RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318978.5

CTXN1-201, Transcript of cortexin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTXN1, Length 1,274 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN1-201ENST00000318978 FAM13BQ9NYF5 915 aa27.85■■■□□ 2.05
CTXN1-201ENST00000318978 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa27.85■■■□□ 2.05
CTXN1-201ENST00000318978 IRAK3Q9Y616 596 aa27.85■■■□□ 2.05
CTXN1-201ENST00000318978 MBTPS2O43462 519 aa27.84■■■□□ 2.05
CTXN1-201ENST00000318978 GAP43P17677 238 aa27.84■■■□□ 2.05
CTXN1-201ENST00000318978 MCL1Q07820 350 aa27.84■■■□□ 2.05
CTXN1-201ENST00000318978 SEZ6Q53EL9 994 aa27.84■■■□□ 2.05
CTXN1-201ENST00000318978 FUT10Q6P4F1 479 aa27.84■■■□□ 2.05
CTXN1-201ENST00000318978 CASP10Q92851 521 aa27.84■■■□□ 2.05
CTXN1-201ENST00000318978 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP27.84■■■□□ 2.05
CTXN1-201ENST00000318978 TBC1D7Q9P0N9 293 aa27.84■■■□□ 2.05
CTXN1-201ENST00000318978 PCDHA7Q9UN72 937 aa27.84■■■□□ 2.05
CTXN1-201ENST00000318978 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa27.83■■■□□ 2.05
CTXN1-201ENST00000318978 KLRC2P26717 231 aa27.83■■■□□ 2.05
CTXN1-201ENST00000318978 GLUD2P49448 558 aa27.83■■■□□ 2.05
CTXN1-201ENST00000318978 COASYQ13057 564 aa27.83■■■□□ 2.05
CTXN1-201ENST00000318978 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP27.83■■■□□ 2.05
CTXN1-201ENST00000318978 IQUBQ8NA54 791 aa27.83■■■□□ 2.05
CTXN1-201ENST00000318978 STAMQ92783 540 aa27.83■■■□□ 2.05
CTXN1-201ENST00000318978 DNAJC19Q96DA6 116 aa27.83■■■□□ 2.05
CTXN1-201ENST00000318978 FIZ1Q96SL8 496 aa27.83■■■□□ 2.05
CTXN1-201ENST00000318978 LRRC27Q9C0I9 530 aa27.83■■■□□ 2.05
CTXN1-201ENST00000318978 SEL1LQ9UBV2 794 aa27.83■■■□□ 2.05
CTXN1-201ENST00000318978 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa27.83■■■□□ 2.05
CTXN1-201ENST00000318978 GTF2BQ00403 316 aa27.82■■■□□ 2.04
CTXN1-201ENST00000318978 NAB2Q15742 525 aa27.82■■■□□ 2.04
CTXN1-201ENST00000318978 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP27.82■■■□□ 2.04
CTXN1-201ENST00000318978 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP27.82■■■□□ 2.04
CTXN1-201ENST00000318978 ANKRD54Q6NXT1 300 aa27.82■■■□□ 2.04
CTXN1-201ENST00000318978 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa27.82■■■□□ 2.04
CTXN1-201ENST00000318978 SMRP1Q8NCR6 262 aa27.82■■■□□ 2.04
CTXN1-201ENST00000318978 KCNN1Q92952 543 aa27.82■■■□□ 2.04
CTXN1-201ENST00000318978 SNX27Q96L92 541 aa27.82■■■□□ 2.04
CTXN1-201ENST00000318978 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
CTXN1-201ENST00000318978 APOL5Q9BWW9 433 aa27.82■■■□□ 2.04
CTXN1-201ENST00000318978 GPR62Q9BZJ7 368 aa27.82■■■□□ 2.04
CTXN1-201ENST00000318978 PANK4Q9NVE7 773 aa27.82■■■□□ 2.04
CTXN1-201ENST00000318978 ZDHHC9Q9Y397 364 aa27.82■■■□□ 2.04
CTXN1-201ENST00000318978 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa27.82■■■□□ 2.04
CTXN1-201ENST00000318978 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP27.82■■■□□ 2.04
CTXN1-201ENST00000318978 KIF4AO95239 1232 aa27.81■■■□□ 2.04
CTXN1-201ENST00000318978 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP27.81■■■□□ 2.04
CTXN1-201ENST00000318978 KRT85P78386 507 aa27.81■■■□□ 2.04
CTXN1-201ENST00000318978 KCNC3Q14003 757 aa27.81■■■□□ 2.04
CTXN1-201ENST00000318978 USP41Q3LFD5 358 aa27.81■■■□□ 2.04
CTXN1-201ENST00000318978 ALKAL1Q6UXT8 129 aa27.81■■■□□ 2.04
CTXN1-201ENST00000318978 ZNF720Q7Z2F6 126 aa27.81■■■□□ 2.04
CTXN1-201ENST00000318978 PPFIBP1Q86W92 1011 aa27.81■■■□□ 2.04
CTXN1-201ENST00000318978 B3GALT6Q96L58 329 aa27.81■■■□□ 2.04
CTXN1-201ENST00000318978 KLHL5Q96PQ7 755 aa27.81■■■□□ 2.04
CTXN1-201ENST00000318978 TNMDQ9H2S6 317 aa27.81■■■□□ 2.04
CTXN1-201ENST00000318978 CUEDC2Q9H467 287 aa27.81■■■□□ 2.04
CTXN1-201ENST00000318978 SLC38A7Q9NVC3 462 aa27.81■■■□□ 2.04
CTXN1-201ENST00000318978 RCOR1Q9UKL0 485 aa27.81■■■□□ 2.04
CTXN1-201ENST00000318978 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP27.81■■■□□ 2.04
CTXN1-201ENST00000318978 TCHHQ07283 1943 aa27.8■■■□□ 2.04
CTXN1-201ENST00000318978 SPDYE4A6NLX3 237 aa27.8■■■□□ 2.04
CTXN1-201ENST00000318978 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP27.8■■■□□ 2.04
CTXN1-201ENST00000318978 PIGRP01833 764 aa27.8■■■□□ 2.04
CTXN1-201ENST00000318978 CNPP09543 421 aaKnown RBP27.8■■■□□ 2.04
CTXN1-201ENST00000318978 AMPD3Q01432 767 aa27.8■■■□□ 2.04
CTXN1-201ENST00000318978 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP27.8■■■□□ 2.04
CTXN1-201ENST00000318978 MAP4K3Q8IVH8 894 aa27.8■■■□□ 2.04
CTXN1-201ENST00000318978 CCDC65Q8IXS2 484 aa27.8■■■□□ 2.04
CTXN1-201ENST00000318978 SPATA32Q96LK8 384 aa27.8■■■□□ 2.04
CTXN1-201ENST00000318978 UROC1Q96N76 676 aa27.8■■■□□ 2.04
CTXN1-201ENST00000318978 HAPLN2Q9GZV7 340 aa27.8■■■□□ 2.04
CTXN1-201ENST00000318978 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa27.8■■■□□ 2.04
CTXN1-201ENST00000318978 CUL9Q8IWT3 2517 aa27.8■■■□□ 2.04
CTXN1-201ENST00000318978 B3GAT3O94766 335 aa27.79■■■□□ 2.04
CTXN1-201ENST00000318978 GCNT3O95395 438 aa27.79■■■□□ 2.04
CTXN1-201ENST00000318978 CLTAP09496 248 aa27.79■■■□□ 2.04
CTXN1-201ENST00000318978 CLCNKBP51801 687 aa27.79■■■□□ 2.04
CTXN1-201ENST00000318978 DSG1Q02413 1049 aa27.79■■■□□ 2.04
CTXN1-201ENST00000318978 E2F4Q16254 413 aa27.79■■■□□ 2.04
CTXN1-201ENST00000318978 KYAT1Q16773 422 aa27.79■■■□□ 2.04
CTXN1-201ENST00000318978 TPRNQ4KMQ1 711 aa27.79■■■□□ 2.04
CTXN1-201ENST00000318978 XKR4Q5GH76 650 aa27.79■■■□□ 2.04
CTXN1-201ENST00000318978 CEP57Q86XR8 500 aa27.79■■■□□ 2.04
CTXN1-201ENST00000318978 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP27.79■■■□□ 2.04
CTXN1-201ENST00000318978 MSTO1Q9BUK6 570 aa27.79■■■□□ 2.04
CTXN1-201ENST00000318978 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa27.79■■■□□ 2.04
CTXN1-201ENST00000318978 CNTN3Q9P232 1028 aa27.79■■■□□ 2.04
CTXN1-201ENST00000318978 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP27.79■■■□□ 2.04
CTXN1-201ENST00000318978 EFEMP2O95967 443 aa27.78■■■□□ 2.04
CTXN1-201ENST00000318978 CXCL8P10145 99 aa27.78■■■□□ 2.04
CTXN1-201ENST00000318978 KCNE1P15382 129 aa27.78■■■□□ 2.04
CTXN1-201ENST00000318978 EPCAMP16422 314 aa27.78■■■□□ 2.04
CTXN1-201ENST00000318978 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP27.78■■■□□ 2.04
CTXN1-201ENST00000318978 SLC10A6Q3KNW5 377 aa27.78■■■□□ 2.04
CTXN1-201ENST00000318978 FAM171A1Q5VUB5 890 aa27.78■■■□□ 2.04
CTXN1-201ENST00000318978 KIAA0319Q5VV43 1072 aa27.78■■■□□ 2.04
CTXN1-201ENST00000318978 RESP18Q5W5W9 173 aa27.78■■■□□ 2.04
CTXN1-201ENST00000318978 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP27.78■■■□□ 2.04
CTXN1-201ENST00000318978 HVCN1Q96D96 273 aa27.78■■■□□ 2.04
CTXN1-201ENST00000318978 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP27.78■■■□□ 2.04
CTXN1-201ENST00000318978 KBTBD4Q9NVX7 518 aa27.78■■■□□ 2.04
CTXN1-201ENST00000318978 PRKAG3Q9UGI9 489 aa27.78■■■□□ 2.04
CTXN1-201ENST00000318978 OGTO15294 1046 aa27.77■■■□□ 2.04
CTXN1-201ENST00000318978 LILRB3O75022 631 aa27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.3 ms