RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380958.7

PAN3-201, Transcript of poly(A) specific ribonuclease subunit PAN3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 5 BASIC

Gene PAN3, Length 2,833 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN3-201ENST00000380958 CCT6BQ92526 530 aa21.32■■□□□ 1
PAN3-201ENST00000380958 FAM129AQ9BZQ8 928 aa21.32■■□□□ 1
PAN3-201ENST00000380958 STK32BQ9NY57 414 aa21.32■■□□□ 1
PAN3-201ENST00000380958 WDR64B1ANS9 1081 aa21.32■■□□□ 1
PAN3-201ENST00000380958 RPSAP08865 295 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
PAN3-201ENST00000380958 CLTAP09496 248 aa21.32■■□□□ 1
PAN3-201ENST00000380958 GCLMP48507 274 aa21.32■■□□□ 1
PAN3-201ENST00000380958 NSMFQ6X4W1 530 aa21.32■■□□□ 1
PAN3-201ENST00000380958 CDAN1Q8IWY9 1227 aa21.32■■□□□ 1
PAN3-201ENST00000380958 PRELID2Q8N945 189 aa21.32■■□□□ 1
PAN3-201ENST00000380958 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa21.32■■□□□ 1
PAN3-201ENST00000380958 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
PAN3-201ENST00000380958 COL4A5P29400 1685 aa21.31■■□□□ 1
PAN3-201ENST00000380958 PEX19P40855 299 aa21.31■■□□□ 1
PAN3-201ENST00000380958 DRG2P55039 364 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
PAN3-201ENST00000380958 C1orf220Q5T0J3 134 aa21.31■■□□□ 1
PAN3-201ENST00000380958 ARHGEF19Q8IW93 802 aa21.31■■□□□ 1
PAN3-201ENST00000380958 NIM1KQ8IY84 436 aa21.31■■□□□ 1
PAN3-201ENST00000380958 RASAL2Q9UJF2 1139 aa21.31■■□□□ 1
PAN3-201ENST00000380958 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
PAN3-201ENST00000380958 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
PAN3-201ENST00000380958 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa21.31■■□□□ 1
PAN3-201ENST00000380958 USP37Q86T82 979 aa21.31■■□□□ 1
PAN3-201ENST00000380958 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
PAN3-201ENST00000380958 FAM71AQ8IYT1 594 aa21.31■■□□□ 1
PAN3-201ENST00000380958 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
PAN3-201ENST00000380958 ADAM7Q9H2U9 754 aa21.31■■□□□ 1
PAN3-201ENST00000380958 GGA2Q9UJY4 613 aa21.31■■□□□ 1
PAN3-201ENST00000380958 ALAS1P13196 640 aa21.3■■□□□ 1
PAN3-201ENST00000380958 VCAM1P19320 739 aa21.3■■□□□ 1
PAN3-201ENST00000380958 COMTP21964 271 aa21.3■■□□□ 1
PAN3-201ENST00000380958 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
PAN3-201ENST00000380958 MFAP3P55082 362 aa21.3■■□□□ 1
PAN3-201ENST00000380958 SNX1Q13596 522 aa21.3■■□□□ 1
PAN3-201ENST00000380958 PGM5Q15124 567 aa21.3■■□□□ 1
PAN3-201ENST00000380958 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
PAN3-201ENST00000380958 TXLNGYQ9BZA5 131 aa21.3■■□□□ 1
PAN3-201ENST00000380958 C17orf75Q9HAS0 396 aa21.3■■□□□ 1
PAN3-201ENST00000380958 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
PAN3-201ENST00000380958 C5orf60A6NFR6 353 aa21.3■■□□□ 1
PAN3-201ENST00000380958 ACSL3O95573 720 aa21.3■■□□□ 1
PAN3-201ENST00000380958 PLCB4Q15147 1175 aa21.3■■□□□ 1
PAN3-201ENST00000380958 RUNDC3BQ96NL0 473 aa21.3■■□□□ 1
PAN3-201ENST00000380958 TMEM117Q9H0C3 514 aa21.3■■□□□ 1
PAN3-201ENST00000380958 KIF9Q9HAQ2 790 aa21.3■■□□□ 1
PAN3-201ENST00000380958 GRHL1Q9NZI5 618 aa21.3■■□□□ 1
PAN3-201ENST00000380958 TTC36A6NLP5 189 aa21.29■■□□□ 1
PAN3-201ENST00000380958 PAEPP09466 180 aa21.29■■□□□ 1
PAN3-201ENST00000380958 PYGMP11217 842 aa21.29■■□□□ 1
PAN3-201ENST00000380958 CREB1P16220 341 aa21.29■■□□□ 1
PAN3-201ENST00000380958 GCKP35557 465 aa21.29■■□□□ 1
PAN3-201ENST00000380958 DRP2Q13474 957 aa21.29■■□□□ 1
PAN3-201ENST00000380958 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
PAN3-201ENST00000380958 LONRF1Q17RB8 773 aa21.29■■□□□ 1
PAN3-201ENST00000380958 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
PAN3-201ENST00000380958 EPS8L1Q8TE68 723 aa21.29■■□□□ 1
PAN3-201ENST00000380958 PARD3BQ8TEW8 1205 aa21.29■■□□□ 1
PAN3-201ENST00000380958 DYDC1Q8WWB3 177 aa21.29■■□□□ 1
PAN3-201ENST00000380958 WNT8AQ9H1J5 351 aa21.29■■□□□ 1
PAN3-201ENST00000380958 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
PAN3-201ENST00000380958 COQ4Q9Y3A0 265 aa21.29■■□□□ 1
PAN3-201ENST00000380958 ANKRD33BA6NCL7 494 aa21.29■■□□□ 1
PAN3-201ENST00000380958 CCT8L1PA6NM43 557 aa21.29■■□□□ 1
PAN3-201ENST00000380958 CCDC169A6NNP5 214 aa21.29■■□□□ 1
PAN3-201ENST00000380958 CALCAP01258 141 aa21.29■■□□□ 1
PAN3-201ENST00000380958 CHRNA3P32297 505 aa21.29■■□□□ 1
PAN3-201ENST00000380958 GTF2H1P32780 548 aa21.29■■□□□ 1
PAN3-201ENST00000380958 TNFAIP1Q13829 316 aa21.29■■□□□ 1
PAN3-201ENST00000380958 MAP4K3Q8IVH8 894 aa21.29■■□□□ 1
PAN3-201ENST00000380958 WNT10BO00744 389 aa21.28■■□□□ 1
PAN3-201ENST00000380958 PEX3P56589 373 aa21.28■■□□□ 1
PAN3-201ENST00000380958 ADCY2Q08462 1091 aa21.28■■□□□ 1
PAN3-201ENST00000380958 KRT39Q6A163 491 aa21.28■■□□□ 1
PAN3-201ENST00000380958 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
PAN3-201ENST00000380958 ZSWIM1Q9BR11 485 aa21.28■■□□□ 1
PAN3-201ENST00000380958 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
PAN3-201ENST00000380958 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
PAN3-201ENST00000380958 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
PAN3-201ENST00000380958 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP21.28■■□□□ 1
PAN3-201ENST00000380958 PHF2O75151 1096 aa21.28■■□□□ 1
PAN3-201ENST00000380958 VPS41P49754 854 aa21.28■■□□□ 1
PAN3-201ENST00000380958 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
PAN3-201ENST00000380958 ANKS4BQ8N8V4 417 aa21.28■■□□□ 1
PAN3-201ENST00000380958 ANKRD42Q8N9B4 389 aa21.28■■□□□ 1
PAN3-201ENST00000380958 C3orf20Q8ND61 904 aa21.28■■□□□ 1
PAN3-201ENST00000380958 TMC2Q8TDI7 906 aa21.28■■□□□ 1
PAN3-201ENST00000380958 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
PAN3-201ENST00000380958 SHC3Q92529 594 aa21.28■■□□□ 1
PAN3-201ENST00000380958 SENP7Q9BQF6 1050 aa21.28■■□□□ 1
PAN3-201ENST00000380958 TMEM8AQ9HCN3 771 aa21.28■■□□□ 1
PAN3-201ENST00000380958 ABCF3Q9NUQ8 709 aa21.28■■□□□ 1
PAN3-201ENST00000380958 TBX20Q9UMR3 447 aa21.28■■□□□ 1
PAN3-201ENST00000380958 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa21.28■■□□□ 1
PAN3-201ENST00000380958 SPOPO43791 374 aa21.28■■□□□ 1
PAN3-201ENST00000380958 ABCD1P33897 745 aa21.28■■□□□ 1
PAN3-201ENST00000380958 RPS6P62753 249 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
PAN3-201ENST00000380958 GRIK3Q13003 919 aa21.28■■□□□ 1
PAN3-201ENST00000380958 SPP2Q13103 211 aa21.28■■□□□ 1
PAN3-201ENST00000380958 CRYMQ14894 314 aa21.28■■□□□ 1
PAN3-201ENST00000380958 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.8 ms