RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637667.1

CLN6-222, Transcript of CLN6, transmembrane ER protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CLN6, Length 874 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6-222ENST00000637667 MTMR3Q13615 1198 aa22.14■■□□□ 1.13
CLN6-222ENST00000637667 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
CLN6-222ENST00000637667 IL17AQ16552 155 aa22.14■■□□□ 1.13
CLN6-222ENST00000637667 KRT79Q5XKE5 535 aa22.14■■□□□ 1.13
CLN6-222ENST00000637667 MCTP1Q6DN14 999 aa22.14■■□□□ 1.13
CLN6-222ENST00000637667 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa22.14■■□□□ 1.13
CLN6-222ENST00000637667 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa22.14■■□□□ 1.13
CLN6-222ENST00000637667 UBALD2Q8IYN6 164 aa22.14■■□□□ 1.13
CLN6-222ENST00000637667 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
CLN6-222ENST00000637667 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
CLN6-222ENST00000637667 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP22.14■■□□□ 1.13
CLN6-222ENST00000637667 CACNG4Q9UBN1 327 aa22.14■■□□□ 1.13
CLN6-222ENST00000637667 LIMD1Q9UGP4 676 aa22.14■■□□□ 1.13
CLN6-222ENST00000637667 DPP7Q9UHL4 492 aa22.14■■□□□ 1.13
CLN6-222ENST00000637667 MYO10Q9HD67 2058 aa22.14■■□□□ 1.13
CLN6-222ENST00000637667 CASTOR2A6NHX0 329 aa22.13■■□□□ 1.13
CLN6-222ENST00000637667 PP2D1A8MPX8 630 aa22.13■■□□□ 1.13
CLN6-222ENST00000637667 PTGESO14684 152 aa22.13■■□□□ 1.13
CLN6-222ENST00000637667 BRD1O95696 1058 aa22.13■■□□□ 1.13
CLN6-222ENST00000637667 ASGR2P07307 311 aa22.13■■□□□ 1.13
CLN6-222ENST00000637667 NHLH1Q02575 133 aa22.13■■□□□ 1.13
CLN6-222ENST00000637667 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa22.13■■□□□ 1.13
CLN6-222ENST00000637667 NT5DC1Q5TFE4 455 aa22.13■■□□□ 1.13
CLN6-222ENST00000637667 OTOP3Q7RTS5 596 aa22.13■■□□□ 1.13
CLN6-222ENST00000637667 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
CLN6-222ENST00000637667 TMX3Q96JJ7 454 aa22.13■■□□□ 1.13
CLN6-222ENST00000637667 PAAF1Q9BRP4 392 aa22.13■■□□□ 1.13
CLN6-222ENST00000637667 DNM3Q9UQ16 869 aa22.13■■□□□ 1.13
CLN6-222ENST00000637667 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP22.12■■□□□ 1.138e-9■■■■■ 155.1
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CLN6-222ENST00000637667 THP07101 528 aa22.12■■□□□ 1.13
CLN6-222ENST00000637667 DTHD1Q6ZMT9 781 aa22.12■■□□□ 1.13
CLN6-222ENST00000637667 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
CLN6-222ENST00000637667 CXCL16Q9H2A7 254 aa22.12■■□□□ 1.13
CLN6-222ENST00000637667 FNIP2Q9P278 1114 aa22.12■■□□□ 1.13
CLN6-222ENST00000637667 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
CLN6-222ENST00000637667 GDAQ9Y2T3 454 aa22.12■■□□□ 1.13
CLN6-222ENST00000637667 E9PMD0 336 aa22.11■■□□□ 1.13
CLN6-222ENST00000637667 C1RP00736 705 aa22.11■■□□□ 1.13
CLN6-222ENST00000637667 MYBP10242 640 aa22.11■■□□□ 1.13
CLN6-222ENST00000637667 CDC25AP30304 524 aa22.11■■□□□ 1.13
CLN6-222ENST00000637667 CREMQ03060 361 aa22.11■■□□□ 1.13
CLN6-222ENST00000637667 RILPL1Q5EBL4 403 aa22.11■■□□□ 1.13
CLN6-222ENST00000637667 IER5LQ5T953 404 aa22.11■■□□□ 1.13
CLN6-222ENST00000637667 ATF7IP2Q5U623 682 aa22.11■■□□□ 1.13
CLN6-222ENST00000637667 PALB2Q86YC2 1186 aa22.11■■□□□ 1.13
CLN6-222ENST00000637667 HDAC7Q8WUI4 952 aa22.11■■□□□ 1.13
CLN6-222ENST00000637667 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
CLN6-222ENST00000637667 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa22.11■■□□□ 1.13
CLN6-222ENST00000637667 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa22.1■■□□□ 1.13
CLN6-222ENST00000637667 CCDC169A6NNP5 214 aa22.1■■□□□ 1.13
CLN6-222ENST00000637667 K7ERI5 159 aa22.1■■□□□ 1.13
CLN6-222ENST00000637667 KIF4AO95239 1232 aa22.1■■□□□ 1.13
CLN6-222ENST00000637667 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
CLN6-222ENST00000637667 NPTX2P47972 431 aa22.1■■□□□ 1.13
CLN6-222ENST00000637667 PEX3P56589 373 aa22.1■■□□□ 1.13
CLN6-222ENST00000637667 NAB2Q15742 525 aa22.1■■□□□ 1.13
CLN6-222ENST00000637667 CYP26C1Q6V0L0 522 aa22.1■■□□□ 1.13
CLN6-222ENST00000637667 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
CLN6-222ENST00000637667 DAW1Q8N136 415 aa22.1■■□□□ 1.13
CLN6-222ENST00000637667 HASPINQ8TF76 798 aa22.1■■□□□ 1.13
CLN6-222ENST00000637667 RUSC1Q9BVN2 902 aa22.1■■□□□ 1.13
CLN6-222ENST00000637667 SMOC2Q9H3U7 446 aa22.1■■□□□ 1.13
CLN6-222ENST00000637667 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa22.1■■□□□ 1.13
CLN6-222ENST00000637667 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
CLN6-222ENST00000637667 WDFY4Q6ZS81 3184 aa22.09■■□□□ 1.13
CLN6-222ENST00000637667 TGM5O43548 720 aa22.09■■□□□ 1.13
CLN6-222ENST00000637667 HIP1RO75146 1068 aa22.09■■□□□ 1.13
CLN6-222ENST00000637667 RFPL2O75678 378 aa22.09■■□□□ 1.13
CLN6-222ENST00000637667 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
CLN6-222ENST00000637667 SPATA31D3P0C874 917 aa22.09■■□□□ 1.13
CLN6-222ENST00000637667 RPL17P18621 184 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
CLN6-222ENST00000637667 GJB2P29033 226 aa22.09■■□□□ 1.13
CLN6-222ENST00000637667 VCPP55072 806 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
CLN6-222ENST00000637667 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
CLN6-222ENST00000637667 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
CLN6-222ENST00000637667 RTP2Q5QGT7 225 aa22.09■■□□□ 1.13
CLN6-222ENST00000637667 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
CLN6-222ENST00000637667 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa22.09■■□□□ 1.13
CLN6-222ENST00000637667 KCNK18Q7Z418 384 aa22.09■■□□□ 1.13
CLN6-222ENST00000637667 GLYCTKQ8IVS8 523 aa22.09■■□□□ 1.13
CLN6-222ENST00000637667 PRSS33Q8NF86 280 aa22.09■■□□□ 1.13
CLN6-222ENST00000637667 PRRX2Q99811 253 aa22.09■■□□□ 1.13
CLN6-222ENST00000637667 TTPALQ9BTX7 342 aa22.09■■□□□ 1.13
CLN6-222ENST00000637667 TNFSF13BQ9Y275 285 aa22.09■■□□□ 1.13
CLN6-222ENST00000637667 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa22.08■■□□□ 1.13
CLN6-222ENST00000637667 H3BQV1 296 aa22.08■■□□□ 1.13
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CLN6-222ENST00000637667 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
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CLN6-222ENST00000637667 RINT1Q6NUQ1 792 aa22.08■■□□□ 1.13
CLN6-222ENST00000637667 LILRA6Q6PI73 481 aa22.08■■□□□ 1.13
CLN6-222ENST00000637667 C1orf186Q6ZWK4 172 aa22.08■■□□□ 1.13
CLN6-222ENST00000637667 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
CLN6-222ENST00000637667 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
CLN6-222ENST00000637667 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
CLN6-222ENST00000637667 DRC1Q96MC2 740 aa22.08■■□□□ 1.13
CLN6-222ENST00000637667 TMEM134Q9H6X4 195 aa22.08■■□□□ 1.13
CLN6-222ENST00000637667 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
CLN6-222ENST00000637667 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa22.08■■□□□ 1.13
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