RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296031.4

CXCL2-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CXCL2, Length 577 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2-201ENST00000296031 COASYQ13057 564 aa27.28■■□□□ 1.96
CXCL2-201ENST00000296031 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP27.28■■□□□ 1.96
CXCL2-201ENST00000296031 NAB2Q15742 525 aa27.28■■□□□ 1.96
CXCL2-201ENST00000296031 AAK1Q2M2I8 961 aa27.28■■□□□ 1.96
CXCL2-201ENST00000296031 XKR4Q5GH76 650 aa27.28■■□□□ 1.96
CXCL2-201ENST00000296031 SLC39A4Q6P5W5 647 aa27.28■■□□□ 1.96
CXCL2-201ENST00000296031 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP27.28■■□□□ 1.96
CXCL2-201ENST00000296031 SNX27Q96L92 541 aa27.28■■□□□ 1.96
CXCL2-201ENST00000296031 ASB2Q96Q27 587 aa27.28■■□□□ 1.96
CXCL2-201ENST00000296031 SERTAD1Q9UHV2 236 aa27.28■■□□□ 1.96
CXCL2-201ENST00000296031 A0A0B4J269 797 aa27.27■■□□□ 1.96
CXCL2-201ENST00000296031 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa27.27■■□□□ 1.96
CXCL2-201ENST00000296031 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa27.27■■□□□ 1.96
CXCL2-201ENST00000296031 A0A1W2PQ27 194 aa27.27■■□□□ 1.96
CXCL2-201ENST00000296031 A0A1W2PQ64 194 aa27.27■■□□□ 1.96
CXCL2-201ENST00000296031 A0A1W2PQD8 194 aa27.27■■□□□ 1.96
CXCL2-201ENST00000296031 ANKRD63C9JTQ0 380 aa27.27■■□□□ 1.96
CXCL2-201ENST00000296031 LINC01565O15544 149 aa27.27■■□□□ 1.96
CXCL2-201ENST00000296031 CXCL14O95715 111 aa27.27■■□□□ 1.96
CXCL2-201ENST00000296031 MYBP10242 640 aa27.27■■□□□ 1.96
CXCL2-201ENST00000296031 AFMP43652 599 aa27.27■■□□□ 1.96
CXCL2-201ENST00000296031 CASP5P51878 434 aa27.27■■□□□ 1.96
CXCL2-201ENST00000296031 CTC1Q2NKJ3 1217 aa27.27■■□□□ 1.96
CXCL2-201ENST00000296031 AUTS2Q8WXX7 1259 aa27.27■■□□□ 1.96
CXCL2-201ENST00000296031 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
CXCL2-201ENST00000296031 PAAF1Q9BRP4 392 aa27.27■■□□□ 1.96
CXCL2-201ENST00000296031 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
CXCL2-201ENST00000296031 CLTAP09496 248 aa27.26■■□□□ 1.95
CXCL2-201ENST00000296031 CTSAP10619 480 aa27.26■■□□□ 1.95
CXCL2-201ENST00000296031 CASP1P29466 404 aa27.26■■□□□ 1.95
CXCL2-201ENST00000296031 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
CXCL2-201ENST00000296031 KCNQ1P51787 676 aa27.26■■□□□ 1.95
CXCL2-201ENST00000296031 ALCAMQ13740 583 aa27.26■■□□□ 1.95
CXCL2-201ENST00000296031 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP27.26■■□□□ 1.95
CXCL2-201ENST00000296031 KYAT1Q16773 422 aa27.26■■□□□ 1.95
CXCL2-201ENST00000296031 DUSP6Q16828 381 aa27.26■■□□□ 1.95
CXCL2-201ENST00000296031 TJAP1Q5JTD0 557 aa27.26■■□□□ 1.95
CXCL2-201ENST00000296031 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
CXCL2-201ENST00000296031 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa27.26■■□□□ 1.95
CXCL2-201ENST00000296031 EFHBQ8N7U6 833 aa27.26■■□□□ 1.95
CXCL2-201ENST00000296031 ACCSQ96QU6 501 aa27.26■■□□□ 1.95
CXCL2-201ENST00000296031 MSTO1Q9BUK6 570 aa27.26■■□□□ 1.95
CXCL2-201ENST00000296031 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa27.26■■□□□ 1.95
CXCL2-201ENST00000296031 BLZF1Q9H2G9 400 aa27.26■■□□□ 1.95
CXCL2-201ENST00000296031 IKZF4Q9H2S9 585 aa27.26■■□□□ 1.95
CXCL2-201ENST00000296031 USP25Q9UHP3 1055 aa27.26■■□□□ 1.95
CXCL2-201ENST00000296031 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP27.26■■□□□ 1.95
CXCL2-201ENST00000296031 EXOC7Q9UPT5 735 aa27.26■■□□□ 1.95
CXCL2-201ENST00000296031 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
CXCL2-201ENST00000296031 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP27.25■■□□□ 1.95
CXCL2-201ENST00000296031 C2orf71A6NGG8 1288 aa27.25■■□□□ 1.95
CXCL2-201ENST00000296031 TISP43B9A030 160 aa27.25■■□□□ 1.95
CXCL2-201ENST00000296031 H3BQ06 376 aaPredicted RBP27.25■■□□□ 1.95
CXCL2-201ENST00000296031 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP27.25■■□□□ 1.95
CXCL2-201ENST00000296031 KCNE1P15382 129 aa27.25■■□□□ 1.95
CXCL2-201ENST00000296031 NDUFA8P51970 172 aa27.25■■□□□ 1.95
CXCL2-201ENST00000296031 KCNA1Q09470 495 aa27.25■■□□□ 1.95
CXCL2-201ENST00000296031 ADAM15Q13444 863 aa27.25■■□□□ 1.95
CXCL2-201ENST00000296031 SLC10A6Q3KNW5 377 aa27.25■■□□□ 1.95
CXCL2-201ENST00000296031 SLFN12LQ6IEE8 588 aa27.25■■□□□ 1.95
CXCL2-201ENST00000296031 FSIP1Q8NA03 581 aa27.25■■□□□ 1.95
CXCL2-201ENST00000296031 HPS3Q969F9 1004 aa27.25■■□□□ 1.95
CXCL2-201ENST00000296031 PAGE5Q96GU1 130 aa27.25■■□□□ 1.95
CXCL2-201ENST00000296031 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP27.25■■□□□ 1.95
CXCL2-201ENST00000296031 CNTN3Q9P232 1028 aa27.25■■□□□ 1.95
CXCL2-201ENST00000296031 ADAM28Q9UKQ2 775 aa27.25■■□□□ 1.95
CXCL2-201ENST00000296031 STYXL1Q9Y6J8 313 aa27.25■■□□□ 1.95
CXCL2-201ENST00000296031 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP27.25■■□□□ 1.95
CXCL2-201ENST00000296031 OGTO15294 1046 aa27.24■■□□□ 1.95
CXCL2-201ENST00000296031 FAM189A1O60320 539 aa27.24■■□□□ 1.95
CXCL2-201ENST00000296031 EFEMP2O95967 443 aa27.24■■□□□ 1.95
CXCL2-201ENST00000296031 CXCL8P10145 99 aa27.24■■□□□ 1.95
CXCL2-201ENST00000296031 TNFSF9P41273 254 aa27.24■■□□□ 1.95
CXCL2-201ENST00000296031 SYKP43405 635 aa27.24■■□□□ 1.95
CXCL2-201ENST00000296031 NDUFV1P49821 464 aa27.24■■□□□ 1.95
CXCL2-201ENST00000296031 CUL4BQ13620 913 aa27.24■■□□□ 1.95
CXCL2-201ENST00000296031 HASPINQ8TF76 798 aa27.24■■□□□ 1.95
CXCL2-201ENST00000296031 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
CXCL2-201ENST00000296031 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa27.24■■□□□ 1.95
CXCL2-201ENST00000296031 SLC38A7Q9NVC3 462 aa27.24■■□□□ 1.95
CXCL2-201ENST00000296031 IRAK3Q9Y616 596 aa27.24■■□□□ 1.95
CXCL2-201ENST00000296031 FSD2A1L4K1 749 aa27.23■■□□□ 1.95
CXCL2-201ENST00000296031 TBX10O75333 385 aa27.23■■□□□ 1.95
CXCL2-201ENST00000296031 TADA2AO75478 443 aa27.23■■□□□ 1.95
CXCL2-201ENST00000296031 SOD2P04179 222 aa27.23■■□□□ 1.95
CXCL2-201ENST00000296031 LTBRP36941 435 aa27.23■■□□□ 1.95
CXCL2-201ENST00000296031 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP27.23■■□□□ 1.95
CXCL2-201ENST00000296031 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa27.23■■□□□ 1.95
CXCL2-201ENST00000296031 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa27.23■■□□□ 1.95
CXCL2-201ENST00000296031 UNC13DQ70J99 1090 aa27.23■■□□□ 1.95
CXCL2-201ENST00000296031 TAS1R1Q7RTX1 841 aa27.23■■□□□ 1.95
CXCL2-201ENST00000296031 TMEM87AQ8NBN3 555 aa27.23■■□□□ 1.95
CXCL2-201ENST00000296031 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa27.23■■□□□ 1.95
CXCL2-201ENST00000296031 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa27.23■■□□□ 1.95
CXCL2-201ENST00000296031 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP27.22■■□□□ 1.95
CXCL2-201ENST00000296031 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa27.22■■□□□ 1.95
CXCL2-201ENST00000296031 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP27.22■■□□□ 1.95
CXCL2-201ENST00000296031 KIF4AO95239 1232 aa27.22■■□□□ 1.95
CXCL2-201ENST00000296031 PTPN14Q15678 1187 aa27.22■■□□□ 1.95
CXCL2-201ENST00000296031 LEXMQ3ZCV2 418 aa27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms