RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000390930.1

SNORD17-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 17, humanhuman

BASIC

Gene SNORD17, Length 237 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD17-201ENST00000390930 B3GALT6Q96L58 329 aa3.8□□□□□ -1.8
SNORD17-201ENST00000390930 SNX27Q96L92 541 aa3.8□□□□□ -1.8
SNORD17-201ENST00000390930 ZNF558Q96NG5 402 aa3.8□□□□□ -1.8
SNORD17-201ENST00000390930 CBWD1Q9BRT8 395 aa3.8□□□□□ -1.8
SNORD17-201ENST00000390930 TMEM175Q9BSA9 504 aa3.8□□□□□ -1.8
SNORD17-201ENST00000390930 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
SNORD17-201ENST00000390930 GPR62Q9BZJ7 368 aa3.8□□□□□ -1.8
SNORD17-201ENST00000390930 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
SNORD17-201ENST00000390930 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
SNORD17-201ENST00000390930 LMAN2LQ9H0V9 348 aa3.8□□□□□ -1.8
SNORD17-201ENST00000390930 ZBP1Q9H171 429 aa3.8□□□□□ -1.8
SNORD17-201ENST00000390930 CUEDC2Q9H467 287 aa3.8□□□□□ -1.8
SNORD17-201ENST00000390930 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
SNORD17-201ENST00000390930 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
SNORD17-201ENST00000390930 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa3.8□□□□□ -1.8
SNORD17-201ENST00000390930 UBN1Q9NPG3 1134 aa3.8□□□□□ -1.8
SNORD17-201ENST00000390930 TLR9Q9NR96 1032 aa3.8□□□□□ -1.8
SNORD17-201ENST00000390930 OLFML3Q9NRN5 406 aa3.8□□□□□ -1.8
SNORD17-201ENST00000390930 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
SNORD17-201ENST00000390930 FAM13BQ9NYF5 915 aa3.8□□□□□ -1.8
SNORD17-201ENST00000390930 SPG21Q9NZD8 308 aa3.8□□□□□ -1.8
SNORD17-201ENST00000390930 CLEC1BQ9P126 229 aa3.8□□□□□ -1.8
SNORD17-201ENST00000390930 CNTN3Q9P232 1028 aa3.8□□□□□ -1.8
SNORD17-201ENST00000390930 KANSL3Q9P2N6 904 aa3.8□□□□□ -1.8
SNORD17-201ENST00000390930 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa3.8□□□□□ -1.8
SNORD17-201ENST00000390930 SEL1LQ9UBV2 794 aa3.8□□□□□ -1.8
SNORD17-201ENST00000390930 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
SNORD17-201ENST00000390930 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
SNORD17-201ENST00000390930 LZTS1Q9Y250 596 aa3.8□□□□□ -1.8
SNORD17-201ENST00000390930 FAN1Q9Y2M0 1017 aa3.8□□□□□ -1.8
SNORD17-201ENST00000390930 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
SNORD17-201ENST00000390930 RWDD3Q9Y3V2 267 aa3.8□□□□□ -1.8
SNORD17-201ENST00000390930 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa3.8□□□□□ -1.8
SNORD17-201ENST00000390930 NOTCH4Q99466 2003 aa3.8□□□□□ -1.8
SNORD17-201ENST00000390930 C2orf16Q68DN1 1984 aa3.8□□□□□ -1.8
SNORD17-201ENST00000390930 TRIOO75962 3097 aa3.79□□□□□ -1.8
SNORD17-201ENST00000390930 MYO10Q9HD67 2058 aa3.79□□□□□ -1.8
SNORD17-201ENST00000390930 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa3.79□□□□□ -1.8
SNORD17-201ENST00000390930 TTC26A0AVF1 554 aa3.79□□□□□ -1.8
SNORD17-201ENST00000390930 GOLGA8IPA6NC78 632 aa3.79□□□□□ -1.8
SNORD17-201ENST00000390930 C2orf71A6NGG8 1288 aa3.79□□□□□ -1.8
SNORD17-201ENST00000390930 GOLGA8JA6NMD2 632 aa3.79□□□□□ -1.8
SNORD17-201ENST00000390930 LACTBL1A8MY62 500 aa3.79□□□□□ -1.8
SNORD17-201ENST00000390930 H0YCG3 227 aa3.79□□□□□ -1.8
SNORD17-201ENST00000390930 I3L4J1 428 aa3.79□□□□□ -1.8
SNORD17-201ENST00000390930 PPEF2O14830 753 aa3.79□□□□□ -1.8
SNORD17-201ENST00000390930 OGTO15294 1046 aa3.79□□□□□ -1.8
SNORD17-201ENST00000390930 CLDN3O15551 220 aa3.79□□□□□ -1.8
SNORD17-201ENST00000390930 ADAM12O43184 909 aa3.79□□□□□ -1.8
SNORD17-201ENST00000390930 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
SNORD17-201ENST00000390930 TBX10O75333 385 aa3.79□□□□□ -1.8
SNORD17-201ENST00000390930 NR1I2O75469 434 aa3.79□□□□□ -1.8
SNORD17-201ENST00000390930 KIF4AO95239 1232 aa3.79□□□□□ -1.8
SNORD17-201ENST00000390930 GCNT3O95395 438 aa3.79□□□□□ -1.8
SNORD17-201ENST00000390930 CXCL14O95715 111 aa3.79□□□□□ -1.8
SNORD17-201ENST00000390930 SOD2P04179 222 aa3.79□□□□□ -1.8
SNORD17-201ENST00000390930 THP07101 528 aa3.79□□□□□ -1.8
SNORD17-201ENST00000390930 CTSAP10619 480 aa3.79□□□□□ -1.8
SNORD17-201ENST00000390930 BMP1P13497 986 aa3.79□□□□□ -1.8
SNORD17-201ENST00000390930 GAP43P17677 238 aa3.79□□□□□ -1.8
SNORD17-201ENST00000390930 SYKP43405 635 aa3.79□□□□□ -1.8
SNORD17-201ENST00000390930 OR1G1P47890 313 aa3.79□□□□□ -1.8
SNORD17-201ENST00000390930 NRIP1P48552 1158 aa3.79□□□□□ -1.8
SNORD17-201ENST00000390930 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
SNORD17-201ENST00000390930 ACOT2P49753 483 aa3.79□□□□□ -1.8
SNORD17-201ENST00000390930 LIG4P49917 911 aa3.79□□□□□ -1.8
SNORD17-201ENST00000390930 KCNQ1P51787 676 aa3.79□□□□□ -1.8
SNORD17-201ENST00000390930 CLCNKBP51801 687 aa3.79□□□□□ -1.8
SNORD17-201ENST00000390930 ASIC1P78348 528 aa3.79□□□□□ -1.8
SNORD17-201ENST00000390930 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
SNORD17-201ENST00000390930 GRIK3Q13003 919 aa3.79□□□□□ -1.8
SNORD17-201ENST00000390930 STRN3Q13033 797 aa3.79□□□□□ -1.8
SNORD17-201ENST00000390930 ADAM15Q13444 863 aa3.79□□□□□ -1.8
SNORD17-201ENST00000390930 TUSC3Q13454 348 aa3.79□□□□□ -1.8
SNORD17-201ENST00000390930 PNOCQ13519 176 aa3.79□□□□□ -1.8
SNORD17-201ENST00000390930 PTPN14Q15678 1187 aa3.79□□□□□ -1.8
SNORD17-201ENST00000390930 PTPROQ16827 1216 aa3.79□□□□□ -1.8
SNORD17-201ENST00000390930 UPP1Q16831 310 aa3.79□□□□□ -1.8
SNORD17-201ENST00000390930 BMT2Q1RMZ1 405 aa3.79□□□□□ -1.8
SNORD17-201ENST00000390930 TMEM132AQ24JP5 1023 aa3.79□□□□□ -1.8
SNORD17-201ENST00000390930 FAM26FQ5R3K3 315 aa3.79□□□□□ -1.8
SNORD17-201ENST00000390930 KIAA0319Q5VV43 1072 aa3.79□□□□□ -1.8
SNORD17-201ENST00000390930 KANK3Q6NY19 840 aa3.79□□□□□ -1.8
SNORD17-201ENST00000390930 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
SNORD17-201ENST00000390930 KRBA2Q6ZNG9 492 aa3.79□□□□□ -1.8
SNORD17-201ENST00000390930 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
SNORD17-201ENST00000390930 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
SNORD17-201ENST00000390930 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP3.79□□□□□ -1.8not detected■■■□□ 15.6
SNORD17-201ENST00000390930 NELFCDQ8IXH7 590 aa3.79□□□□□ -1.8
SNORD17-201ENST00000390930 CCDC65Q8IXS2 484 aa3.79□□□□□ -1.8
SNORD17-201ENST00000390930 EFCAB13Q8IY85 973 aa3.79□□□□□ -1.8
SNORD17-201ENST00000390930 VPS52Q8N1B4 723 aa3.79□□□□□ -1.8
SNORD17-201ENST00000390930 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
SNORD17-201ENST00000390930 TMEM87AQ8NBN3 555 aa3.79□□□□□ -1.8
SNORD17-201ENST00000390930 CXorf38Q8TB03 319 aa3.79□□□□□ -1.8
SNORD17-201ENST00000390930 URGCPQ8TCY9 931 aa3.79□□□□□ -1.8
SNORD17-201ENST00000390930 PLEKHO2Q8TD55 490 aa3.79□□□□□ -1.8
SNORD17-201ENST00000390930 HASPINQ8TF76 798 aa3.79□□□□□ -1.8
SNORD17-201ENST00000390930 SLC22A17Q8WUG5 538 aa3.79□□□□□ -1.8
SNORD17-201ENST00000390930 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.3 ms