RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000049074.12

Ptprf-201, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene Ptprf, Length 7,656 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ero1bQ8R2E9 467 aa18.44■□□□□ 0.54
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Mrpl4Q9DCU6 294 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Prrg1A2BFE8 218 aa18.44■□□□□ 0.54
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Tmem132bF7BAB2 1078 aa18.44■□□□□ 0.54
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Anp32cQ64G17 123 aa18.44■□□□□ 0.54
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ticam2Q8BJQ4 232 aa18.44■□□□□ 0.54
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Spats2Q8K1N4 545 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Stk33Q924X7 491 aa18.44■□□□□ 0.54
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Man1a2P39098 641 aa18.44■□□□□ 0.54
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Wbp4Q61048 376 aa18.44■□□□□ 0.54
Ptprf-201ENSMUST00000049074 HnmtQ91VF2 295 aa18.44■□□□□ 0.54
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Tssc4Q9JHE7 317 aa18.44■□□□□ 0.54
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Q8BGN9 141 aa18.44■□□□□ 0.54
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Apopt1Q9CQW7 192 aa18.44■□□□□ 0.54
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Atp11cQ9QZW0 1129 aa18.44■□□□□ 0.54
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Shcbp1Q9Z179 668 aa18.44■□□□□ 0.54
Ptprf-201ENSMUST00000049074 VcpkmtQ8C436 228 aa18.44■□□□□ 0.54
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ccdc15Q8C9M2 810 aa18.44■□□□□ 0.54
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Med24Q99K74 987 aa18.44■□□□□ 0.54
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Hspbp1Q99P31 357 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ighv11-2A0A075B5R8 117 aa18.43■□□□□ 0.54
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Cyp2b10P12791 500 aa18.43■□□□□ 0.54
Ptprf-201ENSMUST00000049074 DselQ0VBN2 1207 aa18.43■□□□□ 0.54
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Fam183bQ5NC57 135 aa18.43■□□□□ 0.54
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Snx24Q9CRB0 169 aa18.43■□□□□ 0.54
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Mtif3Q9CZD5 276 aa18.43■□□□□ 0.54
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ercc4Q9QZD4 917 aa18.43■□□□□ 0.54
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Crlf3Q9Z2L7 442 aa18.43■□□□□ 0.54
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Spata31d1bE9QA57 1361 aa18.43■□□□□ 0.54
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Dip2aQ8BWT5 1523 aa18.43■□□□□ 0.54
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Mmrn1B2RPV6 1210 aa18.43■□□□□ 0.54
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Cyp3a59D3Z2W7 503 aa18.43■□□□□ 0.54
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Sec31aQ3UPL0 1230 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Pla2g4cQ64GA5 597 aa18.43■□□□□ 0.54
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Zfp454Q80Y34 536 aa18.43■□□□□ 0.54
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Castor2Q8CAB8 329 aa18.43■□□□□ 0.54
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Arl6ip4Q9JM93 229 aa18.43■□□□□ 0.54
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Limd1Q9QXD8 668 aa18.43■□□□□ 0.54
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Tecpr2Q3UH45 1423 aa18.43■□□□□ 0.54
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Capn2O08529 700 aa18.43■□□□□ 0.54
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Rps6P62754 249 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Snx10Q9CWT3 201 aa18.43■□□□□ 0.54
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Cdc42bpgQ80UW5 1551 aa18.43■□□□□ 0.54
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gm13084A2A8N0 494 aa18.43■□□□□ 0.54
Ptprf-201ENSMUST00000049074 PdynO35417 248 aa18.43■□□□□ 0.54
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Apba2P98084 750 aa18.43■□□□□ 0.54
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Dhx32Q8BZS9 744 aa18.43■□□□□ 0.54
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Pkp3Q9QY23 797 aa18.43■□□□□ 0.54
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Mmp13P33435 472 aa18.43■□□□□ 0.54
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Fam91a1Q3UVG3 837 aa18.43■□□□□ 0.54
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Tcp11l2Q8K1H7 517 aa18.43■□□□□ 0.54
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Plekhg6Q8R0J1 787 aa18.43■□□□□ 0.54
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Syngap1F6SEU4 1340 aa18.43■□□□□ 0.54
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Lrrc47Q505F5 581 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gm5622Q810Q0 167 aa18.43■□□□□ 0.54
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Pnldc1B2RXZ1 531 aa18.42■□□□□ 0.54
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Usp17lbE9Q9U0 468 aa18.42■□□□□ 0.54
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Slc16a2O70324 545 aa18.42■□□□□ 0.54
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Sox5P35710 763 aa18.42■□□□□ 0.54
Ptprf-201ENSMUST00000049074 GOLGA7BQ9D428 167 aa18.42■□□□□ 0.54
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Lcn6A2AJB9 181 aa18.42■□□□□ 0.54
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Aldh2P47738 519 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
Ptprf-201ENSMUST00000049074 PodnQ7TQ62 611 aa18.42■□□□□ 0.54
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Fam161bQ8CB59 589 aa18.42■□□□□ 0.54
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Sept8Q8CHH9 429 aa18.42■□□□□ 0.54
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Rhobtb2Q91V93 728 aa18.42■□□□□ 0.54
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Sec22bO08547 215 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Q66JV7 365 aa18.42■□□□□ 0.54
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Hdac10Q6P3E7 666 aa18.42■□□□□ 0.54
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Kct2Q8K201 259 aa18.42■□□□□ 0.54
Ptprf-201ENSMUST00000049074 PrameQ9D4Z5 464 aa18.42■□□□□ 0.54
Ptprf-201ENSMUST00000049074 HaspinQ9Z0R0 754 aa18.42■□□□□ 0.54
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Mindy4b-psA0A1W2P7H6 457 aa18.42■□□□□ 0.54
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Olfr414E9Q5P8 317 aa18.42■□□□□ 0.54
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Myl4P09541 193 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Lrrc14bQ3UJB3 510 aa18.42■□□□□ 0.54
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ccdc50Q810U5 305 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Tlk1Q8C0V0 766 aa18.42■□□□□ 0.54
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Tmem132cQ8CEF9 1099 aa18.42■□□□□ 0.54
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Dhx30Q99PU8 1217 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Tcirg1Q9JHF5 834 aa18.42■□□□□ 0.54
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Acad12D3Z7X0 555 aa18.42■□□□□ 0.54
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Mup5P11591 180 aa18.42■□□□□ 0.54
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Sun2Q8BJS4 731 aa18.42■□□□□ 0.54
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Oas1dQ8VI95 361 aa18.42■□□□□ 0.54
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Iqcj-Schip1A0A088MLT8 559 aa18.42■□□□□ 0.54
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Schip1P0DPB4 484 aa18.42■□□□□ 0.54
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Suz12Q80U70 741 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
Ptprf-201ENSMUST00000049074 RbakQ8BQC8 711 aa18.42■□□□□ 0.54
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Trpv2Q9WTR1 756 aa18.42■□□□□ 0.54
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Tac1P41539 130 aa18.41■□□□□ 0.54
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Lig3P97386 1015 aa18.41■□□□□ 0.54
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Fbxo9Q8BK06 437 aa18.41■□□□□ 0.54
Ptprf-201ENSMUST00000049074 E2f6O54917 272 aa18.41■□□□□ 0.54
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Sash1P59808 1230 aa18.41■□□□□ 0.54
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Cyp2c65Q148B1 490 aa18.41■□□□□ 0.54
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Yipf3Q3UDR8 347 aa18.41■□□□□ 0.54
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Zfp251Q6PCX8 632 aa18.41■□□□□ 0.54
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Glis1Q8K1M4 789 aa18.41■□□□□ 0.54
Ptprf-201ENSMUST00000049074 MkksQ9JI70 570 aa18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 29.7 ms