RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394272.7

HDDC3-202, Transcript of HD domain containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HDDC3, Length 1,880 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3-202ENST00000394272 NDUFA10O95299 355 aa21.97■■□□□ 1.11
HDDC3-202ENST00000394272 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
HDDC3-202ENST00000394272 SURF1Q15526 300 aa21.97■■□□□ 1.11
HDDC3-202ENST00000394272 CATSPER4Q7RTX7 472 aa21.97■■□□□ 1.11
HDDC3-202ENST00000394272 CITO14578 2027 aa21.97■■□□□ 1.11
HDDC3-202ENST00000394272 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
HDDC3-202ENST00000394272 ZSCAN12O43309 604 aa21.96■■□□□ 1.11
HDDC3-202ENST00000394272 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
HDDC3-202ENST00000394272 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
HDDC3-202ENST00000394272 RPAINQ86UA6 219 aa21.96■■□□□ 1.11
HDDC3-202ENST00000394272 WDR49Q8IV35 697 aa21.96■■□□□ 1.11
HDDC3-202ENST00000394272 REXO1L1PQ8IX06 675 aa21.96■■□□□ 1.11
HDDC3-202ENST00000394272 TMEM192Q8IY95 271 aa21.96■■□□□ 1.11
HDDC3-202ENST00000394272 WNT8BQ93098 351 aa21.96■■□□□ 1.11
HDDC3-202ENST00000394272 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
HDDC3-202ENST00000394272 GPR88Q9GZN0 384 aa21.96■■□□□ 1.11
HDDC3-202ENST00000394272 SERPING1P05155 500 aa21.96■■□□□ 1.11
HDDC3-202ENST00000394272 CCDC175P0C221 793 aa21.96■■□□□ 1.11
HDDC3-202ENST00000394272 KYAT1Q16773 422 aa21.96■■□□□ 1.11
HDDC3-202ENST00000394272 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa21.96■■□□□ 1.11
HDDC3-202ENST00000394272 ARHGEF19Q8IW93 802 aa21.96■■□□□ 1.11
HDDC3-202ENST00000394272 OR5B17Q8NGF7 314 aa21.96■■□□□ 1.11
HDDC3-202ENST00000394272 SH3TC2Q8TF17 1288 aa21.96■■□□□ 1.11
HDDC3-202ENST00000394272 PTPN22Q9Y2R2 807 aa21.96■■□□□ 1.11
HDDC3-202ENST00000394272 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa21.95■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 F8VZ95 297 aa21.95■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 CLTAP09496 248 aa21.95■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 STAG3L1P0CL83 205 aa21.95■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 AP3M2P53677 418 aa21.95■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 OSTNP61366 133 aa21.95■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 ITGA7Q13683 1181 aa21.95■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa21.95■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 GPIHBP1Q8IV16 184 aa21.95■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 ACRBPQ8NEB7 543 aa21.95■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 ADPGKQ9BRR6 497 aa21.95■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 B4GALT4O60513 344 aa21.94■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 CXCL8P10145 99 aa21.94■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 AXLP30530 894 aa21.94■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 ASIC2Q16515 512 aa21.94■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 NYAP1Q6ZVC0 841 aa21.94■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP21.94■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP21.94■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 VNN1O95497 513 aa21.94■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 PRKCIP41743 596 aa21.94■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 STAT1P42224 750 aa21.94■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa21.94■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 NOTUMQ6P988 496 aa21.94■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 RSPH3Q86UC2 560 aa21.94■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 CCDC42Q96M95 316 aa21.94■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 IL18RAPO95256 599 aa21.93■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 HLA-DRAP01903 254 aa21.93■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 SOX5P35711 763 aa21.93■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 PTGISQ16647 500 aa21.93■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 SLC27A1Q6PCB7 646 aa21.93■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 EFCAB13Q8IY85 973 aa21.93■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 HELQQ8TDG4 1101 aa21.93■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 VTI1AQ96AJ9 217 aa21.93■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 FAM212AQ96EL1 285 aa21.93■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 GLT1D1Q96MS3 346 aa21.93■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 NT5C1BQ96P26 610 aa21.93■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 TRPV2Q9Y5S1 764 aa21.93■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 CDY2AQ9Y6F7 541 aa21.93■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 TRIP11Q15643 1979 aa21.93■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 ARID5AQ03989 594 aa21.92■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 BIRC3Q13489 604 aa21.92■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa21.92■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa21.92■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 M0QZ92 97 aa21.92■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 LCA5LO95447 670 aa21.92■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 FERP16591 822 aa21.92■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 GRM5P41594 1212 aa21.92■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 KIF11P52732 1056 aa21.92■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 MGAT3Q09327 533 aa21.92■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 KLHL30Q0D2K2 578 aa21.92■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 ARHGAP44Q17R89 818 aa21.92■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 DUOXA2Q1HG44 320 aa21.92■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 ARRDC4Q8NCT1 418 aa21.92■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 KAT5Q92993 513 aa21.92■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 KREMEN1Q96MU8 473 aa21.92■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 MTMR12Q9C0I1 747 aa21.92■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.9 ms