RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 PSMC3P17980 439 aa8.74□□□□□ -1.01
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PGGT1B-201ENST00000296642 NTHL1P78549 312 aa8.74□□□□□ -1.01
PGGT1B-201ENST00000296642 POU5F1BQ06416 359 aa8.74□□□□□ -1.01
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PGGT1B-201ENST00000296642 SLC27A1Q6PCB7 646 aa8.74□□□□□ -1.01
PGGT1B-201ENST00000296642 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
PGGT1B-201ENST00000296642 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
PGGT1B-201ENST00000296642 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa8.74□□□□□ -1.01
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PGGT1B-201ENST00000296642 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
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PGGT1B-201ENST00000296642 GPR179Q6PRD1 2367 aa8.74□□□□□ -1.01
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PGGT1B-201ENST00000296642 FAM208BQ5VWN6 2430 aa8.73□□□□□ -1.01
PGGT1B-201ENST00000296642 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa8.73□□□□□ -1.01
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PGGT1B-201ENST00000296642 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
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PGGT1B-201ENST00000296642 AKAP3O75969 853 aa8.72□□□□□ -1.01
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PGGT1B-201ENST00000296642 SATB1Q01826 763 aa8.72□□□□□ -1.01
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PGGT1B-201ENST00000296642 FZD5Q13467 585 aa8.72□□□□□ -1.01
PGGT1B-201ENST00000296642 GRM2Q14416 872 aa8.72□□□□□ -1.01
PGGT1B-201ENST00000296642 EMC2Q15006 297 aa8.72□□□□□ -1.01
PGGT1B-201ENST00000296642 TANGO2Q6ICL3 276 aa8.72□□□□□ -1.01
PGGT1B-201ENST00000296642 WDR5BQ86VZ2 330 aa8.72□□□□□ -1.01
PGGT1B-201ENST00000296642 TRIM22Q8IYM9 498 aa8.72□□□□□ -1.01
PGGT1B-201ENST00000296642 TBCKQ8TEA7 893 aa8.72□□□□□ -1.01
PGGT1B-201ENST00000296642 SMARCD2Q92925 531 aa8.72□□□□□ -1.01
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