RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317243.9

ZNF554-201, Transcript of zinc finger protein 554, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF554, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554-201ENST00000317243 DCAF12L1Q5VU92 463 aa20.78■□□□□ 0.92
ZNF554-201ENST00000317243 AADACL2Q6P093 401 aa20.78■□□□□ 0.92
ZNF554-201ENST00000317243 LMO3Q8TAP4 145 aa20.78■□□□□ 0.92
ZNF554-201ENST00000317243 KCNV2Q8TDN2 545 aa20.78■□□□□ 0.92
ZNF554-201ENST00000317243 JDP2Q8WYK2 163 aa20.78■□□□□ 0.92
ZNF554-201ENST00000317243 AZI2Q9H6S1 392 aa20.78■□□□□ 0.92
ZNF554-201ENST00000317243 ANKRD63C9JTQ0 380 aa20.78■□□□□ 0.92
ZNF554-201ENST00000317243 MMP13P45452 471 aa20.78■□□□□ 0.92
ZNF554-201ENST00000317243 SNX1Q13596 522 aa20.78■□□□□ 0.92
ZNF554-201ENST00000317243 FAM102BQ5T8I3 360 aa20.78■□□□□ 0.92
ZNF554-201ENST00000317243 HOOK3Q86VS8 718 aa20.78■□□□□ 0.92
ZNF554-201ENST00000317243 CPNE8Q86YQ8 564 aa20.78■□□□□ 0.92
ZNF554-201ENST00000317243 CCDC113Q9H0I3 377 aa20.78■□□□□ 0.92
ZNF554-201ENST00000317243 TAOK3Q9H2K8 898 aa20.78■□□□□ 0.92
ZNF554-201ENST00000317243 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
ZNF554-201ENST00000317243 TMOD4Q9NZQ9 345 aa20.78■□□□□ 0.92
ZNF554-201ENST00000317243 PIM2Q9P1W9 311 aa20.78■□□□□ 0.92
ZNF554-201ENST00000317243 WDR46O15213 610 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
ZNF554-201ENST00000317243 ADRB2P07550 413 aa20.77■□□□□ 0.92
ZNF554-201ENST00000317243 CCND1P24385 295 aa20.77■□□□□ 0.92
ZNF554-201ENST00000317243 STAT1P42224 750 aa20.77■□□□□ 0.92
ZNF554-201ENST00000317243 QARSP47897 775 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
ZNF554-201ENST00000317243 SLMAPQ14BN4 828 aa20.77■□□□□ 0.92
ZNF554-201ENST00000317243 THAP2Q9H0W7 228 aa20.77■□□□□ 0.92
ZNF554-201ENST00000317243 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.92
ZNF554-201ENST00000317243 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa20.77■□□□□ 0.92
ZNF554-201ENST00000317243 HGSO14964 777 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.92
ZNF554-201ENST00000317243 LINGO3P0C6S8 592 aa20.77■□□□□ 0.92
ZNF554-201ENST00000317243 SLCO1A2P46721 670 aa20.77■□□□□ 0.92
ZNF554-201ENST00000317243 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
ZNF554-201ENST00000317243 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa20.77■□□□□ 0.92
ZNF554-201ENST00000317243 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
ZNF554-201ENST00000317243 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa20.77■□□□□ 0.92
ZNF554-201ENST00000317243 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa20.77■□□□□ 0.92
ZNF554-201ENST00000317243 CBWD2Q8IUF1 395 aa20.77■□□□□ 0.92
ZNF554-201ENST00000317243 BSNDQ8WZ55 320 aa20.77■□□□□ 0.92
ZNF554-201ENST00000317243 KLHL29Q96CT2 875 aa20.77■□□□□ 0.92
ZNF554-201ENST00000317243 RAB17Q9H0T7 212 aa20.77■□□□□ 0.92
ZNF554-201ENST00000317243 EPB41L4BQ9H329 900 aa20.77■□□□□ 0.92
ZNF554-201ENST00000317243 ETAA1Q9NY74 926 aa20.77■□□□□ 0.92
ZNF554-201ENST00000317243 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.91
ZNF554-201ENST00000317243 PPFIA2O75334 1257 aa20.77■□□□□ 0.91
ZNF554-201ENST00000317243 MYBL1P10243 752 aa20.77■□□□□ 0.91
ZNF554-201ENST00000317243 HMGCS2P54868 508 aa20.77■□□□□ 0.91
ZNF554-201ENST00000317243 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.91
ZNF554-201ENST00000317243 BLMHQ13867 455 aa20.77■□□□□ 0.91
ZNF554-201ENST00000317243 XKR9Q5GH70 373 aa20.77■□□□□ 0.91
ZNF554-201ENST00000317243 PCNX4Q63HM2 1172 aa20.77■□□□□ 0.91
ZNF554-201ENST00000317243 RNF207Q6ZRF8 634 aa20.77■□□□□ 0.91
ZNF554-201ENST00000317243 HAUS6Q7Z4H7 955 aa20.77■□□□□ 0.91
ZNF554-201ENST00000317243 SLC30A5Q8TAD4 765 aa20.77■□□□□ 0.91
ZNF554-201ENST00000317243 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.91
ZNF554-201ENST00000317243 CCDC127Q96BQ5 260 aa20.77■□□□□ 0.91
ZNF554-201ENST00000317243 PDCD2LQ9BRP1 358 aa20.77■□□□□ 0.91
ZNF554-201ENST00000317243 APEX2Q9UBZ4 518 aa20.77■□□□□ 0.91
ZNF554-201ENST00000317243 TRIM33Q9UPN9 1127 aa20.77■□□□□ 0.91
ZNF554-201ENST00000317243 TRAF1Q13077 416 aa20.76■□□□□ 0.91
ZNF554-201ENST00000317243 FBXO25Q8TCJ0 367 aa20.76■□□□□ 0.91
ZNF554-201ENST00000317243 SEC14L1Q92503 715 aa20.76■□□□□ 0.91
ZNF554-201ENST00000317243 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa20.76■□□□□ 0.91
ZNF554-201ENST00000317243 HOMER3Q9NSC5 361 aa20.76■□□□□ 0.91
ZNF554-201ENST00000317243 COG5Q9UP83 839 aa20.76■□□□□ 0.91
ZNF554-201ENST00000317243 ANKRD33BA6NCL7 494 aa20.76■□□□□ 0.91
ZNF554-201ENST00000317243 CCDC169A6NNP5 214 aa20.76■□□□□ 0.91
ZNF554-201ENST00000317243 IRF6O14896 467 aa20.76■□□□□ 0.91
ZNF554-201ENST00000317243 PMS2P54278 862 aa20.76■□□□□ 0.91
ZNF554-201ENST00000317243 DENND2CQ68D51 928 aa20.76■□□□□ 0.91
ZNF554-201ENST00000317243 ANO5Q75V66 913 aa20.76■□□□□ 0.91
ZNF554-201ENST00000317243 ERP44Q9BS26 406 aa20.76■□□□□ 0.91
ZNF554-201ENST00000317243 STK33Q9BYT3 514 aa20.76■□□□□ 0.91
ZNF554-201ENST00000317243 PXMP2Q9NR77 195 aa20.76■□□□□ 0.91
ZNF554-201ENST00000317243 HSPBP1Q9NZL4 362 aa20.76■□□□□ 0.91
ZNF554-201ENST00000317243 VWA5AO00534 786 aa20.75■□□□□ 0.91
ZNF554-201ENST00000317243 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP20.75■□□□□ 0.91
ZNF554-201ENST00000317243 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
ZNF554-201ENST00000317243 FERP16591 822 aa20.75■□□□□ 0.91
ZNF554-201ENST00000317243 ADSSP30520 456 aa20.75■□□□□ 0.91
ZNF554-201ENST00000317243 SLC29A2Q14542 456 aa20.75■□□□□ 0.91
ZNF554-201ENST00000317243 ARHGEF16Q5VV41 709 aa20.75■□□□□ 0.91
ZNF554-201ENST00000317243 SEL1LQ9UBV2 794 aa20.75■□□□□ 0.91
ZNF554-201ENST00000317243 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP20.75■□□□□ 0.91
ZNF554-201ENST00000317243 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP20.75■□□□□ 0.91
ZNF554-201ENST00000317243 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa20.75■□□□□ 0.91
ZNF554-201ENST00000317243 PTENP60484 403 aa20.75■□□□□ 0.91
ZNF554-201ENST00000317243 FSTL1Q12841 308 aa20.75■□□□□ 0.91
ZNF554-201ENST00000317243 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
ZNF554-201ENST00000317243 LLGL1Q15334 1064 aa20.75■□□□□ 0.91
ZNF554-201ENST00000317243 TRIM68Q6AZZ1 485 aa20.75■□□□□ 0.91
ZNF554-201ENST00000317243 NEK9Q8TD19 979 aa20.75■□□□□ 0.91
ZNF554-201ENST00000317243 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP20.75■□□□□ 0.91
ZNF554-201ENST00000317243 TXLNGYQ9BZA5 131 aa20.75■□□□□ 0.91
ZNF554-201ENST00000317243 PNMA3Q9UL41 463 aa20.75■□□□□ 0.91
ZNF554-201ENST00000317243 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa20.74■□□□□ 0.91
ZNF554-201ENST00000317243 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
ZNF554-201ENST00000317243 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
ZNF554-201ENST00000317243 ZNF862O60290 1169 aa20.74■□□□□ 0.91
ZNF554-201ENST00000317243 SNX3O60493 162 aa20.74■□□□□ 0.91
ZNF554-201ENST00000317243 NBPF20Q3BBV1 942 aa20.74■□□□□ 0.91
ZNF554-201ENST00000317243 CCDC38Q502W7 563 aa20.74■□□□□ 0.91
ZNF554-201ENST00000317243 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.9 ms