RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592408.5

EFTUD2-222, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 561 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-222ENST00000592408 GTF2BQ00403 316 aa9.94□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC7A5Q01650 507 aa9.94□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 CXCL9Q07325 125 aa9.94□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 PGM5Q15124 567 aa9.94□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 TCEAL1Q15170 157 aa9.94□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 NR6A1Q15406 480 aa9.94□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 ARHGEF16Q5VV41 709 aa9.94□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 C11orf63Q6NUN7 778 aa9.94□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 RASGEF1CQ8N431 466 aa9.94□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 UBL4BQ8N7F7 174 aa9.94□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC30A5Q8TAD4 765 aa9.94□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 MORC4Q8TE76 937 aa9.94□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 MS4A14Q96JA4 679 aa9.94□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 SH3GL2Q99962 352 aa9.94□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 RAB17Q9H0T7 212 aa9.94□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 EPB41L5Q9HCM4 733 aa9.94□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa9.94□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 HSPBP1Q9NZL4 362 aa9.94□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 PIM2Q9P1W9 311 aa9.94□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 PGAP2Q9UHJ9 254 aa9.94□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 RASAL2Q9UJF2 1139 aa9.94□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 TMEM59LQ9UK28 342 aa9.94□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 DOCK1Q14185 1865 aa9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 EMSYQ7Z589 1322 aa9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 PHF20L1A8MW92 1017 aa9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 KRIT1O00522 736 aa9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 DHX15O43143 795 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 VCAM1P19320 739 aa9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 GTF2H1P32780 548 aa9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 GALCP54803 685 aa9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 MFAP3P55082 362 aa9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 TGFB2P61812 414 aa9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 COG2Q14746 738 aa9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 CBWD6Q4V339 395 aa9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 EPC2Q52LR7 807 aa9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 XKR9Q5GH70 373 aa9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 CBWD3Q5JTY5 395 aa9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 CBWD5Q5RIA9 395 aa9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 LRIG3Q6UXM1 1119 aa9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 HAUS6Q7Z4H7 955 aa9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 GLYCTKQ8IVS8 523 aa9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 KLHL7Q8IXQ5 586 aa9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 CPXCR1Q8N123 301 aa9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 DAW1Q8N136 415 aa9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 MCPH1Q8NEM0 835 aa9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 SCFD2Q8WU76 684 aa9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 HDAC7Q8WUI4 952 aa9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 IFT81Q8WYA0 676 aa9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 HES6Q96HZ4 224 aa9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 RUNDC3BQ96NL0 473 aa9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 RMDN3Q96TC7 470 aa9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 AGPAT1Q99943 283 aa9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 SENP7Q9BQF6 1050 aa9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 ISCUQ9H1K1 167 aa9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 CARD9Q9H257 536 aa9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 PXMP2Q9NR77 195 aa9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 PICK1Q9NRD5 415 aa9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 FAM114A2Q9NRY5 505 aa9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 EHD2Q9NZN4 543 aa9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 COL20A1Q9P218 1284 aa9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 USP20Q9Y2K6 914 aa9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 RAD51CO43502 376 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 GGPS1O95749 300 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 PSAPP07602 524 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 GYS2P54840 703 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 RTP1P59025 263 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 RPS6P62753 249 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 PLS1Q14651 629 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 GNPTABQ3T906 1256 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 FAM102BQ5T8I3 360 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 GJB7Q6PEY0 223 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC30A10Q6XR72 485 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 NT5DC3Q86UY8 548 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 MAP4K3Q8IVH8 894 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 CD302Q8IX05 232 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 CCDC116Q8IYX3 515 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 SCYL3Q8IZE3 742 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 METTL13Q8N6R0 699 aa9.92□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 90.8 ms