RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 NDUFA8P51970 172 aa26.65■■□□□ 1.86
CAPNS1-216ENST00000628306 PPP4R3AQ6IN85 833 aa26.65■■□□□ 1.86
CAPNS1-216ENST00000628306 COLGALT2Q8IYK4 626 aa26.65■■□□□ 1.86
CAPNS1-216ENST00000628306 RPS6KC1Q96S38 1066 aa26.65■■□□□ 1.86
CAPNS1-216ENST00000628306 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa26.65■■□□□ 1.86
CAPNS1-216ENST00000628306 TNMDQ9H2S6 317 aa26.65■■□□□ 1.86
CAPNS1-216ENST00000628306 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
CAPNS1-216ENST00000628306 STK39Q9UEW8 545 aa26.65■■□□□ 1.86
CAPNS1-216ENST00000628306 FAN1Q9Y2M0 1017 aa26.65■■□□□ 1.86
CAPNS1-216ENST00000628306 A0A1B0GVL5 298 aa26.64■■□□□ 1.86
CAPNS1-216ENST00000628306 F8W810 466 aa26.64■■□□□ 1.86
CAPNS1-216ENST00000628306 WNT7AO00755 349 aa26.64■■□□□ 1.86
CAPNS1-216ENST00000628306 TEX28O15482 410 aa26.64■■□□□ 1.86
CAPNS1-216ENST00000628306 ALDH2P05091 517 aa26.64■■□□□ 1.86
CAPNS1-216ENST00000628306 PFKFB1P16118 471 aa26.64■■□□□ 1.86
CAPNS1-216ENST00000628306 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa26.64■■□□□ 1.86
CAPNS1-216ENST00000628306 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
CAPNS1-216ENST00000628306 KIAA0319Q5VV43 1072 aa26.64■■□□□ 1.86
CAPNS1-216ENST00000628306 HAS1Q92839 578 aa26.64■■□□□ 1.86
CAPNS1-216ENST00000628306 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa26.64■■□□□ 1.86
CAPNS1-216ENST00000628306 RNF39Q9H2S5 420 aa26.64■■□□□ 1.86
CAPNS1-216ENST00000628306 MAN1C1Q9NR34 630 aa26.64■■□□□ 1.86
CAPNS1-216ENST00000628306 KANSL3Q9P2N6 904 aa26.64■■□□□ 1.86
CAPNS1-216ENST00000628306 CACNA1AO00555 2505 aa26.63■■□□□ 1.85
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF202O95125 648 aa26.63■■□□□ 1.85
CAPNS1-216ENST00000628306 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa26.63■■□□□ 1.85
CAPNS1-216ENST00000628306 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
CAPNS1-216ENST00000628306 DSC1Q08554 894 aa26.63■■□□□ 1.85
CAPNS1-216ENST00000628306 POTEGQ6S5H5 508 aa26.63■■□□□ 1.85
CAPNS1-216ENST00000628306 GAS2L3Q86XJ1 694 aa26.63■■□□□ 1.85
CAPNS1-216ENST00000628306 RSAD2Q8WXG1 361 aa26.63■■□□□ 1.85
CAPNS1-216ENST00000628306 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
CAPNS1-216ENST00000628306 CEP170P1Q96L14 293 aa26.63■■□□□ 1.85
CAPNS1-216ENST00000628306 CLIC6Q96NY7 704 aa26.63■■□□□ 1.85
CAPNS1-216ENST00000628306 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
CAPNS1-216ENST00000628306 RXFP1Q9HBX9 757 aa26.63■■□□□ 1.85
CAPNS1-216ENST00000628306 MIOSQ9NXC5 875 aa26.63■■□□□ 1.85
CAPNS1-216ENST00000628306 ARID2Q68CP9 1835 aa26.63■■□□□ 1.85
CAPNS1-216ENST00000628306 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
CAPNS1-216ENST00000628306 C2CD2LO14523 706 aa26.62■■□□□ 1.85
CAPNS1-216ENST00000628306 ZBTB39O15060 712 aa26.62■■□□□ 1.85
CAPNS1-216ENST00000628306 P4HBP07237 508 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
CAPNS1-216ENST00000628306 MCM7P33993 719 aa26.62■■□□□ 1.85
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CAPNS1-216ENST00000628306 SYKP43405 635 aa26.62■■□□□ 1.85
CAPNS1-216ENST00000628306 SIX5Q8N196 739 aa26.62■■□□□ 1.85
CAPNS1-216ENST00000628306 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC7A3Q8WY07 619 aa26.62■■□□□ 1.85
CAPNS1-216ENST00000628306 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
CAPNS1-216ENST00000628306 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
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CAPNS1-216ENST00000628306 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
CAPNS1-216ENST00000628306 PPME1Q9Y570 386 aa26.62■■□□□ 1.85
CAPNS1-216ENST00000628306 KRBA1A5PL33 1030 aa26.61■■□□□ 1.85
CAPNS1-216ENST00000628306 SPIRE1Q08AE8 756 aa26.61■■□□□ 1.85
CAPNS1-216ENST00000628306 C4orf19Q8IY42 314 aa26.61■■□□□ 1.85
CAPNS1-216ENST00000628306 DTWD2Q8NBA8 298 aa26.61■■□□□ 1.85
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM20AQ96MK3 541 aa26.61■■□□□ 1.85
CAPNS1-216ENST00000628306 MYADMQ96S97 322 aa26.61■■□□□ 1.85
CAPNS1-216ENST00000628306 FUCA2Q9BTY2 467 aa26.61■■□□□ 1.85
CAPNS1-216ENST00000628306 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa26.61■■□□□ 1.85
CAPNS1-216ENST00000628306 IGSF9Q9P2J2 1179 aa26.61■■□□□ 1.85
CAPNS1-216ENST00000628306 IPPQ9Y573 584 aa26.61■■□□□ 1.85
CAPNS1-216ENST00000628306 MYH15Q9Y2K3 1946 aa26.61■■□□□ 1.85
CAPNS1-216ENST00000628306 TSPAN1O60635 241 aa26.6■■□□□ 1.85
CAPNS1-216ENST00000628306 RFPL2O75678 378 aa26.6■■□□□ 1.85
CAPNS1-216ENST00000628306 RFC5P40937 340 aa26.6■■□□□ 1.85
CAPNS1-216ENST00000628306 ANGPT1Q15389 498 aa26.6■■□□□ 1.85
CAPNS1-216ENST00000628306 CSRNP2Q9H175 543 aa26.6■■□□□ 1.85
CAPNS1-216ENST00000628306 RGL1Q9NZL6 768 aa26.6■■□□□ 1.85
CAPNS1-216ENST00000628306 EPS15L1Q9UBC2 864 aa26.6■■□□□ 1.85
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CAPNS1-216ENST00000628306 ARL5CA6NH57 179 aa26.59■■□□□ 1.85
CAPNS1-216ENST00000628306 URODP06132 367 aa26.59■■□□□ 1.85
CAPNS1-216ENST00000628306 FOXK2Q01167 660 aa26.59■■□□□ 1.85
CAPNS1-216ENST00000628306 EMC2Q15006 297 aa26.59■■□□□ 1.85
CAPNS1-216ENST00000628306 DTHD1Q6ZMT9 781 aa26.59■■□□□ 1.85
CAPNS1-216ENST00000628306 ADSSL1Q8N142 457 aa26.59■■□□□ 1.85
CAPNS1-216ENST00000628306 RNF149Q8NC42 400 aa26.59■■□□□ 1.85
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
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CAPNS1-216ENST00000628306 RTP3Q9BQQ7 232 aa26.59■■□□□ 1.85
CAPNS1-216ENST00000628306 LXNQ9BS40 222 aa26.59■■□□□ 1.85
CAPNS1-216ENST00000628306 TSPY26PQ9H489 355 aa26.59■■□□□ 1.85
CAPNS1-216ENST00000628306 CHST7Q9NS84 486 aa26.59■■□□□ 1.85
CAPNS1-216ENST00000628306 HES2Q9Y543 173 aa26.59■■□□□ 1.85
CAPNS1-216ENST00000628306 MYBP10242 640 aa26.58■■□□□ 1.85
CAPNS1-216ENST00000628306 YWHABP31946 246 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
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CAPNS1-216ENST00000628306 EPHA7Q15375 998 aa26.58■■□□□ 1.85
CAPNS1-216ENST00000628306 AMHR2Q16671 573 aa26.58■■□□□ 1.85
CAPNS1-216ENST00000628306 GSTCDQ8NEC7 633 aa26.58■■□□□ 1.85
CAPNS1-216ENST00000628306 AK8Q96MA6 479 aa26.58■■□□□ 1.85
CAPNS1-216ENST00000628306 ZFP42Q96MM3 310 aa26.58■■□□□ 1.85
CAPNS1-216ENST00000628306 WNT16Q9UBV4 365 aa26.58■■□□□ 1.85
CAPNS1-216ENST00000628306 CLUHO75153 1309 aa26.58■■□□□ 1.85
CAPNS1-216ENST00000628306 SPDYE4A6NLX3 237 aa26.58■■□□□ 1.84
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