RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332859.10

SUMO3-201, Transcript of small ubiquitin-like modifier 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SUMO3, Length 1,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3-201ENST00000332859 OGTO15294 1046 aa21.73■■□□□ 1.07
SUMO3-201ENST00000332859 GNRH1P01148 92 aa21.73■■□□□ 1.07
SUMO3-201ENST00000332859 CYP2C9P11712 490 aa21.73■■□□□ 1.07
SUMO3-201ENST00000332859 JAM2P57087 298 aa21.73■■□□□ 1.07
SUMO3-201ENST00000332859 NKX3-2P78367 333 aa21.73■■□□□ 1.07
SUMO3-201ENST00000332859 CLDN10P78369 228 aa21.73■■□□□ 1.07
SUMO3-201ENST00000332859 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
SUMO3-201ENST00000332859 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
SUMO3-201ENST00000332859 GNASQ5JWF2 1037 aa21.73■■□□□ 1.07
SUMO3-201ENST00000332859 MSANTD4Q8NCY6 345 aa21.73■■□□□ 1.07
SUMO3-201ENST00000332859 KAT6AQ92794 2004 aa21.73■■□□□ 1.07
SUMO3-201ENST00000332859 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa21.73■■□□□ 1.07
SUMO3-201ENST00000332859 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
SUMO3-201ENST00000332859 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
SUMO3-201ENST00000332859 PARD6BQ9BYG5 372 aa21.73■■□□□ 1.07
SUMO3-201ENST00000332859 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa21.73■■□□□ 1.07
SUMO3-201ENST00000332859 DNAJC12Q9UKB3 198 aa21.73■■□□□ 1.07
SUMO3-201ENST00000332859 THSD7BQ9C0I4 1608 aa21.73■■□□□ 1.07
SUMO3-201ENST00000332859 MYADML2A6NDP7 307 aa21.73■■□□□ 1.07
SUMO3-201ENST00000332859 GPR25O00155 361 aa21.73■■□□□ 1.07
SUMO3-201ENST00000332859 B4GALT5O43286 388 aa21.73■■□□□ 1.07
SUMO3-201ENST00000332859 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP21.73■■□□□ 1.076e-6■■■■□ 21
SUMO3-201ENST00000332859 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
SUMO3-201ENST00000332859 TUBBP07437 444 aa21.73■■□□□ 1.07
SUMO3-201ENST00000332859 GNAT1P11488 350 aa21.73■■□□□ 1.07
SUMO3-201ENST00000332859 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
SUMO3-201ENST00000332859 BRD3Q15059 726 aa21.73■■□□□ 1.07
SUMO3-201ENST00000332859 ZNF568Q3ZCX4 644 aa21.73■■□□□ 1.07
SUMO3-201ENST00000332859 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa21.73■■□□□ 1.07
SUMO3-201ENST00000332859 GJB7Q6PEY0 223 aa21.73■■□□□ 1.07
SUMO3-201ENST00000332859 FMNL3Q8IVF7 1028 aa21.73■■□□□ 1.07
SUMO3-201ENST00000332859 STK33Q9BYT3 514 aa21.73■■□□□ 1.07
SUMO3-201ENST00000332859 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
SUMO3-201ENST00000332859 PTPRHQ9HD43 1115 aa21.73■■□□□ 1.07
SUMO3-201ENST00000332859 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
SUMO3-201ENST00000332859 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
SUMO3-201ENST00000332859 COQ4Q9Y3A0 265 aa21.73■■□□□ 1.07
SUMO3-201ENST00000332859 JRKLQ9Y4A0 524 aa21.73■■□□□ 1.07
SUMO3-201ENST00000332859 MACROD2A1Z1Q3 448 aa21.72■■□□□ 1.07
SUMO3-201ENST00000332859 C17orf102A2RUQ5 167 aa21.72■■□□□ 1.07
SUMO3-201ENST00000332859 SPDYE4A6NLX3 237 aa21.72■■□□□ 1.07
SUMO3-201ENST00000332859 IQCF3P0C7M6 154 aa21.72■■□□□ 1.07
SUMO3-201ENST00000332859 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
SUMO3-201ENST00000332859 ELNP15502 786 aa21.72■■□□□ 1.07
SUMO3-201ENST00000332859 ADAM17P78536 824 aa21.72■■□□□ 1.07
SUMO3-201ENST00000332859 CBX1P83916 185 aa21.72■■□□□ 1.07
SUMO3-201ENST00000332859 BRSK2Q8IWQ3 736 aa21.72■■□□□ 1.07
SUMO3-201ENST00000332859 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
SUMO3-201ENST00000332859 C7orf31Q8N865 590 aa21.72■■□□□ 1.07
SUMO3-201ENST00000332859 VTI1AQ96AJ9 217 aa21.72■■□□□ 1.07
SUMO3-201ENST00000332859 ALS2CR12Q96Q35 445 aa21.72■■□□□ 1.07
SUMO3-201ENST00000332859 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
SUMO3-201ENST00000332859 FAM189A1O60320 539 aa21.71■■□□□ 1.07
SUMO3-201ENST00000332859 HMGCRP04035 888 aa21.71■■□□□ 1.07
SUMO3-201ENST00000332859 STAT1P42224 750 aa21.71■■□□□ 1.07
SUMO3-201ENST00000332859 KLHL30Q0D2K2 578 aa21.71■■□□□ 1.07
SUMO3-201ENST00000332859 AMHR2Q16671 573 aa21.71■■□□□ 1.07
SUMO3-201ENST00000332859 SV2AQ7L0J3 742 aa21.71■■□□□ 1.07
SUMO3-201ENST00000332859 KRT222Q8N1A0 295 aa21.71■■□□□ 1.07
SUMO3-201ENST00000332859 FBXL13Q8NEE6 735 aa21.71■■□□□ 1.07
SUMO3-201ENST00000332859 CGRRF1Q99675 332 aa21.71■■□□□ 1.07
SUMO3-201ENST00000332859 PDE11AQ9HCR9 933 aa21.71■■□□□ 1.07
SUMO3-201ENST00000332859 DUSP10Q9Y6W6 482 aa21.71■■□□□ 1.07
SUMO3-201ENST00000332859 CCDC151A5D8V7 595 aa21.71■■□□□ 1.07
SUMO3-201ENST00000332859 ENC1O14682 589 aa21.71■■□□□ 1.07
SUMO3-201ENST00000332859 PGK1P00558 417 aa21.71■■□□□ 1.07
SUMO3-201ENST00000332859 TNNI1P19237 187 aa21.71■■□□□ 1.07
SUMO3-201ENST00000332859 ANXA13P27216 316 aa21.71■■□□□ 1.07
SUMO3-201ENST00000332859 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
SUMO3-201ENST00000332859 GPIHBP1Q8IV16 184 aa21.71■■□□□ 1.07
SUMO3-201ENST00000332859 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa21.71■■□□□ 1.07
SUMO3-201ENST00000332859 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
SUMO3-201ENST00000332859 ADAMTS10Q9H324 1103 aa21.71■■□□□ 1.07
SUMO3-201ENST00000332859 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa21.71■■□□□ 1.07
SUMO3-201ENST00000332859 HDAC6Q9UBN7 1215 aa21.71■■□□□ 1.07
SUMO3-201ENST00000332859 RAB21Q9UL25 225 aa21.71■■□□□ 1.07
SUMO3-201ENST00000332859 ERLIN2O94905 339 aa21.7■■□□□ 1.06
SUMO3-201ENST00000332859 PRLRP16471 622 aa21.7■■□□□ 1.06
SUMO3-201ENST00000332859 FERP16591 822 aa21.7■■□□□ 1.06
SUMO3-201ENST00000332859 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
SUMO3-201ENST00000332859 HOXC8P31273 242 aa21.7■■□□□ 1.06
SUMO3-201ENST00000332859 ARID5AQ03989 594 aa21.7■■□□□ 1.06
SUMO3-201ENST00000332859 ARHGEF6Q15052 776 aa21.7■■□□□ 1.06
SUMO3-201ENST00000332859 SURF1Q15526 300 aa21.7■■□□□ 1.06
SUMO3-201ENST00000332859 SLC18A3Q16572 532 aa21.7■■□□□ 1.06
SUMO3-201ENST00000332859 EEF1DP3Q658K8 133 aa21.7■■□□□ 1.06
SUMO3-201ENST00000332859 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa21.7■■□□□ 1.06
SUMO3-201ENST00000332859 RUFY4Q6ZNE9 571 aa21.7■■□□□ 1.06
SUMO3-201ENST00000332859 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa21.7■■□□□ 1.06
SUMO3-201ENST00000332859 RAET1EQ8TD07 263 aa21.7■■□□□ 1.06
SUMO3-201ENST00000332859 EPC1Q9H2F5 836 aa21.7■■□□□ 1.06
SUMO3-201ENST00000332859 RAB20Q9NX57 234 aa21.7■■□□□ 1.06
SUMO3-201ENST00000332859 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
SUMO3-201ENST00000332859 MYH10P35580 1976 aa21.69■■□□□ 1.06
SUMO3-201ENST00000332859 F8VZ95 297 aa21.69■■□□□ 1.06
SUMO3-201ENST00000332859 WNT7BP56706 349 aa21.69■■□□□ 1.06
SUMO3-201ENST00000332859 HIC1Q14526 733 aa21.69■■□□□ 1.06
SUMO3-201ENST00000332859 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
SUMO3-201ENST00000332859 KIZQ2M2Z5 673 aa21.69■■□□□ 1.06
SUMO3-201ENST00000332859 SEZ6Q53EL9 994 aa21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.5 ms