RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000389398.9

VWA3A-202, Transcript of von Willebrand factor A domain containing 3A, humanhuman

APPRIS P2 TSL 5 BASIC

Gene VWA3A, Length 4,600 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3A-202ENST00000389398 AMACRQ9UHK6 382 aa8.4□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 A0A0G2JPF8 293 aa8.4□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa8.4□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 BTBD18B2RXH4 712 aa8.4□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa8.4□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa8.4□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 COPAP53621 1224 aa8.4□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 ABATP80404 500 aa8.4□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 HIF1AQ16665 826 aa8.4□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 MAEAQ7L5Y9 396 aa8.4□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 ARHGEF19Q8IW93 802 aa8.4□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 NIM1KQ8IY84 436 aa8.4□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 RDH13Q8NBN7 331 aa8.4□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 GRPEL2Q8TAA5 225 aa8.4□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 ENKURQ8TC29 256 aa8.4□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 CNDP1Q96KN2 507 aa8.4□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 DSCC1Q9BVC3 393 aa8.4□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 ZWILCHQ9H900 591 aa8.4□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 GTSE1Q9NYZ3 720 aa8.4□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 AK5Q9Y6K8 562 aa8.4□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa8.4□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 INSRP06213 1382 aa8.4□□□□□ -1.07
VWA3A-202ENST00000389398 E7EWF7 191 aa8.4□□□□□ -1.07
VWA3A-202ENST00000389398 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.07
VWA3A-202ENST00000389398 KRT1P04264 644 aa8.4□□□□□ -1.07
VWA3A-202ENST00000389398 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa8.4□□□□□ -1.07
VWA3A-202ENST00000389398 SRGAP2BP0DMP2 458 aa8.4□□□□□ -1.07
VWA3A-202ENST00000389398 NFKBIAP25963 317 aa8.4□□□□□ -1.07
VWA3A-202ENST00000389398 PSEN1P49768 467 aa8.4□□□□□ -1.07
VWA3A-202ENST00000389398 EPS8Q12929 822 aa8.4□□□□□ -1.07
VWA3A-202ENST00000389398 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.07
VWA3A-202ENST00000389398 KLHL17Q6TDP4 642 aa8.4□□□□□ -1.07
VWA3A-202ENST00000389398 RASGRP2Q7LDG7 609 aa8.4□□□□□ -1.07
VWA3A-202ENST00000389398 DNAAF3Q8N9W5 541 aa8.4□□□□□ -1.07
VWA3A-202ENST00000389398 CNBD1Q8NA66 436 aa8.4□□□□□ -1.07
VWA3A-202ENST00000389398 OR2W6PQ8NHA6 318 aa8.4□□□□□ -1.07
VWA3A-202ENST00000389398 MAGEC3Q8TD91 643 aa8.4□□□□□ -1.07
VWA3A-202ENST00000389398 FNIP1Q8TF40 1166 aa8.4□□□□□ -1.07
VWA3A-202ENST00000389398 UBASH3BQ8TF42 649 aa8.4□□□□□ -1.07
VWA3A-202ENST00000389398 APPBP2Q92624 585 aa8.4□□□□□ -1.07
VWA3A-202ENST00000389398 TEX13BQ9BXU2 312 aa8.4□□□□□ -1.07
VWA3A-202ENST00000389398 NEUROG2Q9H2A3 272 aa8.4□□□□□ -1.07
VWA3A-202ENST00000389398 ARHGEF3Q9NR81 526 aa8.4□□□□□ -1.07
VWA3A-202ENST00000389398 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.07
VWA3A-202ENST00000389398 GIN1Q9NXP7 522 aa8.4□□□□□ -1.07
VWA3A-202ENST00000389398 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa8.4□□□□□ -1.07
VWA3A-202ENST00000389398 APPL1Q9UKG1 709 aa8.4□□□□□ -1.07
VWA3A-202ENST00000389398 MYRFQ9Y2G1 1151 aa8.4□□□□□ -1.07
VWA3A-202ENST00000389398 NOTOA8MTQ0 251 aa8.39□□□□□ -1.07
VWA3A-202ENST00000389398 C21orf2O43822 256 aa8.39□□□□□ -1.07
VWA3A-202ENST00000389398 ZNF806P0C7X5 589 aa8.39□□□□□ -1.07
VWA3A-202ENST00000389398 VAV1P15498 845 aa8.39□□□□□ -1.07
VWA3A-202ENST00000389398 SARSP49591 514 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
VWA3A-202ENST00000389398 GALK1P51570 392 aa8.39□□□□□ -1.07
VWA3A-202ENST00000389398 CYP2J2P51589 502 aa8.39□□□□□ -1.07
VWA3A-202ENST00000389398 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
VWA3A-202ENST00000389398 GSTO1P78417 241 aa8.39□□□□□ -1.07
VWA3A-202ENST00000389398 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
VWA3A-202ENST00000389398 NCAPHQ15003 741 aa8.39□□□□□ -1.07
VWA3A-202ENST00000389398 PPP4R4Q6NUP7 873 aa8.39□□□□□ -1.07
VWA3A-202ENST00000389398 LMBR1LQ6UX01 489 aa8.39□□□□□ -1.07
VWA3A-202ENST00000389398 KSR2Q6VAB6 950 aa8.39□□□□□ -1.07
VWA3A-202ENST00000389398 ATG14Q6ZNE5 492 aa8.39□□□□□ -1.07
VWA3A-202ENST00000389398 PRUNE1Q86TP1 453 aa8.39□□□□□ -1.07
VWA3A-202ENST00000389398 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
VWA3A-202ENST00000389398 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
VWA3A-202ENST00000389398 KBTBD3Q8NAB2 608 aa8.39□□□□□ -1.07
VWA3A-202ENST00000389398 OTUD5Q96G74 571 aa8.39□□□□□ -1.07
VWA3A-202ENST00000389398 COX4I2Q96KJ9 171 aa8.39□□□□□ -1.07
VWA3A-202ENST00000389398 PNKPQ96T60 521 aa8.39□□□□□ -1.07
VWA3A-202ENST00000389398 OSBPL10Q9BXB5 764 aa8.39□□□□□ -1.07
VWA3A-202ENST00000389398 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa8.39□□□□□ -1.07
VWA3A-202ENST00000389398 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
VWA3A-202ENST00000389398 FBXO28Q9NVF7 368 aa8.39□□□□□ -1.07
VWA3A-202ENST00000389398 VPS54Q9P1Q0 977 aa8.39□□□□□ -1.07
VWA3A-202ENST00000389398 SLC13A4Q9UKG4 626 aa8.39□□□□□ -1.07
VWA3A-202ENST00000389398 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP8.39□□□□□ -1.07
VWA3A-202ENST00000389398 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa8.39□□□□□ -1.07
VWA3A-202ENST00000389398 AIM2O14862 343 aa8.39□□□□□ -1.07
VWA3A-202ENST00000389398 ZNF862O60290 1169 aa8.39□□□□□ -1.07
VWA3A-202ENST00000389398 TRIM13O60858 407 aa8.39□□□□□ -1.07
VWA3A-202ENST00000389398 GGPS1O95749 300 aa8.39□□□□□ -1.07
VWA3A-202ENST00000389398 NR1H2P55055 460 aa8.39□□□□□ -1.07
VWA3A-202ENST00000389398 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
VWA3A-202ENST00000389398 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa8.39□□□□□ -1.07
VWA3A-202ENST00000389398 ARHGAP17Q68EM7 881 aa8.39□□□□□ -1.07
VWA3A-202ENST00000389398 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
VWA3A-202ENST00000389398 AKAP14Q86UN6 197 aa8.39□□□□□ -1.07
VWA3A-202ENST00000389398 LRRC6Q86X45 466 aa8.39□□□□□ -1.07
VWA3A-202ENST00000389398 KBTBD2Q8IY47 623 aa8.39□□□□□ -1.07
VWA3A-202ENST00000389398 PPM1NQ8N819 430 aa8.39□□□□□ -1.07
VWA3A-202ENST00000389398 MIGA1Q8NAN2 632 aa8.39□□□□□ -1.07
VWA3A-202ENST00000389398 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
VWA3A-202ENST00000389398 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa8.39□□□□□ -1.07
VWA3A-202ENST00000389398 HPS1Q92902 700 aa8.39□□□□□ -1.07
VWA3A-202ENST00000389398 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms