RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373433.8

RPRD1B-201, Transcript of regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RPRD1B, Length 3,874 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1B-201ENST00000373433 CYP2C8P10632 490 aa11.94□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 ALADP13716 330 aa11.94□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 ABCB4P21439 1286 aa11.94□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 GBP1P32455 592 aa11.94□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP11.94□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 LLGL1Q15334 1064 aa11.94□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 H2AFVQ71UI9 128 aa11.94□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 TAOK1Q7L7X3 1001 aa11.94□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa11.94□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 LXNQ9BS40 222 aa11.94□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 KCNMB3Q9NPA1 279 aa11.94□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 NAGPAQ9UK23 515 aa11.94□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 NOD1Q9Y239 953 aa11.94□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 URB1O60287 2271 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 ARAP2Q8WZ64 1704 aa11.94□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 SLC25A27O95847 323 aa11.94□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 ARP10275 920 aa11.94□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 RPS6KA3P51812 740 aa11.94□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 KRT76Q01546 638 aa11.94□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 C6orf118Q5T5N4 469 aa11.94□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 KSR1Q8IVT5 923 aa11.94□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 LRRC57Q8N9N7 239 aa11.94□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 TEKT4Q8WW24 435 aa11.94□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 PGM2Q96G03 612 aa11.94□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 TRIM7Q9C029 511 aa11.94□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 SPDYE5A6NIY4 337 aa11.94□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 PSAPP07602 524 aa11.94□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 ATP8B4Q8TF62 1192 aa11.94□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 AHCYL1O43865 530 aa11.93□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 AGTP01019 485 aa11.93□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 PGK2P07205 417 aa11.93□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 GRB10Q13322 594 aa11.93□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 MTERF2Q49AM1 385 aa11.93□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 SPATA21Q7Z572 469 aa11.93□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 VPS36Q86VN1 386 aa11.93□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 ERP44Q9BS26 406 aa11.93□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa11.93□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 P4HBP07237 508 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 FESP07332 822 aa11.93□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 SLC9A1P19634 815 aa11.93□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 MARK3P27448 753 aa11.93□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 QARSP47897 775 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 POLE2P56282 527 aa11.93□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 SESN3P58005 492 aa11.93□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 PPIL2Q13356 520 aa11.93□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 CNGA2Q16280 664 aa11.93□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 TREML2Q5T2D2 321 aa11.93□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 SWSAP1Q6NVH7 229 aa11.93□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 FITM2Q8N6M3 262 aa11.93□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 PDCD2LQ9BRP1 358 aa11.93□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa11.93□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa11.93□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa11.93□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa11.93□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 K7ENM7 598 aa11.93□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 PDHXO00330 501 aa11.93□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 POTEJP0CG39 1038 aa11.93□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 FERP16591 822 aa11.93□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 JAK3P52333 1124 aa11.93□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 BNIP1Q12981 228 aa11.93□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 VSIG1Q86XK7 387 aa11.93□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 SYCE1Q8N0S2 351 aa11.93□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 SYNCQ9H7C4 482 aa11.93□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 PIDD1Q9HB75 910 aa11.93□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 OSGEPQ9NPF4 335 aa11.93□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 KLHL14Q9P2G3 628 aa11.93□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 GABBR1Q9UBS5 961 aa11.93□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 KCNH2Q12809 1159 aa11.92□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 KIF22Q14807 665 aa11.92□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 TMEM132BQ14DG7 1078 aa11.92□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 LONRF1Q17RB8 773 aa11.92□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 MOXD1Q6UVY6 613 aa11.92□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 CYFIP1Q7L576 1253 aa11.92□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 LONP2Q86WA8 852 aa11.92□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 SLC7A3Q8WY07 619 aa11.92□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 BEGAINQ9BUH8 593 aa11.92□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 EPB41L4BQ9H329 900 aa11.92□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 NRBP2Q9NSY0 501 aa11.92□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 AIPL1Q9NZN9 384 aa11.92□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 RASAL2Q9UJF2 1139 aa11.92□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa11.92□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 PFASO15067 1338 aa11.92□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 TMEM120BA0PK00 339 aa11.92□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 ANKRD33BA6NCL7 494 aa11.92□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 FOXO6A8MYZ6 492 aa11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.7 ms