RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282841.9

GGPS1-201, Transcript of geranylgeranyl diphosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GGPS1, Length 2,895 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGPS1-201ENST00000282841 STK33Q9BYT3 514 aa11.86□□□□□ -0.51
GGPS1-201ENST00000282841 RAB20Q9NX57 234 aa11.86□□□□□ -0.51
GGPS1-201ENST00000282841 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
GGPS1-201ENST00000282841 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
GGPS1-201ENST00000282841 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP11.86□□□□□ -0.517e-7■■■■□ 20.7
GGPS1-201ENST00000282841 TOM1L1O75674 476 aa11.86□□□□□ -0.51
GGPS1-201ENST00000282841 VNN1O95497 513 aa11.86□□□□□ -0.51
GGPS1-201ENST00000282841 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
GGPS1-201ENST00000282841 CXCR5P32302 372 aa11.86□□□□□ -0.51
GGPS1-201ENST00000282841 STAT1P42224 750 aa11.86□□□□□ -0.51
GGPS1-201ENST00000282841 VAV2P52735 878 aa11.86□□□□□ -0.51
GGPS1-201ENST00000282841 SLC20A2Q08357 652 aa11.86□□□□□ -0.51
GGPS1-201ENST00000282841 CETN1Q12798 172 aa11.86□□□□□ -0.51
GGPS1-201ENST00000282841 ZNF484Q5JVG2 852 aa11.86□□□□□ -0.51
GGPS1-201ENST00000282841 FBXL13Q8NEE6 735 aa11.86□□□□□ -0.51
GGPS1-201ENST00000282841 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
GGPS1-201ENST00000282841 CAPZA3Q96KX2 299 aa11.86□□□□□ -0.51
GGPS1-201ENST00000282841 PRIMPOLQ96LW4 560 aa11.86□□□□□ -0.51
GGPS1-201ENST00000282841 AP5M1Q9H0R1 490 aa11.86□□□□□ -0.51
GGPS1-201ENST00000282841 ZNF185O15231 689 aa11.85□□□□□ -0.51
GGPS1-201ENST00000282841 HOXC6P09630 235 aa11.85□□□□□ -0.51
GGPS1-201ENST00000282841 KRT5P13647 590 aa11.85□□□□□ -0.51
GGPS1-201ENST00000282841 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
GGPS1-201ENST00000282841 CDK17Q00537 523 aa11.85□□□□□ -0.51
GGPS1-201ENST00000282841 MFSD10Q14728 455 aa11.85□□□□□ -0.51
GGPS1-201ENST00000282841 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
GGPS1-201ENST00000282841 C2CD6Q53TS8 623 aa11.85□□□□□ -0.51
GGPS1-201ENST00000282841 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
GGPS1-201ENST00000282841 EDEM3Q9BZQ6 932 aa11.85□□□□□ -0.51
GGPS1-201ENST00000282841 TMEM134Q9H6X4 195 aa11.85□□□□□ -0.51
GGPS1-201ENST00000282841 TMEM8AQ9HCN3 771 aa11.85□□□□□ -0.51
GGPS1-201ENST00000282841 H0YCG3 227 aa11.85□□□□□ -0.51
GGPS1-201ENST00000282841 ABLIM1O14639 778 aa11.85□□□□□ -0.51
GGPS1-201ENST00000282841 FAM189A1O60320 539 aa11.85□□□□□ -0.51
GGPS1-201ENST00000282841 PHACTR2O75167 634 aa11.85□□□□□ -0.51
GGPS1-201ENST00000282841 HLA-DRAP01903 254 aa11.85□□□□□ -0.51
GGPS1-201ENST00000282841 PIK3CAP42336 1068 aa11.85□□□□□ -0.51
GGPS1-201ENST00000282841 EFNA5P52803 228 aa11.85□□□□□ -0.51
GGPS1-201ENST00000282841 SLC18A3Q16572 532 aa11.85□□□□□ -0.51
GGPS1-201ENST00000282841 FAM47CQ5HY64 1035 aa11.85□□□□□ -0.51
GGPS1-201ENST00000282841 CD99L2Q8TCZ2 262 aa11.85□□□□□ -0.51
GGPS1-201ENST00000282841 TMEM40Q8WWA1 233 aa11.85□□□□□ -0.51
GGPS1-201ENST00000282841 HINFPQ9BQA5 517 aa11.85□□□□□ -0.51
GGPS1-201ENST00000282841 FZD8Q9H461 694 aa11.85□□□□□ -0.51
GGPS1-201ENST00000282841 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa11.85□□□□□ -0.51
GGPS1-201ENST00000282841 HYOU1Q9Y4L1 999 aa11.85□□□□□ -0.51
GGPS1-201ENST00000282841 STYXL1Q9Y6J8 313 aa11.85□□□□□ -0.51
GGPS1-201ENST00000282841 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa11.85□□□□□ -0.51
GGPS1-201ENST00000282841 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa11.85□□□□□ -0.51
GGPS1-201ENST00000282841 ACKR2O00590 384 aa11.85□□□□□ -0.51
GGPS1-201ENST00000282841 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
GGPS1-201ENST00000282841 CYP2C9P11712 490 aa11.85□□□□□ -0.51
GGPS1-201ENST00000282841 FCGRTP55899 365 aa11.85□□□□□ -0.51
GGPS1-201ENST00000282841 TFDP1Q14186 410 aa11.85□□□□□ -0.51
GGPS1-201ENST00000282841 ZNF394Q53GI3 561 aa11.85□□□□□ -0.51
GGPS1-201ENST00000282841 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa11.85□□□□□ -0.51
GGPS1-201ENST00000282841 HELQQ8TDG4 1101 aa11.85□□□□□ -0.51
GGPS1-201ENST00000282841 APOL6Q9BWW8 343 aa11.85□□□□□ -0.51
GGPS1-201ENST00000282841 CDT1Q9H211 546 aa11.85□□□□□ -0.51
GGPS1-201ENST00000282841 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
GGPS1-201ENST00000282841 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
GGPS1-201ENST00000282841 KRT86O43790 486 aa11.84□□□□□ -0.51
GGPS1-201ENST00000282841 TMOD1P28289 359 aa11.84□□□□□ -0.51
GGPS1-201ENST00000282841 GPC3P51654 580 aa11.84□□□□□ -0.51
GGPS1-201ENST00000282841 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
GGPS1-201ENST00000282841 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa11.84□□□□□ -0.51
GGPS1-201ENST00000282841 SLFN12LQ6IEE8 588 aa11.84□□□□□ -0.51
GGPS1-201ENST00000282841 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
GGPS1-201ENST00000282841 EHD2Q9NZN4 543 aa11.84□□□□□ -0.51
GGPS1-201ENST00000282841 NAGPAQ9UK23 515 aa11.84□□□□□ -0.51
GGPS1-201ENST00000282841 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
GGPS1-201ENST00000282841 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
GGPS1-201ENST00000282841 FTCDO95954 541 aa11.84□□□□□ -0.51
GGPS1-201ENST00000282841 F2P00734 622 aa11.84□□□□□ -0.51
GGPS1-201ENST00000282841 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
GGPS1-201ENST00000282841 KRT19P08727 400 aa11.84□□□□□ -0.51
GGPS1-201ENST00000282841 CTSHP09668 335 aa11.84□□□□□ -0.51
GGPS1-201ENST00000282841 CD58P19256 250 aa11.84□□□□□ -0.51
GGPS1-201ENST00000282841 PHKA2P46019 1235 aa11.84□□□□□ -0.51
GGPS1-201ENST00000282841 PSEN2P49810 448 aa11.84□□□□□ -0.51
GGPS1-201ENST00000282841 ORC1Q13415 861 aa11.84□□□□□ -0.51
GGPS1-201ENST00000282841 PSMD6Q15008 389 aa11.84□□□□□ -0.51
GGPS1-201ENST00000282841 AMHR2Q16671 573 aa11.84□□□□□ -0.51
GGPS1-201ENST00000282841 EFCAB13Q8IY85 973 aa11.84□□□□□ -0.51
GGPS1-201ENST00000282841 LINC01465Q8N7H1 131 aa11.84□□□□□ -0.51
GGPS1-201ENST00000282841 OLIG1Q8TAK6 271 aa11.84□□□□□ -0.51
GGPS1-201ENST00000282841 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
GGPS1-201ENST00000282841 IQCDQ96DY2 449 aa11.84□□□□□ -0.51
GGPS1-201ENST00000282841 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa11.83□□□□□ -0.52
GGPS1-201ENST00000282841 CTAGE9A4FU28 777 aa11.83□□□□□ -0.52
GGPS1-201ENST00000282841 PIGRP01833 764 aa11.83□□□□□ -0.52
GGPS1-201ENST00000282841 CFHP08603 1231 aa11.83□□□□□ -0.52
GGPS1-201ENST00000282841 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
GGPS1-201ENST00000282841 NOGQ13253 232 aa11.83□□□□□ -0.52
GGPS1-201ENST00000282841 MPZL3Q6UWV2 235 aa11.83□□□□□ -0.52
GGPS1-201ENST00000282841 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
GGPS1-201ENST00000282841 TMC2Q8TDI7 906 aa11.83□□□□□ -0.52
GGPS1-201ENST00000282841 SOCS4Q8WXH5 440 aa11.83□□□□□ -0.52
GGPS1-201ENST00000282841 NT5C1BQ96P26 610 aa11.83□□□□□ -0.52
GGPS1-201ENST00000282841 OSBPL7Q9BZF2 842 aa11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.1 ms