RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586851.5

CAPNS1-202, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 616 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-202ENST00000586851 ENTPD3O75355 529 aa8.25□□□□□ -1.09
CAPNS1-202ENST00000586851 PSMD10O75832 226 aa8.25□□□□□ -1.09
CAPNS1-202ENST00000586851 ANP32DO95626 131 aa8.25□□□□□ -1.09
CAPNS1-202ENST00000586851 RARAP10276 462 aa8.25□□□□□ -1.09
CAPNS1-202ENST00000586851 NEFHP12036 1026 aa8.25□□□□□ -1.09
CAPNS1-202ENST00000586851 BMP3P12645 472 aa8.25□□□□□ -1.09
CAPNS1-202ENST00000586851 BRAFP15056 766 aa8.25□□□□□ -1.09
CAPNS1-202ENST00000586851 COMTP21964 271 aa8.25□□□□□ -1.09
CAPNS1-202ENST00000586851 CASP4P49662 377 aa8.25□□□□□ -1.09
CAPNS1-202ENST00000586851 GCNT1Q02742 428 aa8.25□□□□□ -1.09
CAPNS1-202ENST00000586851 TAP1Q03518 808 aa8.25□□□□□ -1.09
CAPNS1-202ENST00000586851 MCL1Q07820 350 aa8.25□□□□□ -1.09
CAPNS1-202ENST00000586851 NAA25Q14CX7 972 aa8.25□□□□□ -1.09
CAPNS1-202ENST00000586851 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
CAPNS1-202ENST00000586851 LIN9Q5TKA1 542 aa8.25□□□□□ -1.09
CAPNS1-202ENST00000586851 NUGGCQ68CJ6 796 aa8.25□□□□□ -1.09
CAPNS1-202ENST00000586851 ACAD10Q6JQN1 1059 aa8.25□□□□□ -1.09
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF365Q70YC5 407 aa8.25□□□□□ -1.09
CAPNS1-202ENST00000586851 OTOP1Q7RTM1 612 aa8.25□□□□□ -1.09
CAPNS1-202ENST00000586851 FAM160B2Q86V87 743 aa8.25□□□□□ -1.09
CAPNS1-202ENST00000586851 EXOC3L1Q86VI1 746 aa8.25□□□□□ -1.09
CAPNS1-202ENST00000586851 FAM228AQ86W67 206 aa8.25□□□□□ -1.09
CAPNS1-202ENST00000586851 BANK1Q8NDB2 785 aa8.25□□□□□ -1.09
CAPNS1-202ENST00000586851 RDM1Q8NG50 284 aa8.25□□□□□ -1.09
CAPNS1-202ENST00000586851 LMO3Q8TAP4 145 aa8.25□□□□□ -1.09
CAPNS1-202ENST00000586851 EPS8L1Q8TE68 723 aa8.25□□□□□ -1.09
CAPNS1-202ENST00000586851 CHURC1Q8WUH1 139 aa8.25□□□□□ -1.09
CAPNS1-202ENST00000586851 NSMCE1Q8WV22 266 aa8.25□□□□□ -1.09
CAPNS1-202ENST00000586851 C18orf8Q96DM3 657 aa8.25□□□□□ -1.09
CAPNS1-202ENST00000586851 TBC1D31Q96DN5 1066 aa8.25□□□□□ -1.09
CAPNS1-202ENST00000586851 NT5C1BQ96P26 610 aa8.25□□□□□ -1.09
CAPNS1-202ENST00000586851 TRIM31Q9BZY9 425 aa8.25□□□□□ -1.09
CAPNS1-202ENST00000586851 VCXQ9H320 206 aa8.25□□□□□ -1.09
CAPNS1-202ENST00000586851 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
CAPNS1-202ENST00000586851 SEMA4AQ9H3S1 761 aa8.25□□□□□ -1.09
CAPNS1-202ENST00000586851 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa8.25□□□□□ -1.09
CAPNS1-202ENST00000586851 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
CAPNS1-202ENST00000586851 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
CAPNS1-202ENST00000586851 ASIC3Q9UHC3 531 aa8.25□□□□□ -1.09
CAPNS1-202ENST00000586851 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa8.25□□□□□ -1.09
CAPNS1-202ENST00000586851 ANAPC5Q9UJX4 755 aa8.25□□□□□ -1.09
CAPNS1-202ENST00000586851 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
CAPNS1-202ENST00000586851 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa8.24□□□□□ -1.09
CAPNS1-202ENST00000586851 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa8.24□□□□□ -1.09
CAPNS1-202ENST00000586851 TCP11X1B4DZS4 312 aa8.24□□□□□ -1.09
CAPNS1-202ENST00000586851 USP17L15C9J2P7 530 aa8.24□□□□□ -1.09
CAPNS1-202ENST00000586851 USP17L13C9JLJ4 530 aa8.24□□□□□ -1.09
CAPNS1-202ENST00000586851 USP17L11C9JVI0 530 aa8.24□□□□□ -1.09
CAPNS1-202ENST00000586851 USP17L18D6R9N7 530 aa8.24□□□□□ -1.09
CAPNS1-202ENST00000586851 USP17L22D6RA61 530 aa8.24□□□□□ -1.09
CAPNS1-202ENST00000586851 USP17L17D6RBQ6 530 aa8.24□□□□□ -1.09
CAPNS1-202ENST00000586851 USP17L19D6RCP7 530 aa8.24□□□□□ -1.09
CAPNS1-202ENST00000586851 USP17L20D6RJB6 530 aa8.24□□□□□ -1.09
CAPNS1-202ENST00000586851 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
CAPNS1-202ENST00000586851 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
CAPNS1-202ENST00000586851 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
CAPNS1-202ENST00000586851 OPLAHO14841 1288 aa8.24□□□□□ -1.09
CAPNS1-202ENST00000586851 UBOX5O94941 541 aa8.24□□□□□ -1.09
CAPNS1-202ENST00000586851 SHBGP04278 402 aa8.24□□□□□ -1.09
CAPNS1-202ENST00000586851 GSTA2P09210 222 aa8.24□□□□□ -1.09
CAPNS1-202ENST00000586851 POLR2MP0CAP2 368 aa8.24□□□□□ -1.09
CAPNS1-202ENST00000586851 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP8.24□□□□□ -1.09
CAPNS1-202ENST00000586851 PHBP35232 272 aa8.24□□□□□ -1.09
CAPNS1-202ENST00000586851 PTPN7P35236 360 aa8.24□□□□□ -1.09
CAPNS1-202ENST00000586851 GCKP35557 465 aa8.24□□□□□ -1.09
CAPNS1-202ENST00000586851 GPC3P51654 580 aa8.24□□□□□ -1.09
CAPNS1-202ENST00000586851 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
CAPNS1-202ENST00000586851 KRT17Q04695 432 aa8.24□□□□□ -1.09
CAPNS1-202ENST00000586851 USP17L24Q0WX57 530 aa8.24□□□□□ -1.09
CAPNS1-202ENST00000586851 MYO1EQ12965 1108 aa8.24□□□□□ -1.09
CAPNS1-202ENST00000586851 BLMHQ13867 455 aa8.24□□□□□ -1.09
CAPNS1-202ENST00000586851 LBRQ14739 615 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
CAPNS1-202ENST00000586851 VPS72Q15906 364 aa8.24□□□□□ -1.09
CAPNS1-202ENST00000586851 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa8.24□□□□□ -1.09
CAPNS1-202ENST00000586851 CEP55Q53EZ4 464 aa8.24□□□□□ -1.09
CAPNS1-202ENST00000586851 LRRC38Q5VT99 294 aa8.24□□□□□ -1.09
CAPNS1-202ENST00000586851 WDR78Q5VTH9 848 aa8.24□□□□□ -1.09
CAPNS1-202ENST00000586851 KRT39Q6A163 491 aa8.24□□□□□ -1.09
CAPNS1-202ENST00000586851 USP17L6PQ6QN14 398 aa8.24□□□□□ -1.09
CAPNS1-202ENST00000586851 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa8.24□□□□□ -1.09
CAPNS1-202ENST00000586851 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
CAPNS1-202ENST00000586851 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
CAPNS1-202ENST00000586851 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
CAPNS1-202ENST00000586851 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
CAPNS1-202ENST00000586851 SMC1BQ8NDV3 1235 aa8.24□□□□□ -1.09
CAPNS1-202ENST00000586851 GLG1Q92896 1179 aa8.24□□□□□ -1.09
CAPNS1-202ENST00000586851 KCNN1Q92952 543 aa8.24□□□□□ -1.09
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF653Q96CK0 615 aa8.24□□□□□ -1.09
CAPNS1-202ENST00000586851 ARHGEF26Q96DR7 871 aa8.24□□□□□ -1.09
CAPNS1-202ENST00000586851 SAAL1Q96ER3 474 aa8.24□□□□□ -1.09
CAPNS1-202ENST00000586851 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
CAPNS1-202ENST00000586851 LRRC37BQ96QE4 947 aa8.24□□□□□ -1.09
CAPNS1-202ENST00000586851 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
CAPNS1-202ENST00000586851 RUSC1Q9BVN2 902 aa8.24□□□□□ -1.09
CAPNS1-202ENST00000586851 NUP85Q9BW27 656 aa8.24□□□□□ -1.09
CAPNS1-202ENST00000586851 PITPNM3Q9BZ71 974 aa8.24□□□□□ -1.09
CAPNS1-202ENST00000586851 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
CAPNS1-202ENST00000586851 CCDC113Q9H0I3 377 aa8.24□□□□□ -1.09
CAPNS1-202ENST00000586851 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
CAPNS1-202ENST00000586851 DNAJC18Q9H819 358 aa8.24□□□□□ -1.09
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