RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402096.5

ATG4B-204, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ATG4B, Length 1,685 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-204ENST00000402096 TMEM139Q8IV31 216 aa22.18■■□□□ 1.14
ATG4B-204ENST00000402096 FBXL13Q8NEE6 735 aa22.18■■□□□ 1.14
ATG4B-204ENST00000402096 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
ATG4B-204ENST00000402096 OGDHLQ9ULD0 1010 aa22.18■■□□□ 1.14
ATG4B-204ENST00000402096 FHOD1Q9Y613 1164 aa22.18■■□□□ 1.14
ATG4B-204ENST00000402096 PTPRJQ12913 1337 aa22.18■■□□□ 1.14
ATG4B-204ENST00000402096 PMM2O15305 246 aa22.17■■□□□ 1.14
ATG4B-204ENST00000402096 B4GALT4O60513 344 aa22.17■■□□□ 1.14
ATG4B-204ENST00000402096 CLDN10P78369 228 aa22.17■■□□□ 1.14
ATG4B-204ENST00000402096 MGAT3Q09327 533 aa22.17■■□□□ 1.14
ATG4B-204ENST00000402096 RAPGEF1Q13905 1077 aa22.17■■□□□ 1.14
ATG4B-204ENST00000402096 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa22.17■■□□□ 1.14
ATG4B-204ENST00000402096 PDXDC1Q6P996 788 aa22.17■■□□□ 1.14
ATG4B-204ENST00000402096 GJB7Q6PEY0 223 aa22.17■■□□□ 1.14
ATG4B-204ENST00000402096 SLC43A3Q8NBI5 491 aa22.17■■□□□ 1.14
ATG4B-204ENST00000402096 BAP1Q92560 729 aa22.17■■□□□ 1.14
ATG4B-204ENST00000402096 SPAG5Q96R06 1193 aa22.17■■□□□ 1.14
ATG4B-204ENST00000402096 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
ATG4B-204ENST00000402096 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP22.17■■□□□ 1.142e-6■■■■■ 96.1
ATG4B-204ENST00000402096 CLSTN1O94985 981 aa22.17■■□□□ 1.14
ATG4B-204ENST00000402096 IL18RAPO95256 599 aa22.17■■□□□ 1.14
ATG4B-204ENST00000402096 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
ATG4B-204ENST00000402096 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
ATG4B-204ENST00000402096 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
ATG4B-204ENST00000402096 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
ATG4B-204ENST00000402096 GPIHBP1Q8IV16 184 aa22.17■■□□□ 1.14
ATG4B-204ENST00000402096 WDR49Q8IV35 697 aa22.17■■□□□ 1.14
ATG4B-204ENST00000402096 LMO3Q8TAP4 145 aa22.17■■□□□ 1.14
ATG4B-204ENST00000402096 TAS1R2Q8TE23 839 aa22.17■■□□□ 1.14
ATG4B-204ENST00000402096 ACAP3Q96P50 834 aa22.17■■□□□ 1.14
ATG4B-204ENST00000402096 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
ATG4B-204ENST00000402096 APEX2Q9UBZ4 518 aa22.17■■□□□ 1.14
ATG4B-204ENST00000402096 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa22.16■■□□□ 1.14
ATG4B-204ENST00000402096 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa22.16■■□□□ 1.14
ATG4B-204ENST00000402096 ARHGAP6O43182 974 aa22.16■■□□□ 1.14
ATG4B-204ENST00000402096 PHACTR2O75167 634 aa22.16■■□□□ 1.14
ATG4B-204ENST00000402096 LRRN2O75325 713 aa22.16■■□□□ 1.14
ATG4B-204ENST00000402096 TFRCP02786 760 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
ATG4B-204ENST00000402096 PIK3CAP42336 1068 aa22.16■■□□□ 1.14
ATG4B-204ENST00000402096 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
ATG4B-204ENST00000402096 IQCEQ6IPM2 695 aa22.16■■□□□ 1.14
ATG4B-204ENST00000402096 CYP26C1Q6V0L0 522 aa22.16■■□□□ 1.14
ATG4B-204ENST00000402096 OR5B17Q8NGF7 314 aa22.16■■□□□ 1.14
ATG4B-204ENST00000402096 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
ATG4B-204ENST00000402096 RAB20Q9NX57 234 aa22.16■■□□□ 1.14
ATG4B-204ENST00000402096 TRIP11Q15643 1979 aa22.16■■□□□ 1.14
ATG4B-204ENST00000402096 SOWAHDA6NJG2 315 aa22.15■■□□□ 1.14
ATG4B-204ENST00000402096 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
ATG4B-204ENST00000402096 TMEM191BP0C7N4 346 aa22.15■■□□□ 1.14
ATG4B-204ENST00000402096 GRM5P41594 1212 aa22.15■■□□□ 1.14
ATG4B-204ENST00000402096 AP3M2P53677 418 aa22.15■■□□□ 1.14
ATG4B-204ENST00000402096 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
ATG4B-204ENST00000402096 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
ATG4B-204ENST00000402096 ZACNQ401N2 412 aa22.15■■□□□ 1.14
ATG4B-204ENST00000402096 SFMBT2Q5VUG0 894 aa22.15■■□□□ 1.14
ATG4B-204ENST00000402096 TMTC1Q8IUR5 882 aa22.15■■□□□ 1.14
ATG4B-204ENST00000402096 KIAA1524Q8TCG1 905 aa22.15■■□□□ 1.14
ATG4B-204ENST00000402096 SEMA4DQ92854 862 aa22.15■■□□□ 1.14
ATG4B-204ENST00000402096 ZNF333Q96JL9 665 aa22.15■■□□□ 1.14
ATG4B-204ENST00000402096 FBXL5Q9UKA1 691 aa22.15■■□□□ 1.14
ATG4B-204ENST00000402096 DNAJC12Q9UKB3 198 aa22.15■■□□□ 1.14
ATG4B-204ENST00000402096 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa22.15■■□□□ 1.14
ATG4B-204ENST00000402096 COQ4Q9Y3A0 265 aa22.15■■□□□ 1.14
ATG4B-204ENST00000402096 MROH7Q68CQ1 1323 aa22.15■■□□□ 1.14
ATG4B-204ENST00000402096 LACTBL1A8MY62 500 aa22.14■■□□□ 1.14
ATG4B-204ENST00000402096 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
ATG4B-204ENST00000402096 ZNF618Q5T7W0 954 aa22.14■■□□□ 1.14
ATG4B-204ENST00000402096 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
ATG4B-204ENST00000402096 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa22.14■■□□□ 1.14
ATG4B-204ENST00000402096 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
ATG4B-204ENST00000402096 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
ATG4B-204ENST00000402096 APOL6Q9BWW8 343 aa22.14■■□□□ 1.14
ATG4B-204ENST00000402096 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa22.14■■□□□ 1.14
ATG4B-204ENST00000402096 MTMR12Q9C0I1 747 aa22.14■■□□□ 1.14
ATG4B-204ENST00000402096 SNTG2Q9NY99 539 aa22.14■■□□□ 1.14
ATG4B-204ENST00000402096 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
ATG4B-204ENST00000402096 GPR182O15218 404 aa22.14■■□□□ 1.13
ATG4B-204ENST00000402096 HLA-DRAP01903 254 aa22.14■■□□□ 1.13
ATG4B-204ENST00000402096 TNNC2P02585 160 aa22.14■■□□□ 1.13
ATG4B-204ENST00000402096 GHRP10912 638 aa22.14■■□□□ 1.13
ATG4B-204ENST00000402096 DUOXA2Q1HG44 320 aa22.14■■□□□ 1.13
ATG4B-204ENST00000402096 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa22.14■■□□□ 1.13
ATG4B-204ENST00000402096 WDR59Q6PJI9 974 aa22.14■■□□□ 1.13
ATG4B-204ENST00000402096 ARHGEF19Q8IW93 802 aa22.14■■□□□ 1.13
ATG4B-204ENST00000402096 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa22.14■■□□□ 1.13
ATG4B-204ENST00000402096 NT5C1BQ96P26 610 aa22.14■■□□□ 1.13
ATG4B-204ENST00000402096 CHP1Q99653 195 aa22.14■■□□□ 1.13
ATG4B-204ENST00000402096 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
ATG4B-204ENST00000402096 PLAGL2Q9UPG8 496 aa22.14■■□□□ 1.13
ATG4B-204ENST00000402096 CAND2O75155 1236 aa22.13■■□□□ 1.13
ATG4B-204ENST00000402096 SGPL1O95470 568 aa22.13■■□□□ 1.13
ATG4B-204ENST00000402096 FECHP22830 423 aa22.13■■□□□ 1.13
ATG4B-204ENST00000402096 YARSP54577 528 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
ATG4B-204ENST00000402096 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
ATG4B-204ENST00000402096 PAK2Q13177 524 aa22.13■■□□□ 1.13
ATG4B-204ENST00000402096 ARHGAP44Q17R89 818 aa22.13■■□□□ 1.13
ATG4B-204ENST00000402096 SLC10A6Q3KNW5 377 aa22.13■■□□□ 1.13
ATG4B-204ENST00000402096 FBXO47Q5MNV8 452 aa22.13■■□□□ 1.13
ATG4B-204ENST00000402096 EFCAB13Q8IY85 973 aa22.13■■□□□ 1.13
ATG4B-204ENST00000402096 PI4K2AQ9BTU6 479 aa22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.4 ms