RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000300213.8

CCNDBP1-201, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCNDBP1, Length 3,660 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-201ENST00000300213 SPATA24Q86W54 205 aa15.65■□□□□ 0.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 SNF8Q96H20 258 aa15.65■□□□□ 0.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 CLPTM1LQ96KA5 538 aa15.65■□□□□ 0.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 AGPAT1Q99943 283 aa15.65■□□□□ 0.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 CENPKQ9BS16 269 aa15.65■□□□□ 0.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 SPZ1Q9BXG8 430 aa15.65■□□□□ 0.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa15.65■□□□□ 0.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 B2RBV5 119 aa15.65■□□□□ 0.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 M0R2N6 131 aa15.65■□□□□ 0.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 FAM200BP0CF97 657 aa15.65■□□□□ 0.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 SETSIPP0DME0 302 aa15.65■□□□□ 0.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 EPHB1P54762 984 aa15.65■□□□□ 0.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 LBRQ14739 615 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 RHOT2Q8IXI1 618 aa15.65■□□□□ 0.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 WDR60Q8WVS4 1066 aa15.65■□□□□ 0.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 MTMR9Q96QG7 549 aa15.65■□□□□ 0.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 KCTD10Q9H3F6 313 aa15.65■□□□□ 0.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 ETNK2Q9NVF9 386 aa15.65■□□□□ 0.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 ARL8BQ9NVJ2 186 aa15.65■□□□□ 0.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 RICTORQ6R327 1708 aa15.65■□□□□ 0.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 C5P01031 1676 aa15.65■□□□□ 0.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 PGM3O95394 542 aa15.65■□□□□ 0.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 CHRNB2P17787 502 aa15.65■□□□□ 0.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 KRT4P19013 534 aa15.65■□□□□ 0.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 ARFIP2P53365 341 aa15.65■□□□□ 0.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 USP46P62068 366 aa15.65■□□□□ 0.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 CETN1Q12798 172 aa15.65■□□□□ 0.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 C12orf60Q5U649 245 aa15.65■□□□□ 0.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 C4orf50Q6ZRC1 276 aa15.65■□□□□ 0.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP15.65■□□□□ 0.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP15.65■□□□□ 0.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
CCNDBP1-201ENST00000300213 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
CCNDBP1-201ENST00000300213 ATP6V1G1O75348 118 aa15.64■□□□□ 0.09
CCNDBP1-201ENST00000300213 BCRP11274 1271 aa15.64■□□□□ 0.09
CCNDBP1-201ENST00000300213 CCNB1P14635 433 aa15.64■□□□□ 0.09
CCNDBP1-201ENST00000300213 HSPA6P17066 643 aa15.64■□□□□ 0.09
CCNDBP1-201ENST00000300213 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP15.64■□□□□ 0.092e-6■□□□□ 9.9
CCNDBP1-201ENST00000300213 CBWD6Q4V339 395 aa15.64■□□□□ 0.09
CCNDBP1-201ENST00000300213 CBWD3Q5JTY5 395 aa15.64■□□□□ 0.09
CCNDBP1-201ENST00000300213 CBWD5Q5RIA9 395 aa15.64■□□□□ 0.09
CCNDBP1-201ENST00000300213 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
CCNDBP1-201ENST00000300213 RASSF3Q86WH2 238 aa15.64■□□□□ 0.09
CCNDBP1-201ENST00000300213 ZBED8Q8IZ13 594 aa15.64■□□□□ 0.09
CCNDBP1-201ENST00000300213 ANKLE1Q8NAG6 615 aa15.64■□□□□ 0.09
CCNDBP1-201ENST00000300213 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa15.64■□□□□ 0.09
CCNDBP1-201ENST00000300213 FNBP1Q96RU3 617 aa15.64■□□□□ 0.09
CCNDBP1-201ENST00000300213 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
CCNDBP1-201ENST00000300213 CCDC134Q9H6E4 229 aa15.64■□□□□ 0.09
CCNDBP1-201ENST00000300213 ANAPC7Q9UJX3 599 aa15.64■□□□□ 0.09
CCNDBP1-201ENST00000300213 PSMG1O95456 288 aa15.64■□□□□ 0.09
CCNDBP1-201ENST00000300213 OAS1P00973 400 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
CCNDBP1-201ENST00000300213 P3H1Q32P28 736 aa15.64■□□□□ 0.09
CCNDBP1-201ENST00000300213 WASHC2DQ5SRD0 308 aa15.64■□□□□ 0.09
CCNDBP1-201ENST00000300213 KAT5Q92993 513 aa15.64■□□□□ 0.09
CCNDBP1-201ENST00000300213 ART4Q93070 314 aa15.64■□□□□ 0.09
CCNDBP1-201ENST00000300213 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
CCNDBP1-201ENST00000300213 SH2D3AQ9BRG2 576 aa15.64■□□□□ 0.09
CCNDBP1-201ENST00000300213 STK33Q9BYT3 514 aa15.64■□□□□ 0.09
CCNDBP1-201ENST00000300213 MYH4Q9Y623 1939 aa15.64■□□□□ 0.09
CCNDBP1-201ENST00000300213 A0A1W2PPM1 405 aa15.64■□□□□ 0.09
CCNDBP1-201ENST00000300213 CYP26A1O43174 497 aa15.64■□□□□ 0.09
CCNDBP1-201ENST00000300213 ATP6V1B1P15313 513 aa15.64■□□□□ 0.09
CCNDBP1-201ENST00000300213 SERPINB6P35237 376 aa15.64■□□□□ 0.09
CCNDBP1-201ENST00000300213 PARP6Q2NL67 630 aa15.64■□□□□ 0.09
CCNDBP1-201ENST00000300213 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
CCNDBP1-201ENST00000300213 RFWD2Q8NHY2 731 aa15.64■□□□□ 0.09
CCNDBP1-201ENST00000300213 ERMNQ8TAM6 284 aa15.64■□□□□ 0.09
CCNDBP1-201ENST00000300213 SEC14L1Q92503 715 aa15.64■□□□□ 0.09
CCNDBP1-201ENST00000300213 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa15.64■□□□□ 0.09
CCNDBP1-201ENST00000300213 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
CCNDBP1-201ENST00000300213 ZNF287Q9HBT7 754 aa15.64■□□□□ 0.09
CCNDBP1-201ENST00000300213 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa15.64■□□□□ 0.09
CCNDBP1-201ENST00000300213 TNS3Q68CZ2 1445 aa15.64■□□□□ 0.09
CCNDBP1-201ENST00000300213 PI4K2BG5E9Z4 385 aa15.63■□□□□ 0.09
CCNDBP1-201ENST00000300213 ADRA1DP25100 572 aa15.63■□□□□ 0.09
CCNDBP1-201ENST00000300213 FMO5P49326 533 aa15.63■□□□□ 0.09
CCNDBP1-201ENST00000300213 IRX4P78413 519 aa15.63■□□□□ 0.09
CCNDBP1-201ENST00000300213 PDIA5Q14554 519 aa15.63■□□□□ 0.09
CCNDBP1-201ENST00000300213 SLC1A5Q15758 541 aa15.63■□□□□ 0.09
CCNDBP1-201ENST00000300213 CNPY1Q3B7I2 92 aa15.63■□□□□ 0.09
CCNDBP1-201ENST00000300213 FOXB2Q5VYV0 432 aa15.63■□□□□ 0.09
CCNDBP1-201ENST00000300213 FAM210AQ96ND0 272 aa15.63■□□□□ 0.09
CCNDBP1-201ENST00000300213 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
CCNDBP1-201ENST00000300213 LZTS2Q9BRK4 669 aa15.63■□□□□ 0.09
CCNDBP1-201ENST00000300213 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
CCNDBP1-201ENST00000300213 NDE1Q9NXR1 346 aa15.63■□□□□ 0.09
CCNDBP1-201ENST00000300213 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
CCNDBP1-201ENST00000300213 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa15.63■□□□□ 0.09
CCNDBP1-201ENST00000300213 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa15.63■□□□□ 0.09
CCNDBP1-201ENST00000300213 GOLGA8IPA6NC78 632 aa15.63■□□□□ 0.09
CCNDBP1-201ENST00000300213 GOLGA8JA6NMD2 632 aa15.63■□□□□ 0.09
CCNDBP1-201ENST00000300213 BANF1O75531 89 aa15.63■□□□□ 0.09
CCNDBP1-201ENST00000300213 CTNNA2P26232 953 aa15.63■□□□□ 0.09
CCNDBP1-201ENST00000300213 MAPK4P31152 587 aa15.63■□□□□ 0.09
CCNDBP1-201ENST00000300213 MAGEA4P43358 317 aa15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.1 ms