RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000340006.6

CSRP1-201, Transcript of cysteine and glycine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CSRP1, Length 1,952 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP1-201ENST00000340006 C1orf112Q9NSG2 853 aa16.02■□□□□ 0.15
CSRP1-201ENST00000340006 TAB2Q9NYJ8 693 aa16.02■□□□□ 0.15
CSRP1-201ENST00000340006 LRFN2Q9ULH4 789 aa16.02■□□□□ 0.15
CSRP1-201ENST00000340006 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa16.02■□□□□ 0.15
CSRP1-201ENST00000340006 LACTBL1A8MY62 500 aa16.01■□□□□ 0.15
CSRP1-201ENST00000340006 ZNF623O75123 536 aa16.01■□□□□ 0.15
CSRP1-201ENST00000340006 ZNF75DP51815 510 aa16.01■□□□□ 0.15
CSRP1-201ENST00000340006 UBASH3AP57075 661 aa16.01■□□□□ 0.15
CSRP1-201ENST00000340006 PPP2R3AQ06190 1150 aa16.01■□□□□ 0.15
CSRP1-201ENST00000340006 ECHDC2Q86YB7 292 aa16.01■□□□□ 0.15
CSRP1-201ENST00000340006 PARD3BQ8TEW8 1205 aa16.01■□□□□ 0.15
CSRP1-201ENST00000340006 LPPQ93052 612 aa16.01■□□□□ 0.15
CSRP1-201ENST00000340006 BORCS6Q96GS4 357 aa16.01■□□□□ 0.15
CSRP1-201ENST00000340006 IL23AQ9NPF7 189 aa16.01■□□□□ 0.15
CSRP1-201ENST00000340006 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
CSRP1-201ENST00000340006 RECQL4O94761 1208 aa16■□□□□ 0.15
CSRP1-201ENST00000340006 EOMESO95936 686 aa16■□□□□ 0.15
CSRP1-201ENST00000340006 FGBP02675 491 aa16■□□□□ 0.15
CSRP1-201ENST00000340006 PFKMP08237 780 aa16■□□□□ 0.15
CSRP1-201ENST00000340006 ACTN1P12814 892 aa16■□□□□ 0.15
CSRP1-201ENST00000340006 MARSP56192 900 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
CSRP1-201ENST00000340006 DLG4P78352 724 aa16■□□□□ 0.15
CSRP1-201ENST00000340006 SURF1Q15526 300 aa16■□□□□ 0.15
CSRP1-201ENST00000340006 TCTN1Q2MV58 587 aa16■□□□□ 0.15
CSRP1-201ENST00000340006 SLC10A6Q3KNW5 377 aa16■□□□□ 0.15
CSRP1-201ENST00000340006 OTOP2Q7RTS6 562 aa16■□□□□ 0.15
CSRP1-201ENST00000340006 LRRC10BA6NIK2 292 aa16■□□□□ 0.15
CSRP1-201ENST00000340006 C9IYK1 514 aa16■□□□□ 0.15
CSRP1-201ENST00000340006 IL18RAPO95256 599 aa16■□□□□ 0.15
CSRP1-201ENST00000340006 TRIM49P0CI25 452 aa16■□□□□ 0.15
CSRP1-201ENST00000340006 TRIM49CP0CI26 452 aa16■□□□□ 0.15
CSRP1-201ENST00000340006 KCNH2Q12809 1159 aa16■□□□□ 0.15
CSRP1-201ENST00000340006 PSMD6Q15008 389 aa16■□□□□ 0.15
CSRP1-201ENST00000340006 MAN2A1Q16706 1144 aa16■□□□□ 0.15
CSRP1-201ENST00000340006 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
CSRP1-201ENST00000340006 BRSK2Q8IWQ3 736 aa16■□□□□ 0.15
CSRP1-201ENST00000340006 TRIM59Q8IWR1 403 aa16■□□□□ 0.15
CSRP1-201ENST00000340006 TMC2Q8TDI7 906 aa16■□□□□ 0.15
CSRP1-201ENST00000340006 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa16■□□□□ 0.15
CSRP1-201ENST00000340006 UBN1Q9NPG3 1134 aa16■□□□□ 0.15
CSRP1-201ENST00000340006 RNF19AQ9NV58 838 aa16■□□□□ 0.15
CSRP1-201ENST00000340006 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa15.99■□□□□ 0.15
CSRP1-201ENST00000340006 UPP2O95045 317 aa15.99■□□□□ 0.15
CSRP1-201ENST00000340006 COPB1P53618 953 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
CSRP1-201ENST00000340006 FAM189BP81408 668 aa15.99■□□□□ 0.15
CSRP1-201ENST00000340006 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
CSRP1-201ENST00000340006 VWA3BQ502W6 1294 aa15.99■□□□□ 0.15
CSRP1-201ENST00000340006 CD302Q8IX05 232 aa15.99■□□□□ 0.15
CSRP1-201ENST00000340006 LINC01599Q8WXQ3 324 aa15.99■□□□□ 0.15
CSRP1-201ENST00000340006 NDST4Q9H3R1 872 aa15.99■□□□□ 0.15
CSRP1-201ENST00000340006 ASB7Q9H672 318 aa15.99■□□□□ 0.15
CSRP1-201ENST00000340006 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
CSRP1-201ENST00000340006 IFNKQ9P0W0 207 aa15.99■□□□□ 0.15
CSRP1-201ENST00000340006 TTC26A0AVF1 554 aa15.98■□□□□ 0.15
CSRP1-201ENST00000340006 MEIS3P2A8K0S8 358 aa15.98■□□□□ 0.15
CSRP1-201ENST00000340006 STX10O60499 249 aa15.98■□□□□ 0.15
CSRP1-201ENST00000340006 AFPP02771 609 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
CSRP1-201ENST00000340006 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
CSRP1-201ENST00000340006 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
CSRP1-201ENST00000340006 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP15.98■□□□□ 0.151e-7■■□□□ 13.2
CSRP1-201ENST00000340006 ZNF365Q70YC5 407 aa15.98■□□□□ 0.15
CSRP1-201ENST00000340006 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
CSRP1-201ENST00000340006 SLC35C1Q96A29 364 aa15.98■□□□□ 0.15
CSRP1-201ENST00000340006 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa15.98■□□□□ 0.15
CSRP1-201ENST00000340006 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
CSRP1-201ENST00000340006 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
CSRP1-201ENST00000340006 GIT1Q9Y2X7 761 aa15.98■□□□□ 0.15
CSRP1-201ENST00000340006 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
CSRP1-201ENST00000340006 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
CSRP1-201ENST00000340006 ZBBXA8MT70 800 aa15.98■□□□□ 0.15
CSRP1-201ENST00000340006 GCLMP48507 274 aa15.98■□□□□ 0.15
CSRP1-201ENST00000340006 UBXN1Q04323 297 aa15.98■□□□□ 0.15
CSRP1-201ENST00000340006 DUOXA2Q1HG44 320 aa15.98■□□□□ 0.15
CSRP1-201ENST00000340006 JADE1Q6IE81 842 aa15.98■□□□□ 0.15
CSRP1-201ENST00000340006 AGMOQ6ZNB7 445 aa15.98■□□□□ 0.15
CSRP1-201ENST00000340006 PLEKHO2Q8TD55 490 aa15.98■□□□□ 0.15
CSRP1-201ENST00000340006 VWCEQ96DN2 955 aa15.98■□□□□ 0.15
CSRP1-201ENST00000340006 KIF12Q96FN5 646 aa15.98■□□□□ 0.15
CSRP1-201ENST00000340006 RPS6KC1Q96S38 1066 aa15.98■□□□□ 0.15
CSRP1-201ENST00000340006 GAD1Q99259 594 aa15.98■□□□□ 0.15
CSRP1-201ENST00000340006 RSAD1Q9HA92 442 aa15.98■□□□□ 0.15
CSRP1-201ENST00000340006 TMEM161AQ9NX61 479 aa15.98■□□□□ 0.15
CSRP1-201ENST00000340006 ARL5CA6NH57 179 aa15.97■□□□□ 0.15
CSRP1-201ENST00000340006 CBFA2T2O43439 604 aa15.97■□□□□ 0.15
CSRP1-201ENST00000340006 EFCAB14O75071 495 aa15.97■□□□□ 0.15
CSRP1-201ENST00000340006 PHACTR2O75167 634 aa15.97■□□□□ 0.15
CSRP1-201ENST00000340006 TPM3P06753 285 aa15.97■□□□□ 0.15
CSRP1-201ENST00000340006 KCNJ6P48051 423 aa15.97■□□□□ 0.15
CSRP1-201ENST00000340006 WNT7BP56706 349 aa15.97■□□□□ 0.15
CSRP1-201ENST00000340006 CETN1Q12798 172 aa15.97■□□□□ 0.15
CSRP1-201ENST00000340006 FKBP15Q5T1M5 1219 aa15.97■□□□□ 0.15
CSRP1-201ENST00000340006 ALKAL1Q6UXT8 129 aa15.97■□□□□ 0.15
CSRP1-201ENST00000340006 C16orf59Q7L2K0 433 aa15.97■□□□□ 0.15
CSRP1-201ENST00000340006 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
CSRP1-201ENST00000340006 ABI1Q8IZP0 508 aa15.97■□□□□ 0.15
CSRP1-201ENST00000340006 ZFP42Q96MM3 310 aa15.97■□□□□ 0.15
CSRP1-201ENST00000340006 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa15.97■□□□□ 0.15
CSRP1-201ENST00000340006 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
CSRP1-201ENST00000340006 ANK1P16157 1881 aa15.97■□□□□ 0.15
CSRP1-201ENST00000340006 MICAL3Q7RTP6 2002 aa15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms