RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403084.1

CLDN5-201, Transcript of claudin 5, humanhuman

BASIC

Gene CLDN5, Length 2,357 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN5-201ENST00000403084 ZFP69BQ9UJL9 534 aa23.29■■□□□ 1.32
CLDN5-201ENST00000403084 DLATP10515 647 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
CLDN5-201ENST00000403084 SLC34A1Q06495 639 aa23.29■■□□□ 1.32
CLDN5-201ENST00000403084 KCNA1Q09470 495 aa23.29■■□□□ 1.32
CLDN5-201ENST00000403084 CTC1Q2NKJ3 1217 aa23.29■■□□□ 1.32
CLDN5-201ENST00000403084 CBWD6Q4V339 395 aa23.29■■□□□ 1.32
CLDN5-201ENST00000403084 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
CLDN5-201ENST00000403084 ASPRV1Q53RT3 343 aa23.29■■□□□ 1.32
CLDN5-201ENST00000403084 CBWD3Q5JTY5 395 aa23.29■■□□□ 1.32
CLDN5-201ENST00000403084 CBWD5Q5RIA9 395 aa23.29■■□□□ 1.32
CLDN5-201ENST00000403084 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa23.29■■□□□ 1.32
CLDN5-201ENST00000403084 TRABD2AQ86V40 505 aa23.29■■□□□ 1.32
CLDN5-201ENST00000403084 CATSPER3Q86XQ3 398 aa23.29■■□□□ 1.32
CLDN5-201ENST00000403084 RELL1Q8IUW5 271 aa23.29■■□□□ 1.32
CLDN5-201ENST00000403084 TRAIPQ9BWF2 469 aa23.29■■□□□ 1.32
CLDN5-201ENST00000403084 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
CLDN5-201ENST00000403084 CCDC87Q9NVE4 849 aa23.29■■□□□ 1.32
CLDN5-201ENST00000403084 DOT1LQ8TEK3 1739 aa23.29■■□□□ 1.32
CLDN5-201ENST00000403084 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa23.29■■□□□ 1.32
CLDN5-201ENST00000403084 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa23.29■■□□□ 1.32
CLDN5-201ENST00000403084 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
CLDN5-201ENST00000403084 C2CD2LO14523 706 aa23.28■■□□□ 1.32
CLDN5-201ENST00000403084 GCNT3O95395 438 aa23.28■■□□□ 1.32
CLDN5-201ENST00000403084 RFX1P22670 979 aa23.28■■□□□ 1.32
CLDN5-201ENST00000403084 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP23.28■■□□□ 1.32
CLDN5-201ENST00000403084 ARHGAP44Q17R89 818 aa23.28■■□□□ 1.32
CLDN5-201ENST00000403084 SGO2Q562F6 1265 aa23.28■■□□□ 1.32
CLDN5-201ENST00000403084 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
CLDN5-201ENST00000403084 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
CLDN5-201ENST00000403084 JAG2Q9Y219 1238 aa23.28■■□□□ 1.32
CLDN5-201ENST00000403084 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa23.28■■□□□ 1.32
CLDN5-201ENST00000403084 A0A1W2PRG0 241 aa23.28■■□□□ 1.32
CLDN5-201ENST00000403084 AP1B1Q10567 949 aa23.28■■□□□ 1.32
CLDN5-201ENST00000403084 TMED2Q15363 201 aa23.28■■□□□ 1.32
CLDN5-201ENST00000403084 GSTA3Q16772 222 aa23.28■■□□□ 1.32
CLDN5-201ENST00000403084 DSTYKQ6XUX3 929 aa23.28■■□□□ 1.32
CLDN5-201ENST00000403084 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa23.28■■□□□ 1.32
CLDN5-201ENST00000403084 C1orf54Q8WWF1 131 aa23.28■■□□□ 1.32
CLDN5-201ENST00000403084 DNM3Q9UQ16 869 aa23.28■■□□□ 1.32
CLDN5-201ENST00000403084 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
CLDN5-201ENST00000403084 RSPH10B2B2RC85 870 aa23.27■■□□□ 1.32
CLDN5-201ENST00000403084 RSPH10BP0C881 870 aa23.27■■□□□ 1.32
CLDN5-201ENST00000403084 MAN1A1P33908 653 aa23.27■■□□□ 1.32
CLDN5-201ENST00000403084 NLRP9Q7RTR0 991 aa23.27■■□□□ 1.32
CLDN5-201ENST00000403084 ARHGAP18Q8N392 663 aa23.27■■□□□ 1.32
CLDN5-201ENST00000403084 ZNF398Q8TD17 642 aa23.27■■□□□ 1.32
CLDN5-201ENST00000403084 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
CLDN5-201ENST00000403084 NCSTNQ92542 709 aa23.27■■□□□ 1.32
CLDN5-201ENST00000403084 UIMC1Q96RL1 719 aa23.27■■□□□ 1.32
CLDN5-201ENST00000403084 RUSC1Q9BVN2 902 aa23.27■■□□□ 1.32
CLDN5-201ENST00000403084 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa23.27■■□□□ 1.32
CLDN5-201ENST00000403084 ANAPC5Q9UJX4 755 aa23.27■■□□□ 1.32
CLDN5-201ENST00000403084 GRID1Q9ULK0 1009 aa23.27■■□□□ 1.32
CLDN5-201ENST00000403084 SPOPO43791 374 aa23.27■■□□□ 1.32
CLDN5-201ENST00000403084 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
CLDN5-201ENST00000403084 ABHD2P08910 425 aa23.27■■□□□ 1.32
CLDN5-201ENST00000403084 CPNE8Q86YQ8 564 aa23.27■■□□□ 1.32
CLDN5-201ENST00000403084 GBP5Q96PP8 586 aa23.27■■□□□ 1.32
CLDN5-201ENST00000403084 LMCD1Q9NZU5 365 aa23.27■■□□□ 1.32
CLDN5-201ENST00000403084 CLDN3O15551 220 aa23.26■■□□□ 1.31
CLDN5-201ENST00000403084 CCDC22O60826 627 aa23.26■■□□□ 1.31
CLDN5-201ENST00000403084 SPAG7O75391 227 aa23.26■■□□□ 1.31
CLDN5-201ENST00000403084 KRT36O76013 467 aa23.26■■□□□ 1.31
CLDN5-201ENST00000403084 RANBP1P43487 201 aa23.26■■□□□ 1.31
CLDN5-201ENST00000403084 SPIRE1Q08AE8 756 aa23.26■■□□□ 1.31
CLDN5-201ENST00000403084 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
CLDN5-201ENST00000403084 ACSBG2Q5FVE4 666 aa23.26■■□□□ 1.31
CLDN5-201ENST00000403084 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa23.26■■□□□ 1.31
CLDN5-201ENST00000403084 CLNKQ7Z7G1 428 aa23.26■■□□□ 1.31
CLDN5-201ENST00000403084 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP23.26■■□□□ 1.31
CLDN5-201ENST00000403084 PSMG1O95456 288 aa23.26■■□□□ 1.31
CLDN5-201ENST00000403084 ATF2P15336 505 aa23.26■■□□□ 1.31
CLDN5-201ENST00000403084 GSTT1P30711 240 aa23.26■■□□□ 1.31
CLDN5-201ENST00000403084 ERFEQ4G0M1 354 aa23.26■■□□□ 1.31
CLDN5-201ENST00000403084 SLFN12Q8IYM2 578 aa23.26■■□□□ 1.31
CLDN5-201ENST00000403084 MBOAT7Q96N66 472 aa23.26■■□□□ 1.31
CLDN5-201ENST00000403084 BTBD10Q9BSF8 475 aa23.26■■□□□ 1.31
CLDN5-201ENST00000403084 OLFML3Q9NRN5 406 aa23.26■■□□□ 1.31
CLDN5-201ENST00000403084 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
CLDN5-201ENST00000403084 FAM196BA6NMK8 535 aa23.25■■□□□ 1.31
CLDN5-201ENST00000403084 CAPN9O14815 690 aa23.25■■□□□ 1.31
CLDN5-201ENST00000403084 LRRN2O75325 713 aa23.25■■□□□ 1.31
CLDN5-201ENST00000403084 ZWINTO95229 277 aa23.25■■□□□ 1.31
CLDN5-201ENST00000403084 LDHBP07195 334 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
CLDN5-201ENST00000403084 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa23.25■■□□□ 1.31
CLDN5-201ENST00000403084 SNHG28P0DPA3 235 aa23.25■■□□□ 1.31
CLDN5-201ENST00000403084 RPA1P27694 616 aa23.25■■□□□ 1.31
CLDN5-201ENST00000403084 SERPINB4P48594 390 aa23.25■■□□□ 1.31
CLDN5-201ENST00000403084 MYL7Q01449 175 aa23.25■■□□□ 1.31
CLDN5-201ENST00000403084 CCNJLQ8IV13 435 aa23.25■■□□□ 1.31
CLDN5-201ENST00000403084 PPFIBP2Q8ND30 876 aa23.25■■□□□ 1.31
CLDN5-201ENST00000403084 GRK7Q8WTQ7 553 aa23.25■■□□□ 1.31
CLDN5-201ENST00000403084 PWWP2AQ96N64 755 aa23.25■■□□□ 1.31
CLDN5-201ENST00000403084 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
CLDN5-201ENST00000403084 CCDC28BQ9BUN5 200 aa23.25■■□□□ 1.31
CLDN5-201ENST00000403084 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
CLDN5-201ENST00000403084 JMJD4Q9H9V9 463 aa23.25■■□□□ 1.31
CLDN5-201ENST00000403084 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
CLDN5-201ENST00000403084 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa23.25■■□□□ 1.31
CLDN5-201ENST00000403084 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.1 ms