RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623297.1

CU639417.6-201, humanhuman

TSL 2

Gene CU639417.6, Length 3,013 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CU639417.6-201ENST00000623297 CYP4X1Q8N118 509 aa15.95■□□□□ 0.14
CU639417.6-201ENST00000623297 ETNPPLQ8TBG4 499 aa15.95■□□□□ 0.14
CU639417.6-201ENST00000623297 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
CU639417.6-201ENST00000623297 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
CU639417.6-201ENST00000623297 GAS7O60861 476 aa15.95■□□□□ 0.14
CU639417.6-201ENST00000623297 DLATP10515 647 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
CU639417.6-201ENST00000623297 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
CU639417.6-201ENST00000623297 LMNB1P20700 586 aa15.95■□□□□ 0.14
CU639417.6-201ENST00000623297 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
CU639417.6-201ENST00000623297 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
CU639417.6-201ENST00000623297 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
CU639417.6-201ENST00000623297 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
CU639417.6-201ENST00000623297 HOMER3Q9NSC5 361 aa15.95■□□□□ 0.14
CU639417.6-201ENST00000623297 hCG_1984214I3L0E3 225 aa15.94■□□□□ 0.14
CU639417.6-201ENST00000623297 PDXKO00764 312 aa15.94■□□□□ 0.14
CU639417.6-201ENST00000623297 CCND1P24385 295 aa15.94■□□□□ 0.14
CU639417.6-201ENST00000623297 SMARCA1P28370 1054 aa15.94■□□□□ 0.14
CU639417.6-201ENST00000623297 NPEPPSP55786 919 aa15.94■□□□□ 0.14
CU639417.6-201ENST00000623297 SPIRE1Q08AE8 756 aa15.94■□□□□ 0.14
CU639417.6-201ENST00000623297 ABCB5Q2M3G0 1257 aa15.94■□□□□ 0.14
CU639417.6-201ENST00000623297 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa15.94■□□□□ 0.14
CU639417.6-201ENST00000623297 FOXR2Q6PJQ5 311 aa15.94■□□□□ 0.14
CU639417.6-201ENST00000623297 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
CU639417.6-201ENST00000623297 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
CU639417.6-201ENST00000623297 PPM1KQ8N3J5 372 aa15.94■□□□□ 0.14
CU639417.6-201ENST00000623297 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
CU639417.6-201ENST00000623297 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
CU639417.6-201ENST00000623297 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP15.94■□□□□ 0.14
CU639417.6-201ENST00000623297 BRAFP15056 766 aa15.94■□□□□ 0.14
CU639417.6-201ENST00000623297 FMO5P49326 533 aa15.94■□□□□ 0.14
CU639417.6-201ENST00000623297 GRIK3Q13003 919 aa15.94■□□□□ 0.14
CU639417.6-201ENST00000623297 GALNTL6Q49A17 601 aa15.94■□□□□ 0.14
CU639417.6-201ENST00000623297 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa15.94■□□□□ 0.14
CU639417.6-201ENST00000623297 CPXCR1Q8N123 301 aa15.94■□□□□ 0.14
CU639417.6-201ENST00000623297 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
CU639417.6-201ENST00000623297 ATG4AQ8WYN0 398 aa15.94■□□□□ 0.14
CU639417.6-201ENST00000623297 ZDHHC15Q96MV8 337 aa15.94■□□□□ 0.14
CU639417.6-201ENST00000623297 GPR88Q9GZN0 384 aa15.94■□□□□ 0.14
CU639417.6-201ENST00000623297 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
CU639417.6-201ENST00000623297 STX2P32856 288 aa15.94■□□□□ 0.14
CU639417.6-201ENST00000623297 SSR1P43307 286 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
CU639417.6-201ENST00000623297 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
CU639417.6-201ENST00000623297 ATP11AP98196 1134 aa15.94■□□□□ 0.14
CU639417.6-201ENST00000623297 GRIPAP1Q4V328 841 aa15.94■□□□□ 0.14
CU639417.6-201ENST00000623297 ACER1Q8TDN7 264 aa15.94■□□□□ 0.14
CU639417.6-201ENST00000623297 SPOCK2Q92563 424 aa15.94■□□□□ 0.14
CU639417.6-201ENST00000623297 SAAL1Q96ER3 474 aa15.94■□□□□ 0.14
CU639417.6-201ENST00000623297 PARVGQ9HBI0 331 aa15.94■□□□□ 0.14
CU639417.6-201ENST00000623297 FBXO28Q9NVF7 368 aa15.94■□□□□ 0.14
CU639417.6-201ENST00000623297 USP20Q9Y2K6 914 aa15.94■□□□□ 0.14
CU639417.6-201ENST00000623297 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
CU639417.6-201ENST00000623297 SPOPO43791 374 aa15.93■□□□□ 0.14
CU639417.6-201ENST00000623297 TARSP26639 723 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
CU639417.6-201ENST00000623297 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
CU639417.6-201ENST00000623297 HYIQ5T013 277 aa15.93■□□□□ 0.14
CU639417.6-201ENST00000623297 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa15.93■□□□□ 0.14
CU639417.6-201ENST00000623297 CGB2Q6NT52 195 aa15.93■□□□□ 0.14
CU639417.6-201ENST00000623297 CCHCR1Q8TD31 782 aa15.93■□□□□ 0.14
CU639417.6-201ENST00000623297 LENG9Q96B70 501 aa15.93■□□□□ 0.14
CU639417.6-201ENST00000623297 STK33Q9BYT3 514 aa15.93■□□□□ 0.14
CU639417.6-201ENST00000623297 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
CU639417.6-201ENST00000623297 INTUQ9ULD6 942 aa15.93■□□□□ 0.14
CU639417.6-201ENST00000623297 A0A1W2PRG0 241 aa15.93■□□□□ 0.14
CU639417.6-201ENST00000623297 K7ENM7 598 aa15.93■□□□□ 0.14
CU639417.6-201ENST00000623297 OAS1P00973 400 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
CU639417.6-201ENST00000623297 RARGP13631 454 aa15.93■□□□□ 0.14
CU639417.6-201ENST00000623297 CHRNA3P32297 505 aa15.93■□□□□ 0.14
CU639417.6-201ENST00000623297 MYL7Q01449 175 aa15.93■□□□□ 0.14
CU639417.6-201ENST00000623297 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
CU639417.6-201ENST00000623297 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
CU639417.6-201ENST00000623297 SYDE2Q5VT97 1194 aa15.93■□□□□ 0.14
CU639417.6-201ENST00000623297 ZNF449Q6P9G9 518 aa15.93■□□□□ 0.14
CU639417.6-201ENST00000623297 ANKLE1Q8NAG6 615 aa15.93■□□□□ 0.14
CU639417.6-201ENST00000623297 ARHGEF3Q9NR81 526 aa15.93■□□□□ 0.14
CU639417.6-201ENST00000623297 ASIC3Q9UHC3 531 aa15.93■□□□□ 0.14
CU639417.6-201ENST00000623297 KCNG1Q9UIX4 513 aa15.93■□□□□ 0.14
CU639417.6-201ENST00000623297 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa15.93■□□□□ 0.14
CU639417.6-201ENST00000623297 CLDN3O15551 220 aa15.92■□□□□ 0.14
CU639417.6-201ENST00000623297 SLITRK3O94933 977 aa15.92■□□□□ 0.14
CU639417.6-201ENST00000623297 ARP10275 920 aa15.92■□□□□ 0.14
CU639417.6-201ENST00000623297 ALADP13716 330 aa15.92■□□□□ 0.14
CU639417.6-201ENST00000623297 SARNPP82979 210 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
CU639417.6-201ENST00000623297 CALCOCO2Q13137 446 aa15.92■□□□□ 0.14
CU639417.6-201ENST00000623297 GNPTABQ3T906 1256 aa15.92■□□□□ 0.14
CU639417.6-201ENST00000623297 PPP1R18Q6NYC8 613 aa15.92■□□□□ 0.14
CU639417.6-201ENST00000623297 CAPN12Q6ZSI9 719 aa15.92■□□□□ 0.14
CU639417.6-201ENST00000623297 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
CU639417.6-201ENST00000623297 SIAH1Q8IUQ4 282 aa15.92■□□□□ 0.14
CU639417.6-201ENST00000623297 SPIRE2Q8WWL2 714 aa15.92■□□□□ 0.14
CU639417.6-201ENST00000623297 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
CU639417.6-201ENST00000623297 SGIP1Q9BQI5 828 aa15.92■□□□□ 0.14
CU639417.6-201ENST00000623297 WDR18Q9BV38 432 aa15.92■□□□□ 0.14
CU639417.6-201ENST00000623297 KIFC3Q9BVG8 833 aa15.92■□□□□ 0.14
CU639417.6-201ENST00000623297 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa15.92■□□□□ 0.14
CU639417.6-201ENST00000623297 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
CU639417.6-201ENST00000623297 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
CU639417.6-201ENST00000623297 HAO1Q9UJM8 370 aa15.92■□□□□ 0.14
CU639417.6-201ENST00000623297 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa15.92■□□□□ 0.14
CU639417.6-201ENST00000623297 NCANO14594 1321 aa15.92■□□□□ 0.14
CU639417.6-201ENST00000623297 EMSYQ7Z589 1322 aa15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.5 ms