958 GLRA4Q5JXX5 417 aa22.67■■□□□ 1.22
VSX1-204ENST00000409958 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
VSX1-204ENST00000409958 SLC39A4Q6P5W5 647 aa22.67■■□□□ 1.22
VSX1-204ENST00000409958 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
VSX1-204ENST00000409958 GDPD2Q9HCC8 539 aa22.67■■□□□ 1.22
VSX1-204ENST00000409958 CNTN3Q9P232 1028 aa22.67■■□□□ 1.22
VSX1-204ENST00000409958 SERTAD1Q9UHV2 236 aa22.67■■□□□ 1.22
VSX1-204ENST00000409958 EXOC7Q9UPT5 735 aa22.67■■□□□ 1.22
VSX1-204ENST00000409958 IRAK3Q9Y616 596 aa22.67■■□□□ 1.22
VSX1-204ENST00000409958 TRIP11Q15643 1979 aa22.67■■□□□ 1.22
VSX1-204ENST00000409958 CITO14578 2027 aa22.67■■□□□ 1.22
VSX1-204ENST00000409958 CASTOR2A6NHX0 329 aa22.66■■□□□ 1.22
VSX1-204ENST00000409958 DLL1O00548 723 aa22.66■■□□□ 1.22
VSX1-204ENST00000409958 OGTO15294 1046 aa22.66■■□□□ 1.22
VSX1-204ENST00000409958 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
VSX1-204ENST00000409958 CXCL14O95715 111 aa22.66■■□□□ 1.22
VSX1-204ENST00000409958 SOD2P04179 222 aa22.66■■□□□ 1.22
VSX1-204ENST00000409958 CLTAP09496 248 aa22.66■■□□□ 1.22
VSX1-204ENST00000409958 KCNE1P15382 129 aa22.66■■□□□ 1.22
VSX1-204ENST00000409958 KCNA5P22460 613 aa22.66■■□□□ 1.22
VSX1-204ENST00000409958 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
VSX1-204ENST00000409958 SLC10A6Q3KNW5 377 aa22.66■■□□□ 1.22
VSX1-204ENST00000409958 SEZ6Q53EL9 994 aa22.66■■□□□ 1.22
VSX1-204ENST00000409958 SLFN12LQ6IEE8 588 aa22.66■■□□□ 1.22
VSX1-204ENST00000409958 EP400NLQ6ZTU2 488 aa22.66■■□□□ 1.22
VSX1-204ENST00000409958 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
VSX1-204ENST00000409958 ACCSQ96QU6 501 aa22.66■■□□□ 1.22
VSX1-204ENST00000409958 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa22.66■■□□□ 1.22
VSX1-204ENST00000409958 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa22.66■■□□□ 1.22
VSX1-204ENST00000409958 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
VSX1-204ENST00000409958 STYXL1Q9Y6J8 313 aa22.66■■□□□ 1.22
VSX1-204ENST00000409958 VCANP13611 3396 aa22.66■■□□□ 1.22
VSX1-204ENST00000409958 ANKRD63C9JTQ0 380 aa22.65■■□□□ 1.22
VSX1-204ENST00000409958 F8W810 466 aa22.65■■□□□ 1.22
VSX1-204ENST00000409958 PER2O15055 1255 aa22.65■■□□□ 1.22
VSX1-204ENST00000409958 FAM189A1O60320 539 aa22.65■■□□□ 1.22
VSX1-204ENST00000409958 MYBP10242 640 aa22.65■■□□□ 1.22
VSX1-204ENST00000409958 LTBRP36941 435 aa22.65■■□□□ 1.22
VSX1-204ENST00000409958 KCNQ1P51787 676 aa22.65■■□□□ 1.22
VSX1-204ENST00000409958 CASP5P51878 434 aa22.65■■□□□ 1.22
VSX1-204ENST00000409958 LEXMQ3ZCV2 418 aa22.65■■□□□ 1.22
VSX1-204ENST00000409958 UNC13DQ70J99 1090 aa22.65■■□□□ 1.22
VSX1-204ENST00000409958 PAAF1Q9BRP4 392 aa22.65■■□□□ 1.22
VSX1-204ENST00000409958 MSTO1Q9BUK6 570 aa22.65■■□□□ 1.22
VSX1-204ENST00000409958 SLC38A7Q9NVC3 462 aa22.65■■□□□ 1.22
VSX1-204ENST00000409958 ADAM28Q9UKQ2 775 aa22.65■■□□□ 1.22
VSX1-204ENST00000409958 LINC01565O15544 149 aa22.64■■□□□ 1.22
VSX1-204ENST00000409958 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.22
VSX1-204ENST00000409958 SYKP43405 635 aa22.64■■□□□ 1.22
VSX1-204ENST00000409958 AFMP43652 599 aa22.64■■□□□ 1.22
VSX1-204ENST00000409958 NDUFA8P51970 172 aa22.64■■□□□ 1.22
VSX1-204ENST00000409958 KCNA1Q09470 495 aa22.64■■□□□ 1.22
VSX1-204ENST00000409958 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa22.64■■□□□ 1.22
VSX1-204ENST00000409958 RABGGTAQ92696 567 aa22.64■■□□□ 1.22
VSX1-204ENST00000409958 UROC1Q96N76 676 aa22.64■■□□□ 1.22
VSX1-204ENST00000409958 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.22
VSX1-204ENST00000409958 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa22.64■■□□□ 1.22
VSX1-204ENST00000409958 BLZF1Q9H2G9 400 aa22.64■■□□□ 1.22
VSX1-204ENST00000409958 CACNG4Q9UBN1 327 aa22.64■■□□□ 1.22
VSX1-204ENST00000409958 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
VSX1-204ENST00000409958 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa22.63■■□□□ 1.21
VSX1-204ENST00000409958 TISP43B9A030 160 aa22.63■■□□□ 1.21
VSX1-204ENST00000409958 TADA2AO75478 443 aa22.63■■□□□ 1.21
VSX1-204ENST00000409958 CXCL8P10145 99 aa22.63■■□□□ 1.21
VSX1-204ENST00000409958 CA8P35219 290 aa22.63■■□□□ 1.21
VSX1-204ENST00000409958 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
VSX1-204ENST00000409958 CUL4BQ13620 913 aa22.63■■□□□ 1.21
VSX1-204ENST00000409958 POSTNQ15063 836 aa22.63■■□□□ 1.21
VSX1-204ENST00000409958 PTPN14Q15678 1187 aa22.63■■□□□ 1.21
VSX1-204ENST00000409958 FUT10Q6P4F1 479 aa22.63■■□□□ 1.21
VSX1-204ENST00000409958 FSIP1Q8NA03 581 aa22.63■■□□□ 1.21
VSX1-204ENST00000409958 AUTS2Q8WXX7 1259 aa22.63■■□□□ 1.21
VSX1-204ENST00000409958 PAGE5Q96GU1 130 aa22.63■■□□□ 1.21
VSX1-204ENST00000409958 TMEM206Q9H813 350 aa22.63■■□□□ 1.21
VSX1-204ENST00000409958 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa22.63■■□□□ 1.21
VSX1-204ENST00000409958 TTC26A0AVF1 554 aa22.62■■□□□ 1.21
VSX1-204ENST00000409958 H3BQ06 376 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
VSX1-204ENST00000409958 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa22.62■■□□□ 1.21
VSX1-204ENST00000409958 LILRB3O75022 631 aa22.62■■□□□ 1.21
VSX1-204ENST00000409958 TBX10O75333 385 aa22.62■■□□□ 1.21
VSX1-204ENST00000409958 KIF4AO95239 1232 aa22.62■■□□□ 1.21
VSX1-204ENST00000409958 GLP2RO95838 553 aa22.62■■□□□ 1.21
VSX1-204ENST00000409958 URODP06132 367 aa22.62■■□□□ 1.21
VSX1-204ENST00000409958 BMP1P13497 986 aa22.62■■□□□ 1.21
VSX1-204ENST00000409958 CASP1P29466 404 aa22.62■■□□□ 1.21
VSX1-204ENST00000409958 TNFSF9P41273 254 aa22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms