RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619785.1

SENP3-210, Transcript of SUMO specific peptidase 3, humanhuman

TSL 3

Gene SENP3, Length 634 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3-210ENST00000619785 EFHBQ8N7U6 833 aa8.44□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa8.44□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 C7orf31Q8N865 590 aa8.44□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 ECHDC1Q9NTX5 307 aa8.44□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 COL20A1Q9P218 1284 aa8.44□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 KLHL3Q9UH77 587 aa8.44□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 ZMYM5Q9UJ78 669 aa8.44□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 STX8Q9UNK0 236 aa8.44□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 ZMYM6O95789 1325 aa8.44□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa8.44□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 NCOR2Q9Y618 2525 aa8.43□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 PTPDC1A2A3K4 754 aa8.43□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 PRR23AA6NEV1 266 aa8.43□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 CCER2I3L3R5 266 aa8.43□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 FSCN2O14926 492 aa8.43□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 MARCH6O60337 910 aa8.43□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 NMT2O60551 498 aa8.43□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 ECEL1O95672 775 aa8.43□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 GLP2RO95838 553 aa8.43□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 TOP1P11387 765 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 NME1P15531 152 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 CALML3P27482 149 aa8.43□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 VCPP55072 806 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 ZNF543Q08ER8 600 aa8.43□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 IKQ13123 557 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 KCNC3Q14003 757 aa8.43□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 ALX1Q15699 326 aa8.43□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 LY6KQ17RY6 165 aa8.43□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa8.43□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa8.43□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 UNC5AQ6ZN44 842 aa8.43□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 MYOCDQ8IZQ8 938 aa8.43□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 SYNPOQ8N3V7 929 aa8.43□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 ATP8B4Q8TF62 1192 aa8.43□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 SEPT8Q92599 483 aa8.43□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 YME1L1Q96TA2 773 aa8.43□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 MDFIQ99750 246 aa8.43□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 FSD1Q9BTV5 496 aa8.43□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 USP26Q9BXU7 913 aa8.43□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 NACAP1Q9BZK3 213 aa8.43□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 WDR81Q562E7 1941 aa8.42□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 ACACBO00763 2458 aa8.42□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 SLC22A31A6NKX4 558 aa8.42□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 LINC01565O15544 149 aa8.42□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 LILRB5O75023 590 aa8.42□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 ASMTLO95671 621 aa8.42□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 PGRP06401 933 aa8.42□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 SLFN14P0C7P3 912 aa8.42□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 TGFB3P10600 412 aa8.42□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 LIG1P18858 919 aa8.42□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 NT5C2P49902 561 aa8.42□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 RRP1P56182 461 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 STXBP2Q15833 593 aa8.42□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 KCNV1Q6PIU1 500 aa8.42□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 ASCL5Q7RTU5 278 aa8.42□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 TICAM2Q86XR7 235 aa8.42□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 WFDC8Q8IUA0 241 aa8.42□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa8.42□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 IL17RAQ96F46 866 aa8.42□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 TTC14Q96N46 770 aa8.42□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 TMEM47Q9BQJ4 181 aa8.42□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 LRRCC1Q9C099 1032 aa8.42□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 PLAGL2Q9UPG8 496 aa8.42□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 ABCB11O95342 1321 aa8.41□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 FSD2A1L4K1 749 aa8.41□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 TSPY2A6NKD2 308 aa8.41□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 DGKIO75912 1065 aa8.41□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 SLC16A2P36021 539 aa8.41□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 HSD17B4P51659 736 aa8.41□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 ETF1P62495 437 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 GAS6Q14393 721 aa8.41□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 PTPN21Q16825 1174 aa8.41□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 HSDL1Q3SXM5 330 aa8.41□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 STK11IPQ8N1F8 1099 aa8.41□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 FIBCD1Q8N539 461 aa8.41□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 SAMD3Q8N6K7 520 aa8.41□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 KLHL23Q8NBE8 558 aa8.41□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 NAPBQ9H115 298 aa8.41□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 CNNM2Q9H8M5 875 aa8.41□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 DDX19BQ9UMR2 479 aa8.41□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 FRMPD4Q14CM0 1322 aa8.4□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 TTC41PQ6P2S7 1318 aa8.4□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 ZNF862O60290 1169 aa8.4□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 ZNF286BP0CG31 522 aa8.4□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 PCP11498 1178 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.9 ms