RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362827.1

RNU6-446P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 446, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-446P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-446P-201ENST00000362827 VSIG10L2P0DP72 767 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-446P-201ENST00000362827 PLS3P13797 630 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-446P-201ENST00000362827 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-446P-201ENST00000362827 UBTFP17480 764 aaKnown RBP-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-446P-201ENST00000362827 ART1P52961 327 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-446P-201ENST00000362827 ADPRHP54922 357 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-446P-201ENST00000362827 MAN2A1Q16706 1144 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-446P-201ENST00000362827 DGKDQ16760 1214 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-446P-201ENST00000362827 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-446P-201ENST00000362827 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-446P-201ENST00000362827 KIAA0825Q8IV33 1275 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-446P-201ENST00000362827 ZZZ3Q8IYH5 903 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-446P-201ENST00000362827 AMER3Q8N944 861 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-446P-201ENST00000362827 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-446P-201ENST00000362827 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-446P-201ENST00000362827 ZNF599Q96NL3 588 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-446P-201ENST00000362827 TM6SF1Q9BZW5 370 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-446P-201ENST00000362827 GALNT9Q9HCQ5 603 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-446P-201ENST00000362827 POGKQ9P215 609 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-446P-201ENST00000362827 IGSF9Q9P2J2 1179 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-446P-201ENST00000362827 CLCA2Q9UQC9 943 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-446P-201ENST00000362827 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-446P-201ENST00000362827 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-446P-201ENST00000362827 DOCK7Q96N67 2140 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-446P-201ENST00000362827 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-446P-201ENST00000362827 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-446P-201ENST00000362827 FZD9O00144 591 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-446P-201ENST00000362827 SHOXO15266 292 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-446P-201ENST00000362827 EDIL3O43854 480 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-446P-201ENST00000362827 JTBO76095 146 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-446P-201ENST00000362827 RBP3P10745 1247 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-446P-201ENST00000362827 ITGA4P13612 1032 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-446P-201ENST00000362827 CEBPBP17676 345 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-446P-201ENST00000362827 MLH1P40692 756 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-446P-201ENST00000362827 CCNFP41002 786 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-446P-201ENST00000362827 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-446P-201ENST00000362827 TUSC3Q13454 348 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-446P-201ENST00000362827 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-446P-201ENST00000362827 INF2Q27J81 1249 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-446P-201ENST00000362827 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-446P-201ENST00000362827 CYP4F22Q6NT55 531 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-446P-201ENST00000362827 SV2BQ7L1I2 683 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-446P-201ENST00000362827 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-446P-201ENST00000362827 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-446P-201ENST00000362827 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-446P-201ENST00000362827 LNX2Q8N448 690 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-446P-201ENST00000362827 RUNDC1Q96C34 613 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-446P-201ENST00000362827 WNK4Q96J92 1243 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-446P-201ENST00000362827 FAM129BQ96TA1 746 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-446P-201ENST00000362827 CDT1Q9H211 546 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-446P-201ENST00000362827 THSD1Q9NS62 852 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-446P-201ENST00000362827 GALNT8Q9NY28 637 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-446P-201ENST00000362827 WNT16Q9UBV4 365 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-446P-201ENST00000362827 CACNA1FO60840 1977 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-446P-201ENST00000362827 FCHO1O14526 889 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-446P-201ENST00000362827 DSCR3O14972 297 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-446P-201ENST00000362827 ADAMTS3O15072 1205 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-446P-201ENST00000362827 SYF2O95926 243 aaKnown RBP-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-446P-201ENST00000362827 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-446P-201ENST00000362827 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-446P-201ENST00000362827 SOX8P57073 446 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-446P-201ENST00000362827 AMPD2Q01433 879 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-446P-201ENST00000362827 GHRHRQ02643 423 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-446P-201ENST00000362827 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-446P-201ENST00000362827 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-446P-201ENST00000362827 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-446P-201ENST00000362827 CEP85Q6P2H3 762 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-446P-201ENST00000362827 PIP4P1Q86T03 277 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-446P-201ENST00000362827 RSPH3Q86UC2 560 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-446P-201ENST00000362827 LRP11Q86VZ4 500 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-446P-201ENST00000362827 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-446P-201ENST00000362827 Q8N1Y9 231 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-446P-201ENST00000362827 CAMKK1Q8N5S9 505 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-446P-201ENST00000362827 C8orf58Q8NAV2 365 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-446P-201ENST00000362827 NLRP4Q96MN2 994 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-446P-201ENST00000362827 ASB2Q96Q27 587 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-446P-201ENST00000362827 SETDB2Q96T68 719 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-446P-201ENST00000362827 EPB41L1Q9H4G0 881 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-446P-201ENST00000362827 SLC24A3Q9HC58 644 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-446P-201ENST00000362827 PAK5Q9P286 719 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-446P-201ENST00000362827 NUB1Q9Y5A7 615 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-446P-201ENST00000362827 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa-0.41□□□□□ -2.47
RNU6-446P-201ENST00000362827 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-446P-201ENST00000362827 BMPR1BO00238 502 aa-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-446P-201ENST00000362827 LMX1BO60663 402 aa-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-446P-201ENST00000362827 TTLL1O95922 423 aa-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-446P-201ENST00000362827 IGKV3-11P04433 115 aa-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-446P-201ENST00000362827 CD48P09326 243 aa-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-446P-201ENST00000362827 CD247P20963 164 aa-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-446P-201ENST00000362827 ZNF91Q05481 1191 aa-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-446P-201ENST00000362827 TEFQ10587 303 aa-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-446P-201ENST00000362827 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-446P-201ENST00000362827 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-446P-201ENST00000362827 KIAA0895LQ68EN5 471 aa-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-446P-201ENST00000362827 WBP2NLQ6ICG8 309 aa-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-446P-201ENST00000362827 FBXL19Q6PCT2 694 aa-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-446P-201ENST00000362827 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-446P-201ENST00000362827 NLRP10Q86W26 655 aa-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-446P-201ENST00000362827 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-446P-201ENST00000362827 PLA2G15Q8NCC3 412 aa-0.41□□□□□ -2.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.9 ms