RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641643.1

SYT6-210, Transcript of synaptotagmin 6, humanhuman

BASIC

Gene SYT6, Length 1,587 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT6-210ENST00000641643 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
SYT6-210ENST00000641643 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
SYT6-210ENST00000641643 COLEC11Q9BWP8 271 aa24.54■■□□□ 1.52
SYT6-210ENST00000641643 PANK2Q9BZ23 570 aa24.54■■□□□ 1.52
SYT6-210ENST00000641643 ZBP1Q9H171 429 aa24.54■■□□□ 1.52
SYT6-210ENST00000641643 CFAP45Q9UL16 551 aa24.54■■□□□ 1.52
SYT6-210ENST00000641643 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
SYT6-210ENST00000641643 C2orf71A6NGG8 1288 aa24.53■■□□□ 1.52
SYT6-210ENST00000641643 K7ENM7 598 aa24.53■■□□□ 1.52
SYT6-210ENST00000641643 TRAK2O60296 914 aa24.53■■□□□ 1.52
SYT6-210ENST00000641643 TBX10O75333 385 aa24.53■■□□□ 1.52
SYT6-210ENST00000641643 THP07101 528 aa24.53■■□□□ 1.52
SYT6-210ENST00000641643 CTSAP10619 480 aa24.53■■□□□ 1.52
SYT6-210ENST00000641643 SCP2P22307 547 aa24.53■■□□□ 1.52
SYT6-210ENST00000641643 ZNF131P52739 623 aa24.53■■□□□ 1.52
SYT6-210ENST00000641643 YARSP54577 528 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
SYT6-210ENST00000641643 NCKAP1LP55160 1127 aa24.53■■□□□ 1.52
SYT6-210ENST00000641643 CLUL1Q15846 466 aa24.53■■□□□ 1.52
SYT6-210ENST00000641643 HAUS6Q7Z4H7 955 aa24.53■■□□□ 1.52
SYT6-210ENST00000641643 ZBTB33Q86T24 672 aa24.53■■□□□ 1.52
SYT6-210ENST00000641643 BICD1Q96G01 975 aa24.53■■□□□ 1.52
SYT6-210ENST00000641643 PTPRHQ9HD43 1115 aa24.53■■□□□ 1.52
SYT6-210ENST00000641643 MPZL3Q6UWV2 235 aa24.52■■□□□ 1.52
SYT6-210ENST00000641643 FAM178BQ8IXR5 827 aa24.52■■□□□ 1.52
SYT6-210ENST00000641643 KCNG4Q8TDN1 519 aa24.52■■□□□ 1.52
SYT6-210ENST00000641643 CDT1Q9H211 546 aa24.52■■□□□ 1.52
SYT6-210ENST00000641643 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
SYT6-210ENST00000641643 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa24.52■■□□□ 1.52
SYT6-210ENST00000641643 TOM1L1O75674 476 aa24.51■■□□□ 1.51
SYT6-210ENST00000641643 MCF2P10911 925 aa24.51■■□□□ 1.51
SYT6-210ENST00000641643 HARSP12081 509 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
SYT6-210ENST00000641643 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP24.51■■□□□ 1.51
SYT6-210ENST00000641643 OSTNP61366 133 aa24.51■■□□□ 1.51
SYT6-210ENST00000641643 ZPBP2Q6X784 338 aa24.51■■□□□ 1.51
SYT6-210ENST00000641643 DYMQ7RTS9 669 aa24.51■■□□□ 1.51
SYT6-210ENST00000641643 PDILTQ8N807 584 aa24.51■■□□□ 1.51
SYT6-210ENST00000641643 CD207Q9UJ71 328 aa24.51■■□□□ 1.51
SYT6-210ENST00000641643 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
SYT6-210ENST00000641643 GRXCR2A6NFK2 248 aa24.5■■□□□ 1.51
SYT6-210ENST00000641643 CLDN3O15551 220 aa24.5■■□□□ 1.51
SYT6-210ENST00000641643 CUTAO60888 179 aa24.5■■□□□ 1.51
SYT6-210ENST00000641643 PROZP22891 400 aa24.5■■□□□ 1.51
SYT6-210ENST00000641643 ABCD1P33897 745 aa24.5■■□□□ 1.51
SYT6-210ENST00000641643 GRM5P41594 1212 aa24.5■■□□□ 1.51
SYT6-210ENST00000641643 TUSC3Q13454 348 aa24.5■■□□□ 1.51
SYT6-210ENST00000641643 AUTS2Q8WXX7 1259 aa24.5■■□□□ 1.51
SYT6-210ENST00000641643 DDX12PQ92771 950 aa24.5■■□□□ 1.51
SYT6-210ENST00000641643 MARCH5Q9NX47 278 aa24.5■■□□□ 1.51
SYT6-210ENST00000641643 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
SYT6-210ENST00000641643 IRAK3Q9Y616 596 aa24.5■■□□□ 1.51
SYT6-210ENST00000641643 MUC3AQ02505 3323 aa24.5■■□□□ 1.51
SYT6-210ENST00000641643 PTGESO14684 152 aa24.5■■□□□ 1.51
SYT6-210ENST00000641643 GLP2RO95838 553 aa24.5■■□□□ 1.51
SYT6-210ENST00000641643 SOD2P04179 222 aa24.5■■□□□ 1.51
SYT6-210ENST00000641643 IL9P15248 144 aa24.5■■□□□ 1.51
SYT6-210ENST00000641643 LLGL2Q6P1M3 1020 aa24.5■■□□□ 1.51
SYT6-210ENST00000641643 CEP120Q8N960 986 aa24.5■■□□□ 1.51
SYT6-210ENST00000641643 ACAP3Q96P50 834 aa24.5■■□□□ 1.51
SYT6-210ENST00000641643 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
SYT6-210ENST00000641643 CLEC1BQ9P126 229 aa24.5■■□□□ 1.51
SYT6-210ENST00000641643 TBX20Q9UMR3 447 aa24.5■■□□□ 1.51
SYT6-210ENST00000641643 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa24.5■■□□□ 1.51
SYT6-210ENST00000641643 CASTOR2A6NHX0 329 aa24.49■■□□□ 1.51
SYT6-210ENST00000641643 TADA2AO75478 443 aa24.49■■□□□ 1.51
SYT6-210ENST00000641643 URODP06132 367 aa24.49■■□□□ 1.51
SYT6-210ENST00000641643 ME1P48163 572 aa24.49■■□□□ 1.51
SYT6-210ENST00000641643 LIG4P49917 911 aa24.49■■□□□ 1.51
SYT6-210ENST00000641643 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
SYT6-210ENST00000641643 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
SYT6-210ENST00000641643 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP24.49■■□□□ 1.51
SYT6-210ENST00000641643 KCNN1Q92952 543 aa24.49■■□□□ 1.51
SYT6-210ENST00000641643 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
SYT6-210ENST00000641643 VN1R3Q9BXE9 311 aa24.49■■□□□ 1.51
SYT6-210ENST00000641643 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
SYT6-210ENST00000641643 TNFRSF10AO00220 468 aa24.48■■□□□ 1.51
SYT6-210ENST00000641643 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
SYT6-210ENST00000641643 BRD1O95696 1058 aa24.48■■□□□ 1.51
SYT6-210ENST00000641643 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
SYT6-210ENST00000641643 GLRA4Q5JXX5 417 aa24.48■■□□□ 1.51
SYT6-210ENST00000641643 KIAA1841Q6NSI8 718 aa24.48■■□□□ 1.51
SYT6-210ENST00000641643 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa24.48■■□□□ 1.51
SYT6-210ENST00000641643 ADAM28Q9UKQ2 775 aa24.48■■□□□ 1.51
SYT6-210ENST00000641643 MYH15Q9Y2K3 1946 aa24.48■■□□□ 1.51
SYT6-210ENST00000641643 MYMKA6NI61 221 aa24.47■■□□□ 1.51
SYT6-210ENST00000641643 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
SYT6-210ENST00000641643 RBM10P98175 930 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
SYT6-210ENST00000641643 COASYQ13057 564 aa24.47■■□□□ 1.51
SYT6-210ENST00000641643 PTPN14Q15678 1187 aa24.47■■□□□ 1.51
SYT6-210ENST00000641643 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa24.47■■□□□ 1.51
SYT6-210ENST00000641643 VN1R2Q8NFZ6 395 aa24.47■■□□□ 1.51
SYT6-210ENST00000641643 CASP10Q92851 521 aa24.47■■□□□ 1.51
SYT6-210ENST00000641643 MSLNLQ96KJ4 702 aa24.47■■□□□ 1.51
SYT6-210ENST00000641643 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa24.47■■□□□ 1.51
SYT6-210ENST00000641643 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa24.47■■□□□ 1.51
SYT6-210ENST00000641643 A0A087X0B3 334 aa24.46■■□□□ 1.51
SYT6-210ENST00000641643 C2CD2LO14523 706 aa24.46■■□□□ 1.51
SYT6-210ENST00000641643 ABLIM1O14639 778 aa24.46■■□□□ 1.51
SYT6-210ENST00000641643 MBTPS2O43462 519 aa24.46■■□□□ 1.51
SYT6-210ENST00000641643 NMT1P30419 496 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
SYT6-210ENST00000641643 FUT10Q6P4F1 479 aa24.46■■□□□ 1.51
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