RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399409.7

RABGGTA-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTA, Length 2,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-202ENST00000399409 DOCK1Q14185 1865 aa24.74■■□□□ 1.55
RABGGTA-202ENST00000399409 E7EVH7 732 aa24.74■■□□□ 1.55
RABGGTA-202ENST00000399409 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
RABGGTA-202ENST00000399409 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
RABGGTA-202ENST00000399409 CYFIP1Q7L576 1253 aa24.74■■□□□ 1.55
RABGGTA-202ENST00000399409 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
RABGGTA-202ENST00000399409 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa24.74■■□□□ 1.55
RABGGTA-202ENST00000399409 FBXO25Q8TCJ0 367 aa24.74■■□□□ 1.55
RABGGTA-202ENST00000399409 SLC16A10Q8TF71 515 aa24.74■■□□□ 1.55
RABGGTA-202ENST00000399409 TATDN2Q93075 761 aa24.74■■□□□ 1.55
RABGGTA-202ENST00000399409 BICD1Q96G01 975 aa24.74■■□□□ 1.55
RABGGTA-202ENST00000399409 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
RABGGTA-202ENST00000399409 C1orf112Q9NSG2 853 aa24.74■■□□□ 1.55
RABGGTA-202ENST00000399409 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa24.74■■□□□ 1.55
RABGGTA-202ENST00000399409 GMNCA6NCL1 334 aa24.74■■□□□ 1.55
RABGGTA-202ENST00000399409 MYBL1P10243 752 aa24.74■■□□□ 1.55
RABGGTA-202ENST00000399409 DLATP10515 647 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
RABGGTA-202ENST00000399409 KRT5P13647 590 aa24.74■■□□□ 1.55
RABGGTA-202ENST00000399409 RPL21P46778 160 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
RABGGTA-202ENST00000399409 BPIFB4P59827 614 aa24.74■■□□□ 1.55
RABGGTA-202ENST00000399409 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
RABGGTA-202ENST00000399409 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa24.74■■□□□ 1.55
RABGGTA-202ENST00000399409 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
RABGGTA-202ENST00000399409 EPB41L4BQ9H329 900 aa24.74■■□□□ 1.55
RABGGTA-202ENST00000399409 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa24.74■■□□□ 1.55
RABGGTA-202ENST00000399409 CYP26B1Q9NR63 512 aa24.74■■□□□ 1.55
RABGGTA-202ENST00000399409 SLC9A2Q9UBY0 812 aa24.74■■□□□ 1.55
RABGGTA-202ENST00000399409 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa24.74■■□□□ 1.55
RABGGTA-202ENST00000399409 PASKQ96RG2 1323 aa24.74■■□□□ 1.55
RABGGTA-202ENST00000399409 EXTL3O43909 919 aa24.73■■□□□ 1.55
RABGGTA-202ENST00000399409 DSG3P32926 999 aa24.73■■□□□ 1.55
RABGGTA-202ENST00000399409 SEC24CP53992 1094 aa24.73■■□□□ 1.55
RABGGTA-202ENST00000399409 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
RABGGTA-202ENST00000399409 SLMAPQ14BN4 828 aa24.73■■□□□ 1.55
RABGGTA-202ENST00000399409 CCDC105Q8IYK2 499 aa24.73■■□□□ 1.55
RABGGTA-202ENST00000399409 ZNF280CQ8ND82 737 aa24.73■■□□□ 1.55
RABGGTA-202ENST00000399409 PGM2Q96G03 612 aa24.73■■□□□ 1.55
RABGGTA-202ENST00000399409 WNK4Q96J92 1243 aa24.73■■□□□ 1.55
RABGGTA-202ENST00000399409 C12orf42Q96LP6 360 aa24.73■■□□□ 1.55
RABGGTA-202ENST00000399409 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
RABGGTA-202ENST00000399409 ZNF112Q9UJU3 913 aa24.73■■□□□ 1.55
RABGGTA-202ENST00000399409 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa24.73■■□□□ 1.55
RABGGTA-202ENST00000399409 WDR81Q562E7 1941 aa24.73■■□□□ 1.55
RABGGTA-202ENST00000399409 TRAPPC3O43617 180 aa24.73■■□□□ 1.55
RABGGTA-202ENST00000399409 CLDN10P78369 228 aa24.73■■□□□ 1.55
RABGGTA-202ENST00000399409 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
RABGGTA-202ENST00000399409 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa24.73■■□□□ 1.55
RABGGTA-202ENST00000399409 MAIP1Q8WWC4 291 aa24.73■■□□□ 1.55
RABGGTA-202ENST00000399409 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
RABGGTA-202ENST00000399409 KCNN1Q92952 543 aa24.73■■□□□ 1.55
RABGGTA-202ENST00000399409 BTBD6Q96KE9 485 aa24.73■■□□□ 1.55
RABGGTA-202ENST00000399409 FAM213AQ9BRX8 229 aa24.73■■□□□ 1.55
RABGGTA-202ENST00000399409 LRRC19Q9H756 370 aa24.73■■□□□ 1.55
RABGGTA-202ENST00000399409 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
RABGGTA-202ENST00000399409 EGFRP00533 1210 aa24.72■■□□□ 1.55
RABGGTA-202ENST00000399409 RARAP10276 462 aa24.72■■□□□ 1.55
RABGGTA-202ENST00000399409 SOX10P56693 466 aa24.72■■□□□ 1.55
RABGGTA-202ENST00000399409 PRKCEQ02156 737 aa24.72■■□□□ 1.55
RABGGTA-202ENST00000399409 PSMD6Q15008 389 aa24.72■■□□□ 1.55
RABGGTA-202ENST00000399409 SLCO2A1Q92959 643 aa24.72■■□□□ 1.55
RABGGTA-202ENST00000399409 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
RABGGTA-202ENST00000399409 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
RABGGTA-202ENST00000399409 TMEM51Q9NW97 253 aa24.72■■□□□ 1.55
RABGGTA-202ENST00000399409 FSCN2O14926 492 aa24.72■■□□□ 1.55
RABGGTA-202ENST00000399409 RGS20O76081 388 aa24.72■■□□□ 1.55
RABGGTA-202ENST00000399409 ACTR2P61160 394 aa24.72■■□□□ 1.55
RABGGTA-202ENST00000399409 GNPTABQ3T906 1256 aa24.72■■□□□ 1.55
RABGGTA-202ENST00000399409 XKR3Q5GH77 459 aa24.72■■□□□ 1.55
RABGGTA-202ENST00000399409 WDR44Q5JSH3 913 aa24.72■■□□□ 1.55
RABGGTA-202ENST00000399409 ABHD15Q6UXT9 468 aa24.72■■□□□ 1.55
RABGGTA-202ENST00000399409 TMEM109Q9BVC6 243 aa24.72■■□□□ 1.55
RABGGTA-202ENST00000399409 PICK1Q9NRD5 415 aa24.72■■□□□ 1.55
RABGGTA-202ENST00000399409 HACL1Q9UJ83 578 aa24.72■■□□□ 1.55
RABGGTA-202ENST00000399409 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa24.72■■□□□ 1.55
RABGGTA-202ENST00000399409 ATP2A1O14983 1001 aa24.71■■□□□ 1.55
RABGGTA-202ENST00000399409 UNGP13051 313 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
RABGGTA-202ENST00000399409 MAPK4P31152 587 aa24.71■■□□□ 1.55
RABGGTA-202ENST00000399409 SLC1A1P43005 524 aa24.71■■□□□ 1.55
RABGGTA-202ENST00000399409 TGFB2P61812 414 aa24.71■■□□□ 1.55
RABGGTA-202ENST00000399409 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
RABGGTA-202ENST00000399409 TAS1R3Q7RTX0 852 aa24.71■■□□□ 1.55
RABGGTA-202ENST00000399409 ART4Q93070 314 aa24.71■■□□□ 1.55
RABGGTA-202ENST00000399409 CENPTQ96BT3 561 aa24.71■■□□□ 1.55
RABGGTA-202ENST00000399409 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa24.7■■□□□ 1.55
RABGGTA-202ENST00000399409 LIG4P49917 911 aa24.7■■□□□ 1.55
RABGGTA-202ENST00000399409 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.55
RABGGTA-202ENST00000399409 ARMC9Q7Z3E5 817 aa24.7■■□□□ 1.55
RABGGTA-202ENST00000399409 MCOLN2Q8IZK6 566 aa24.7■■□□□ 1.55
RABGGTA-202ENST00000399409 OTUD6BQ8N6M0 293 aa24.7■■□□□ 1.55
RABGGTA-202ENST00000399409 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.55
RABGGTA-202ENST00000399409 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.55
RABGGTA-202ENST00000399409 STYXL1Q9Y6J8 313 aa24.7■■□□□ 1.55
RABGGTA-202ENST00000399409 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa24.7■■□□□ 1.54
RABGGTA-202ENST00000399409 C19orf81C9J6K1 198 aa24.7■■□□□ 1.54
RABGGTA-202ENST00000399409 ECEL1O95672 775 aa24.7■■□□□ 1.54
RABGGTA-202ENST00000399409 ADCY2Q08462 1091 aa24.7■■□□□ 1.54
RABGGTA-202ENST00000399409 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
RABGGTA-202ENST00000399409 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
RABGGTA-202ENST00000399409 PHIPQ8WWQ0 1821 aa24.7■■□□□ 1.54
RABGGTA-202ENST00000399409 PTPRAP18433 802 aa24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.2 ms